Projects funded by the NCN

Genome assembly algorithms for genetic disorders diagnosis

Call: PRELUDIUM 17 , Panel: ST6

Principal investigator: Barbara Poszewiecka

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Analysis and compression of data from the third generation of sequencing instruments

Call: OPUS 17 , Panel: ST6

Principal investigator: prof. Sebastian Deorowicz

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Spatio-temporal dynamics of genome-wide diversity of Fagus sylvatica

Call: BEETHOVEN LIFE 1 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Jarosław Burczyk

Uniwersytet Kazimierza Wielkiego, Wydział Nauk Biologicznych

Influenza virus A (IAV) on Polish pig farms: epidemiology, monitoring and genetic diversity

Call: OPUS 15 , Panel: NZ7

Principal investigator: prof. Tomasz Stadejek

Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie, Instytut Medycyny Weterynaryjnej

Development and application of interacting molecules prediction methods based on sequence coevolution.

Call: PRELUDIUM 15 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Aleksandra Jarmolińska

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Prediction of protein and peptide isoelectric point based on sequence and structure features

Call: OPUS 15 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Łukasz Kozłowski

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Sooty moulds on ornamental woody plants in urban environments - diagnostics of causal agents of disease based on innovat...

Call: OPUS 14 , Panel: NZ9

Principal investigator: dr hab. Marcin Piątek

Instytut Botaniki im. Władysława Szafera Polskiej Akademii Nauk

The CMGE helicase-polimerase complex a factor integrating the regulation of cell cyle progression and DNA replication

Call: HARMONIA 9 , Panel: NZ3

Principal investigator: dr Michał Dmowski

Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk

Contribution of gene copy number polymorphism to natural variation in response of Arabidopsis thaliana ecotypes to bioti...

Call: SONATA 13 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr hab. Agnieszka Żmieńko

Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk

Compression of large-scale genomic data collections

Call: OPUS 13 , Panel: ST6

Principal investigator: prof. Sebastian Deorowicz

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Developement of new methods for designing RNA molecules that fold into desired spatial structures and their use for deve...

Call: OPUS 13 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Janusz Bujnicki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Genome sequencing and biochemical and physiological characterization of the new bacterial strain of Enterobacter sp. LU1

Call: PRELUDIUM 13 , Panel: NZ9

Principal investigator: Hubert Szczerba

Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie, Wydział Nauk o Żywności i Biotechnologii

Development of methods for bias correction of gene expression measurements

Call: SONATA 12 , Panel: ST7

Principal investigator: dr Roman Jaksik

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

High-performance computing for next-generation DNA sequencing

Call: OPUS 1 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Aleksandra Świercz

Instytut Chemii Bioorganicznej, Polskiej Akademii Nauk

Occurrence, detection and characterization of viruses, phytoplasmas and bacteria infecting walnut and hazel in Poland

Call: OPUS 1 , Panel: NZ9

Principal investigator: dr hab. Mirosława Cieślińska

Instytut Ogrodnictwa

Pharmacogenetics of thiopurine drugs in patients with inflammatory bowel disease - application of the newest methods of ...

Call: SONATA 12 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Marzena Skrzypczak-Zielińska

Instytut Genetyki Człowieka Polskiej Akademii Nauk

Species diversity and origin of Chironomidae fauna from geologicaly young Lake Skadar (Montenegro/Albania) and its old s...

Call: PRELUDIUM 12 , Panel: NZ8

Principal investigator: dr Piotr Gadawski

Uniwersytet Łódzki, Wydział Biologii i Ochrony Środowiska

Algorithms for multiple alignment of genomes. Sequence alignment in a context of phylogenetic reconstruction.

Call: SONATA 11 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Adam Gudyś

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Incorporating genomic variation information into DNA sequencing data analysis

Call: OPUS 11 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Norbert Dojer

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

MLGenSig: Machine Learning Methods for building of Integrated Genetic Signatures

Call: OPUS 11 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Przemysław Biecek

Politechnika Warszawska, Wydział Matematyki i Nauk Informacyjnych

New algorithms for estimating clonal structures and for modeling heterogenous evolution for applications in cancer genom...

Call: OPUS 11 , Panel: ST6

Principal investigator: prof. Andrzej Polański

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Landscape genomics of four pine species (Pinus genus) in Europe.

Call: OPUS 10 , Panel: NZ9

Principal investigator: prof. Witold Wachowiak

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Methods for supervised and unsupervised classification of metagenomic DNA fragments extracted from various environmental...

Call: SONATA 10 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Jolanta Kawulok

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Development of an FcMito assay for highly sensitive quantification of Fusarium culmorum and analysis of interspecific va...

Call: OPUS 10 , Panel: NZ9

Principal investigator: dr hab. Tomasz Kulik

Uniwersytet Warmińsko-Mazurski w Olsztynie, Wydział Biologii i Biotechnologii

Molecular diagnostics of cardiomyopathies using next generation DNA sequencing

Call: OPUS 1 , Panel: NZ4

Principal investigator: dr hab. Rafał Płoski

Warszawski Uniwersytet Medyczny, I Wydział Lekarski

Formal linguistics for proteomics - modeling, analysis and hypotheses testing

Call: SONATA 9 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Witold Dyrka

Politechnika Wrocławska, Wydział Podstawowych Problemów Techniki

Application of fourth-generation DNA sequencing for identification of putative virulence factors in the highly pathogeni...

Call: PRELUDIUM 9 , Panel: NZ6

Principal investigator: dr Tomasz Wołkowicz

Narodowy Instytut Zdrowia Publicznego - Państwowy Zakład Higieny (NIZP - PZH)

Evolution and past range dynamics of the terrestrial Antarctic biota: insights from next-generation phylogeography of en...

Call: OPUS 9 , Panel: NZ8

Principal investigator: dr hab. Michał Ronikier

Instytut Botaniki im. Władysława Szafera PAN