Projects funded by the NCN

Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

Structural and biophysical characteristics of highly conserved zinc hook domain of Rad50 protein - Studies on stability and diverse coordination dynamics in various domains of life

2014/13/B/NZ1/00935

Keywords:

zinc proteins Rad50 DNA break reapair system NMR protein stability protein-protein interaction

Descriptors:

  • NZ1_3: Biophysics
  • NZ1_1: Molecular biology
  • ST5_16:

Panel:

NZ1 - Molecular biology, structural biology, biotechnology: molecular biology, structural biology, biotechnology

Host institution :

Uniwersytet Wrocławski, Wydział Biotechnologii

woj. dolnośląskie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

dr hab. Artur Krężel 

Number of co-investigators in the project: 6

Call: OPUS 7 - announced on 2014-03-17

Amount awarded: 998 940 PLN

Project start date (Y-m-d): 2015-01-27

Project end date (Y-m-d): 2019-01-26

Project duration:: 48 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (7)
  • Articles in post-conference publications (19)
  1. Molecularly imprinted polymers coupled to mass spectrometric detection for metallothionein sensing
    Authors:
    Tereza Vaneckova, Lucie Vanickova, Michaela Tvrdonova, Adam Pomorski, Artur Krężel, Tomas Vaculovicc, Viktor Kanickyc, Marketa Vaculovicova, Vojtech Adam
    Academic press:
    Talanta (rok: 2019, tom: 198, strony: 224-229), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.talanta.2019.01.089 - link to the publication
  2. Cu transfer from amyloid-b4–16 to metallothionein-3: the role of the neurotransmitter glutamate and metallothionein-3 Zn(II)-load states
    Authors:
    Alice Santoro, Nina Ewa Wezynfeld, Ewelina Stefaniak, Adam Pomorski, Dawid Płonka, Artur Krężel, Wojciech Bal, Peter Faller
    Academic press:
    Chemical Communications (rok: 2018, tom: 54, strony: 12634-12637), Wydawca: Royal Chemical Society
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1039/c8cc06221h - link to the publication
  3. Eukaryotic Rad50 functions as a rod-shaped dimer
    Authors:
    Young Bong Park, Marcel Hohl, Michał Padjasek, Eunyoung Jeong, Kyeong Sik Jin, Artur Krężel, John H.J. Petrini, Yunje Cho
    Academic press:
    Nature Structural and Molecular Biology (rok: 2017, tom: 24, strony: 248-257), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1038/nsmb.3369 - link to the publication
  4. Interdependence of free zinc changes and protein complex assembly - insights into zinc signal regulation
    Authors:
    Anna Kocyła, Justyna Adamczyk, Artur Krężel
    Academic press:
    Metallomics (rok: 2018, tom: 10, strony: 120-131), Wydawca: Royal Chemical Society
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1039/c7mt00301c - link to the publication
  5. Metal-coupled folding as the driving force for the extreme stability of Rad50 zinc hook dimer assembly
    Authors:
    Tomasz Kochańczyk, Michał Nowakowski, Dominika Wojewska, Anna Kocyła, Andrzej Ejchart, Wiktor Koźmiński, Artur Krężel
    Academic press:
    Scientific Reports (rok: 2016, tom: 6, strony: 36346), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1038/srep36346 - link to the publication
  6. Molar absorption coefficients and stability constants of Zincon metal complexes for determination of metal ions and bioinorganic applications
    Authors:
    Anna Kocyła, Adam Pomorski, Artur Krężel
    Academic press:
    Jounal of Inorganic Biochemistry (rok: 2017, tom: 176, strony: 53-65), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.jinorgbio.2017.08.006 - link to the publication
  7. Zinc clasp-based reversible toolset for selective metal-mediated protein heterodimerization
    Authors:
    Anna Kocyła, Artur Krężel
    Academic press:
    Chemical Communications (rok: 2018, tom: 54, strony: 13539-13542), Wydawca: Royal Chemical Society
