Projects funded by the NCN

Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

2-oxoglutarate dependent oxygenases catalyzing atypical oxidative transformations - structural and mechanistic studies.

2014/15/B/NZ1/03331

Keywords:

oxygenase metalloenzyme ethylene formation deamination endoperoxidation protein crystallography molecular modelling reaction mechanism

Descriptors:

  • ST4_15: Colloid chemistry
  • NZ1_4: Structural biology

Panel:

NZ1 - Molecular biology, structural biology, biotechnology: molecular biology, structural biology, biotechnology

Host institution :

Instytut Katalizy i Fizykochemii Powierzchni im. Jerzego Habera PAN

woj. małopolskie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

prof. Tomasz Borowski 

Number of co-investigators in the project: 6

Call: OPUS 8 - announced on 2014-09-15

Amount awarded: 1 498 904 PLN

Project start date (Y-m-d): 2015-09-01

Project end date (Y-m-d): 2019-08-31

Project duration:: 48 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Equipment purchased [PL]

  1. Chromatograf FPLC.
  2. Dewar do przechowywania próbek (8 000 PLN)
  3. Kolumna do FPLC.
  4. Uchwyty na próbki kompatybilne z robotem do automatycznego montowania kryształów. (15 000 PLN)
  5. Zamrażarka głębokiego mrożenia (40 000 PLN)
  6. Komputery stacjonarne typu desktop (3 szt.) (7 500 PLN)
  7. Lodówka/lodówko-zamrażarka/zamrażarka laboratoryjna (5 000 PLN)
  8. Spektrofotometr do pomiarów mikrolitrowych próbek (40 000 PLN)
  9. Wytrząsarka z funkcją chłodzenia (40 000 PLN)
  10. Mikroskop stereoskopowy.
  11. Sonifikator (22 000 PLN)
  12. Wolnostojąca wirówka z możliwością chłodzenia (100 000 PLN)
  13. Dewar do przechowywania ciekłego azotu.
  14. Zestaw pipet.
  15. Autoklaw.
  16. Serwer obliczeniowo-dyskowy wraz z zasilaczem awaryjnym oraz wyposażeniem do szafy serwerowej (25 000 PLN)
  17. Termocykler do monitorowania reakcji PCR w czasie rzeczywistym (90 000 PLN)

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (2)
  • Book publications / chapters in book publications (1)
  1. A study on the structure, mechanism, and biochemistry of kanamycin B dioxygenase (KanJ)—an enzyme with a broad range of substrates
    Authors:
    Beata Mrugała, Anna Miłaczewska, Przemyslaw J. Porebski, Ewa Niedzialkowska, Maciej Guzik, Wladek Minor, Tomasz Borowski
    Academic press:
    The FEBS Journal (rok: 2021, tom: 288, strony: 1366-1386), Wydawca: FEBS PRESS
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1111/febs.15462 - link to the publication
  2. On the reaction mechanism of an endoperoxide ring formation by fumitremorgin B endoperoxidase. The right arrangement makes a difference
    Authors:
    Anna Miłaczewska, Tomasz Borowski
    Academic press:
    Dalton Transactions (rok: 2019, tom: 48, strony: 16211-16221), Wydawca: RSC
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1039/C9DT02581B - link to the publication
  1. Model Setup and Procedures for Prediction of Enzyme Reaction Kinetics with QM-Only and QM:MM Approaches
    Authors:
    Michał Glanowski, Sangita Kachhap, Tomasz Borowski, Maciej Szaleniec
    Book:
    Methods Molecular Biology, Vol. 2385, Quentin Vanhaelen (Eds): Computational Methods for Estimating the Kinetic Parameters of Biological Systems , Wydawca: SpringerNature
    Status:
    Accepted for publication

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy