Projects funded by the NCN

Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

Mechanisms and consequences of activity-driven chromatin remodeling in neurons.

2015/18/E/NZ3/00730

Keywords:

higher- order chromatin architecture epigenomics chromatin interactions ChIA-PET

Descriptors:

  • NZ3_5: Molecular neurobiology

Panel:

NZ3 - Cellular and developmental biology: cell biology, developmental biology, ageing biology, neurobiology

Host institution :

Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego Polskiej Akademii Nauk

woj. mazowieckie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

dr Adriana Magalska 

Number of co-investigators in the project: 4

Call: SONATA BIS 5 - announced on 2015-06-15

Amount awarded: 1 949 350 PLN

Project start date (Y-m-d): 2016-04-11

Project end date (Y-m-d): 2022-04-10

Project duration:: 72 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Project description

Download the project description in a pdf file

Note - project descriptions were prepared by the authors of the applications themselves and placed in the system in an unchanged form.

Equipment purchased [PL]

  1. Iinkubator do hodowli komórkowych z kontrolowanym dostępem CO2/O2 (60 000 PLN)
  2. Komputery przenośne z oprogramowaniem dla członków zespołu. (3 szt.) (12 000 PLN)
  3. Monitor 27 cali o wysokiej rodzielczości.
  4. Blok Grzejny z wytrząsaniem (2 szt.) (10 000 PLN)
  5. UV Spektrofotometr Nanodrop 2000c z komputerem przenośnym do obsługi (40 000 PLN)
  6. Wytrząsarka kołyskowa (6 000 PLN)
  7. Termomikser z wytrząsarką do płytek (2 szt.) (10 000 PLN)
  8. Stacja robocza z oprogramowaniem, monitorem i przyrządowaniem (16 000 PLN)
  9. Wirówka laboratoryjna (2 szt.) (10 000 PLN)

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (6)
  1. Activation-induced chromatin reorganization in neurons depends on HDAC1 activity
    Authors:
    Agnieszka Grabowska, Hanna Sas-Nowosielska, Dagmara Holm-Kaczmarek, Elzbieta Januszewicz, Yana Yushkevich, Iwona Czaban, Pawel Trzaskoma, Katarzyna Krawczyk, Bartosz Wojtas, Bartlomiej Gielniewski, Ana Martin-Gonzalez, Robert Kuba Filipkowski, Krzysztof Hubert Olszynski, Tytus Bernas, Andrzej Antoni Szczepankiewicz, Malgorzata Alicja Sliwinska, Tambudzai Kanhema, Clive R. Bramham, Grzegorz Bokota, Dariusz Plewczynski, Grzegorz Marek Wilczynski, Adriana Magalska
    Academic press:
    Cell Reports (rok: 2022, tom: 38, strony: 110352), Wydawca: CellPress
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.celrep.2022.110352. - link to the publication
  2. Long noncoding RNAs - crucial players organizing the landscape of neuronal nucleus
    Authors:
    Hanna Sas-Nowosielska1, Adriana Magalska
    Academic press:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2021, tom: 22, strony: 3478), Wydawca: MDPI Open Access Journals
    Status:
    Published
    DOI:
    10.3390/ijms22073478 - link to the publication
  3. PartSeg: a tool for quantitative feature extraction from 3D microscopy images for dummies
    Authors:
    Bokota, G., Sroka, J., Basu, S., Das, N., Trzaskoma, P., Yushkevich, Y., Grabowska, A., Magalska, A., and Plewczynski, D.
    Academic press:
    BMC Bioinformatics (rok: 2021, tom: 22, strony: -), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1186/s12859-021-03984-1 - link to the publication
  4. The interplay of seizures-induced axonal sprouting and transcription-dependent Bdnf repositioning in the model of temporal lobe epilepsy
    Authors:
    Skupien-Jaroszek A., Walczak A., Czaban I., Pels K.K., Szczepankiewicz A.A., Krawczyk K., Ruszczycki B., Wilczynski G.M., Dzwonek J., Magalska A.
    Academic press:
    PLoS ONE (rok: 2021, tom: 16, strony: 45309), Wydawca: PLOS
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1371/journal.pone.0239111 - link to the publication
  5. Ultrastructural Visualization of 3D Chromatin Folding Using Serial Block-Face Scanning Electron Microscopy and In Situ Hybridization (3D-EMISH)
    Authors:
    Paweł Trzaskoma, Błażej Ruszczycki, Byoungkoo Lee, Katarzyna K. Pels, Katarzyna Krawczyk, Grzegorz Bokota, Andrzej A. Szczepankiewicz, Jesse Aaron, Agnieszka Walczak, Małgorzata A. Śliwińska, Adriana Magalska, Michal Kadlof, Artur Wolny, Zofia Parteka, Sebastian Arabasz, Magdalena Kiss-Arabasz, Dariusz Plewczynski, Yijun Ruan, Grzegorz M. Wilczyński
    Academic press:
    Nature Communication (rok: 2020, tom: 11, strony: 2120), Wydawca: Nature
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1038/s41467-020-15987-2 - link to the publication
  6. Nowoczesne techniki mikroskopowe w badaniach nad trójwymiarową strukturą chromatyny
    Authors:
    Paweł Trzaskoma, Adriana Magalska
    Academic press:
    KOSMOS (rok: 2019, tom: 68/1, strony: 19-33), Wydawca: POLSKIE TOWARZYSTWO PRZYRODNIKÓW IM. KOPERNIKA,
    Status:
    Published
    DOI:
    10.36921/kos.2019_2508 - link to the publication

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy