Integrating whole genome sequencing and zebrafish functional studies to uncover new molecular basis of autosomal dominant hearing loss
2016/22/E/NZ5/00470
Keywords
Descriptors
- NZ5_3: Patogeneza chorób człowieka
- NZ5_1: Etiologia chorób człowieka
Panel
NZ5 – Human and animal noninfectious diseases: etiology, mechanisms, diagnosis and treatment of diseases, poisonings and injuries (without neurological diseases)
Host institution
Instytut Fizjologii i Patologii Słuchu
Voivodeship: mazowieckie
Principal investigator (from the host institution)
Number of co-investigators in the project: 5
Call
SONATA BIS 6 – announced on 2016-06-15
- Amount awarded
- 1 954 400 PLN
- Project start date
- 2017-05-18
- Project end date
- 2023-05-17
- Project duration
- 72 months (the same as in the proposal)
- Project status
- Project settled
Project description
Download the project description in a pdf file
Note — project descriptions were prepared by the authors of the applications themselves and placed in the system in an unchanged form.
Equipment purchased [PL]
- 8Licencja oprogramowania Alamut Visual na 3 lata. Cost: 2 983 PLN
- Dostęp do wersji profesjonalnej bazy mutacji człowieka (HGMD - The Human Gene Mutation Database). Cost: 35 000 PLN
- Roczny dostęp do polskiej bazy genomów firmy Genomed SA (2 pcs). Cost: 6 000 PLN
Information in the final report
Publication in academic press/journals (9)
-
Postlingual sensorineural hearing loss due to a very rare COCH pathogenic variant
- Authors:
- Oziębło D., Tacikowska G., Skarżyński H., Ołdak M.
- Academic press:
- Journal of Hearing Science (year: 2018, volume: Vol. 8 No. 1, pages: 31-37), Publisher: Institute of Sensory Organs, Mokra 1 Street Kajetany, 05-830 Nadarzyn
- Status:
- Published
- DOI:
- 10.17430/1002738 – link to the publication
-
Monogenic Causes of Low-Frequency Non-Syndromic Hearing Loss
- Authors:
- Gan NS., Oziębło D., Skarżyński H., Ołdak M.
- Academic press:
- Audiology and Neurotology (year: 2023, volume: nie dotyczy, pages: 46033), Publisher: S. Karger AG P.O Box, CH-4009 Basel (Switzerland) Allschwilerstrasse 10, CH-4055 Basel
- Status:
- Published
- DOI:
- 10.1159/000529464 – link to the publication
-
Searching for the Molecular Basis of Partial Deafness
- Authors:
- Oziębło D., Bałdyga N., Leja ML., Skarżyński H., Ołdak M.
- Academic press:
- International Journal of Molecular Sciences (year: 2022, volume: 23(11), pages: 6029), Publisher: MDPI, St. Alban-Anlage 66 4052, Basel, Switzerland
- Status:
- Published
- DOI:
- 10.3390/ijms23116029 – link to the publication
-
Hearing Loss as the Main Clinical Presentation in NLRP3-Associated Autoinflammatory Disease
- Authors:
- Oziebło D., Leja ML., Jeznach A., Orzechowska M., Skirecki T., Więsik-Szewczyk E., Furmanek M., Bałdyga N., Skarżyński H., Ołdak M.
- Academic press:
- Frontiers in Immunology (year: 2022, volume: 13, pages: Article 904632), Publisher: Frontiers Media SA, Avenue du Tribunal-Federal 34, 1005 Lausanne, Switzerland
- Status:
- Published
- DOI:
- 10.3389/fimmu.2022.904632 – link to the publication
-
Update on CD164 and LMX1A genes to strengthen their causative role in autosomal dominant hearing loss
- Authors:
- Oziębło D., Lee SY., Leja ML., Sarosiak A., Bałdyga N., Skarżyński H., Kim Y., Han JH., Yoo HS., Park MH., Choi BY., Ołdak M.
- Academic press:
- Human Genetics (year: 2022, volume: 141, pages: 445–453), Publisher: Springer Nature Limited, 4 Crinan St. Kings Cross London N1 9XW United Kingdom
- Status:
- Published
- DOI:
- 10.1007/s00439-022-02443-y – link to the publication
-
Two Novel Pathogenic Variants Confirm RMND1 Causative Role in Perrault Syndrome with Renal Involvement
- Authors:
- Oziębło D., Pazik J., Stępniak I., Skarżyński H., Ołdak M.
- Academic press:
- Genes (year: 2020, volume: 11 (9), pages: 1060), Publisher: MDPI St. Alban-Anlage 66 4052 Basel Switzerland
- Status:
- Published
- DOI:
- 10.3390/genes11091060 – link to the publication
-
First confirmatory study on PTPRQ as an autosomal dominant non-syndromic hearing loss gene
- Authors:
- Oziębło D., Sarosiak A., Leja M.L., Budde B.S., Tacikowska G., Di Donato N., Bolz H.J., Nürnberg P., Skarżyński H., Ołdak M.
- Academic press:
- Journal of Translational Medicine (year: 2019, volume: 17 (1), pages: 351), Publisher: BioMed Central Floor 6, 236 Gray's Inn Road London WC1X 8HB United Kingdom
- Status:
- Published
- DOI:
- 10.1186/s12967-019-2099-5 – link to the publication
-
Postlingual sensorineural hearing loss due to known TBC1D24 alteration
- Authors:
- Oziębło D., Leja ML., Bałdyga N., Sarosiak A., Skarżyński H., Ołdak M.
- Academic press:
- Journal of Hearing Science (year: 2021, volume: 4, pages: 72-76), Publisher: Institute of Sensory Organs, Mokra 1 Street Kajetany, 05-830 Nadarzyn
- Status:
- Published
- DOI:
- 10.17430/JHS.2021.11.4.8 – link to the publication
-
TBC1D24 emerges as an important contributor to progressive postlingual dominant hearing loss
- Authors:
- Oziębło D., Leja ML., Lazniewski M., Sarosiak A., Tacikowska G., Kochanek K., Plewczynski D., Skarżyński H., Ołdak M.
- Academic press:
- Scientific Reports (year: 2021, volume: 11(1), pages: 10300), Publisher: Springer Nature Limited, 4 Crinan St. Kings Cross London N1 9XW United Kingdom
- Status:
- Published
- DOI:
- 10.1038/s41598-021-89645-y – link to the publication
Articles in post-conference publications (26)
-
Genetic spectrum of hereditary hearing loss in multigenerational families with autosomal dominant mode of inheritance
- Authors:
- Ołdak M., Leja ML., Oziębło D., Sarosiak A., Skarżyński H.
- Conference:
- 53rd European Society of Human Genetics (ESHG) Conference (year: 2020, pages: 189-190), Publisher: Nature Publishing Group, Macmillan Building, 4 Crinan St., London N1 9XW, England
- Date:
- conference 43988
- Status:
- Published
-
Genetic heterogeneity of autosomal dominant hearing loss in pediatric patients
- Authors:
- Oziębło D., Leja M., Sarosiak A., Skarżyński H., Ołdak M.
- Conference:
- 43rd Annual MidWinter Meeting of the Association for Research in Otolaryngology (year: 2020, pages: 88-89), Publisher: The Abstracts of the Association for Research in Otolaryngology
- Date:
- conference 43855
- Status:
- Published
-
Evidence for Causative Role of PTPRQ in Autosomal Dominant Hearing Loss Development
- Authors:
- Ozieblo D., Sarosiak A., Leja M., Skarżyński H., Ołdak M.
- Conference:
- 42nd Annual MidWinter Meeting of the Association for Research in Otolaryngology (year: 2019, pages: 271), Publisher: The Abstracts of the Association for Research in Otolaryngology
- Date:
- conference 43505
- Status:
- Published
-
Gentamicin-induced hair cell death in zebrafish – preliminary studies on the development of zebrafish model for hearing loss
- Authors:
- Sarosiak A., Oziębło D., Bałdyga N., Leja M., Skarżyński H., Ołdak M.
- Conference:
- XXXV World Congress of Audiology (year: 2022, pages: 92), Publisher: Institute of Sensory Organs, 1 Mokra Street Kajetany, 05-830 Nadarzyn
- Date:
- conference 2022-04-10/13
- Status:
- Published
-
First confirmation of RMND1 gene as a cause of Perrault-like syndrome
- Authors:
- Oziębło D., Pazik J., Stępniak I., Skarżyński H., Ołdak M.
- Conference:
- XXXV World Congress of Audiology (year: 2022, pages: 169-170), Publisher: Institute of Sensory Organs, 1 Mokra Street Kajetany, 05-830 Nadarzyn
- Date:
- conference 2022-04-10/13
- Status:
- Published
-
Danio pręgowany jako model do rozszyfrowania funkcji genów TBC1D24 i WFS1 oraz ich udziału w rozwoju niedosłuchu
- Authors:
- Sarosiak A., Jędrychowska J., Oziębło D., Leja M., Gan N., Bałdyga N., Skarżyński H., Korzh V., Ołdak M.
- Conference:
- XV Konferencja Naukowo-Szkoleniowa Sekcji Audiologicznej i Sekcji Foniatrycznej Polskiego Towarzystwa Otorynolaryngologów Chirurgów Głowy i Szyi (year: 2022, pages: 72-73), Publisher: Instytut Narządów Zmysłów ul. Mokra 1, Kajetany 05-830 Nadarzyn
- Date:
- conference 2022-04-10/11
- Status:
- Published
-
Genetic background of autosomal dominant hearing loss
- Authors:
- Leja ML., Oziębło D., Sarosiak A., Skarżyński H., Ołdak M.
- Conference:
- XXXV World Congress of Audiology (year: 2022, pages: 90-91), Publisher: Institute of Sensory Organs, 1 Mokra Street Kajetany, 05-830 Nadarzyn
- Date:
- conference 2022-04-10/13
- Status:
- Published
-
Zastosowanie wysokoprzepustowego sekwencjonowania do identyfikacji podłoża genetycznego niedosłuchu dominującego u pacjentów pediatrycznych
- Authors:
- Leja M.L., Oziębło D., Sarosiak A., Skarżyński H., Ołdak M.
- Conference:
- XV Konferencja Naukowo-Szkoleniowa Sekcji Audiologicznej i Sekcji Foniatrycznej Polskiego Towarzystwa Otorynolaryngologów Chirurgów Głowy i Szyi (year: 2022, pages: 86-87), Publisher: Instytut Narządów Zmysłów ul. Mokra 1, Kajetany 05-830 Nadarzyn
- Date:
- conference 2022-04-10/11
- Status:
- Published
-
Modele eksperymentalne do badania genetycznego podłoża niedosłuchu
- Authors:
- Sarosiak A., Jędrychowska J., Oziębło D., Leja M., Gan N., Bałdyga N., Skarżyński H., Korzh V., Ołdak M.
- Conference:
- XLV Krajowa Konferencja Naukowo-Szkoleniowa Problemy otorynolaryngologii dziecięcej w codziennej praktyce (year: 2022, pages: 84-85), Publisher: Instytut Narządów Zmysłów ul. Mokra 1, Kajetany 05-830 Nadarzyn
- Date:
- conference 17-19.11.2022 r.
- Status:
- Published
-
Genetyczny niedosłuch niskoczęstotliwościowy u pacjentów pediatrycznych
- Authors:
- Gan N., Oziębło D., Leja M., Domagała S., Sarosiak A., Ołdak M.
- Conference:
- XLV Krajowa Konferencja Naukowo- Szkoleniowa Problemy otorynolaryngologii dziecięcej w codziennej praktyce (year: 2022, pages: 83-84), Publisher: Instytut Narządów Zmysłów ul. Mokra 1, Kajetany 05-830 Nadarzyn
- Date:
- conference 2022-11-17/19
- Status:
- Published
-
Częściowa głuchota i jej uwarunkowania genetyczne
- Authors:
- Oziębło D., Bałdyga N., Leja M.L., Skarżyński H., Ołdak M.
- Conference:
- XLV Krajowa Konferencja Naukowo-Szkoleniowa Problemy otorynolaryngologii dziecięcej w codziennej praktyce (year: 2022, pages: 79-80), Publisher: Instytut Narządów Zmysłów ul. Mokra 1, Kajetany 05-830 Nadarzyn
- Date:
- conference 2022-11-17/19
- Status:
- Published
-
Poszukiwanie genetycznych przyczyn niedosłuchu niskoczęstotliwościowego u pacjentów w polskiej populacji
- Authors:
- Gan N., Oziębło D., Leja M., Bałdyga N., Domagała S., Sarosiak A., Ołdak M.
- Conference:
- XV Konferencja Naukowo-Szkoleniowa Sekcji Audiologicznej i Sekcji Foniatrycznej Polskiego Towarzystwa Otorynolaryngologów Chirurgów Głowy i Szyi (year: 2022, pages: 81), Publisher: Instytut Narządów Zmysłów ul. Mokra 1, Kajetany 05-830 Nadarzyn
- Date:
- conference 2022-04-10/11
- Status:
- Published
-
Mechanizm działania wariantów GRHL2 odpowiedzialnych za powstawanie niedosłuchu dominującego DFNA28
- Authors:
- Bałdyga N., Oziębło D., Leja M.L., Skarżyński H., Ołdak M.
- Conference:
- XV Konferencja Naukowo-Szkoleniowa Sekcji Audiologicznej i Sekcji Foniatrycznej Polskiego Towarzystwa Otorynolaryngologów Chirurgów Głowy i Szyi (year: 2022, pages: 76), Publisher: Instytut Narządów Zmysłów ul. Mokra 1, Kajetany 05-830 Nadarzyn
- Date:
- conference 2022-04-10/11
- Status:
- Published
-
Najczęstsze przyczyny genetyczne niedosłuchu dominującego u dzieci
- Authors:
- Leja M.L., Oziębło D., Bałdyga N., Skarżyński H., Ołdak M.
- Conference:
- XLV Krajowa Konferencja Naukowo-Szkoleniowa Problemy otorynolaryngologii dziecięcej w codziennej praktyce (year: 2022, pages: 86), Publisher: Instytut Narządów Zmysłów ul. Mokra 1, Kajetany 05-830 Nadarzyn
- Date:
- conference 2022-11-17/19
- Status:
- Published
-
First Independent Confirmation of TBC1D24 as an Autosomal Dominant Hearing Loss Gene and Audiological Characteristics of Affected Individuals
- Authors:
- Ozieblo D., Leja M., Sarosiak A., Tacikowska G., Kochanek K., Skarżyński H., Ołdak M.
- Conference:
- 42nd Annual MidWinter Meeting of the Association for Research in Otolaryngology (year: 2019, pages: 270-271), Publisher: The Abstracts of the Association for Research in Otolaryngology
- Date:
- conference 43505
- Status:
- Published
-
Pierwsza charakterystyka audiologiczna niedosłuchu dominującego wywołanego uszkodzeniem genu TBC1D24
- Authors:
- Oziębło D., Tacikowska G., Kochanek K., Skarżyński H., Ołdak M.
- Conference:
- XIII Konferencja Naukowo-Szkoleniowa Sekcji Audiologicznej i Sekcji Foniatrycznej Polskiego Towarzystwa Otorynolaryngologów Chirurgów Głowy i Szyi (year: 2018, pages: 109-110), Publisher: Instytut Narządów Zmysłów, ul. Mokra 1, Kajetany, 05 - 830 Nadarzyn, Poland
- Date:
- conference 22-24.03.2018 r.
- Status:
- Published
-
Niezależne potwierdzenie patogennej roli wariantu p.Ile374Thr genu COCH w powstawaniu postlingwalnego niedosłuchu odbiorczego
- Authors:
- Oziębło D., Tacikowska G., Skarżyński H., Ołdak M.
- Conference:
- XIII Konferencja Naukowo-Szkoleniowa Sekcji Audiologicznej i Sekcji Foniatrycznej Polskiego Towarzystwa Otorynolaryngologów Chirurgów Głowy i Szyi (year: 2018, pages: 110), Publisher: Instytut Narządów Zmysłów, ul. Mokra 1, Kajetany, 05 - 830 Nadarzyn, Poland
- Date:
- conference 22-24.03.2018 r.
- Status:
- Published
-
Genetic basis of autosomal dominant hearing loss in pediatric patients
- Authors:
- Oziębło D., Leja M., Sarosiak A., Skarżyński H., Ołdak M.
- Conference:
- 32nd Politzer Society Meeting and 2nd World Congress of Otology (year: 2019, pages: 165), Publisher: Institute of Sensory Organs, 1 Mokra Street Kajetany, 05-830 Nadarzyn
- Date:
- conference 43613
- Status:
- Published
-
First independent confirmation of TBC1D24 as an autosomal dominant hearing loss gene and audiological characteristics of affected individuals
- Authors:
- Oziębło D., Leja M., Sarosiak A., Tacikowska G., Kochanek K., Skarżyński H., Ołdak M.
- Conference:
- 32nd Politzer Society Meeting and 2nd World Congress of Otology (year: 2019, pages: 93), Publisher: Institute of Sensory Organs, 1 Mokra Street Kajetany, 05-830 Nadarzyn
- Date:
- conference 43613
- Status:
- Published
-
Novel variants in known genes - results of genetic testing in families with autosomal dominant hearing loss
- Authors:
- Ołdak M., Oziębło D., Leja M., Sarosiak A., Skarżyński H.
- Conference:
- 32nd Politzer Society Meeting and 2nd World Congress of Otology (year: 2019, pages: 113-114), Publisher: Institute of Sensory Organs, 1 Mokra Street Kajetany, 05-830 Nadarzyn
- Date:
- conference 43613
- Status:
- Published
-
First missense variant in N-terminal cytoplasmic region of KCNQ4: analysis of the genotype-phenotype correlation
- Authors:
- Ołdak M., Madejska A., Oziębło D., Leja M., Skarżyński H.
- Conference:
- 32nd Politzer Society Meeting and 2nd World Congress of Otology (year: 2019, pages: 93), Publisher: Institute of Sensory Organs, 1 Mokra Street Kajetany, 05-830 Nadarzyn
- Date:
- conference 43613
- Status:
- Published
-
Evidence for causative role of PTPRQ gene in autosomal dominant hearing loss development
- Authors:
- Oziębło D., Sarosiak A., Leja M., Skarżyński H., Ołdak M.
- Conference:
- 32nd Politzer Society Meeting and 2nd World Congress of Otology (year: 2019, pages: 90), Publisher: Institute of Sensory Organs, 1 Mokra Street Kajetany, 05-830 Nadarzyn
- Date:
- conference 43613
- Status:
- Published
-
Genetic basis of autosomal dominant hearing loss in pediatric patients
- Authors:
- Oziębło D., Leja M., Skarżyński H., Ołdak M.
- Conference:
- 52nd European Society of Human Genetics (ESHG) Conference (year: 2019, pages: 1226-1227), Publisher: Nature Publishing Group, Macmillan Building, 4 Crinan St., London N1 9XW, England
- Date:
- conference 43631
- Status:
- Published
-
Pierwsze niezależne potwierdzenie zaangażowania genu PTPRQ w rozwój niedosłuchu dominującego
- Authors:
- Ołdak M., Oziębło D., Adamiok A., Sarosiak A., Skarżyński H.
- Conference:
- III Konferencja Wytyczne w Otologii Towarzystwa Otorynolaryngologów, Foniatrów i Audiologów Polskich (year: 2018, pages: 165), Publisher: Instytut Narządów Zmysłów, ul. Mokra 1, Kajetany, 05 - 830 Nadarzyn, Poland
- Date:
- conference 5-7.04.2018 r.
- Status:
- Published
-
First missense variant in N-terminal cytoplasmic region of KCNQ4: analysis of the genotype-phenotype correlation
- Authors:
- Ołdak M., Madejska A., Oziębło D., Leja M., Skarżyński H.
- Conference:
- 52nd European Society of Human Genetics (ESHG) Conference (year: 2019, pages: 1226), Publisher: Nature Publishing Group, Macmillan Building, 4 Crinan St., London N1 9XW, England
- Date:
- conference 43631
- Status:
- Published
-
Novel variants in known genes - results of genetic testing in families with autosomal dominant hearing loss
- Authors:
- Oziębło D., Leja M., Sarosiak A., Skarżyński H., Ołdak M.
- Conference:
- 52nd European Society of Human Genetics (ESHG) Conference (year: 2019, pages: 1227), Publisher: Nature Publishing Group, Macmillan Building, 4 Crinan St., London N1 9XW, England
- Date:
- conference 43631
- Status:
- Published