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1039/c8cc06301j - link to the publication
  1. Extremely high affinity of zinc hook motif from Rad50 protein towards Cd(II) and Hg(II)
    Authors:
    Michał Padjasek, Artur Krężel
    Conference:
    13-th European Biological Inorganic Chemistry Conference (rok: 2016, ), Wydawca: Eurobic
    Data:
    konferencja 28.08-1.09
    Status:
    Published
  2. Impact of Rad50 phosphorylation in zinc hook domain on its stability and global architecture
    Authors:
    J. Tran, M. Padjasek, A. Krężel
    Conference:
    43rd FEBS Congress (rok: 2018, ), Wydawca: FEBS PRESS
    Data:
    konferencja 7–12.07
    Status:
    Published
  3. S. cerevisiae Rad50 dimer assembly shifts upon dinuclear Zn2+-cluster formation
    Authors:
    Michał Padjasek, Józef Tran, Mateusz Marcisz, Artur Krężel
    Conference:
    International Society for Zinc in Biology ISZB 5-th meeting (rok: 2017, ), Wydawca: UCLAN
    Data:
    konferencja 18-22.06
    Status:
    Published
  4. Structural and energetic factors that control zinc protein domains stability and function
    Authors:
    Justyna Adamczyk, Anna Kocyła, Michał Padjasek, Katarzyna Kluska, Artur Krężel
    Conference:
    24-th Polish Peptide Symposium (rok: 2017, ), Wydawca: Uniwersytet Gdański
    Data:
    konferencja 3-7.09
    Status:
    Published
  5. Extremely affinity of zinc hook domain of Rad50 protein towards Zn2+, Cd2+, and Hg2+
    Authors:
    Miłosz Nowak, Michał Padjasek, Artur Krężel
    Conference:
    X Parnas Conference Young Scientist Forum "Molecules in the Living Cell and Innovative Medicine" (rok: 2016, ), Wydawca: X Parnas Conference
    Data:
    konferencja 10-12.07
    Status:
    Published
  6. Impact of Rad50 phosphorylation in zinc hook domain on its stability and global architecture
    Authors:
    Józef Tran, Michał Padjasek, Artur Krężel
    Conference:
    9-th Inhibitors of Protein Kinases Conference Challenges in Molecular Biology, Biophysics and Biomedicine (rok: 2017, ), Wydawca: IBB PAN
    Data:
    konferencja 17-21.09
    Status:
    Published
  7. Interactions of Zn(II), Cd(II) and Hg(II) with zinc hook domain of Rad50 protein
    Authors:
    Miłosz Nowak, Michał Padjasek, Artur Krężel
    Conference:
    59 Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2016, ), Wydawca: PTChem
    Data:
    konferencja 19-23.09
    Status:
    Published
  8. Probing the extremely high metal-to-protein affinity of interprotein zinc hook domain of Rad50 protein from P. furiosus
    Authors:
    Tomasz Kochańczyk, Michał Nowakowski, Dominika Wojewska, Artur Krężel
    Conference:
    The 29-th Annual Symposium of the Protein Society (rok: 2015, ), Wydawca: The Protein Society, czasopismo: Protein Science
    Data:
    konferencja 22-25.07
    Status:
    Published
  9. Wpływ fosforylacji białka Rad50 w domenie haczyka cynkowego na stabilność kompleksu
    Authors:
    Józef Tran, Michał Padjasek, Artur Krężel
    Conference:
    61. Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2018, ), Wydawca: Uniwersytet Jagielloński
    Data:
    konferencja 17-21.09
    Status:
    Published
  10. Zależność pomiędzy stabilnością, strukturą a funkcją białek cynkowych
    Authors:
    Anna Kocyła, Adam Pomorski, Agnieszka Drozd, Justyna Adamczyk, Tomasz Kochańczyk, Artur Krężel
    Conference:
    60 Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2017, ), Wydawca: Politechnika Wrocławska
    Data:
    konferencja 17-21.09
    Status:
    Published
  11. Zinc hook motif from Rad50 protein – a form fit to function
    Authors:
    Michał Padjasek, Józef Tran, Olga Kerber, Artur Krężel
    Conference:
    61. Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2018, ), Wydawca: Uniwersytet Jagielloński
    Data:
    konferencja 17-21.09
    Status:
    Published
  12. How proteins match Zn(II) affinity with their biological function?
    Authors:
    Anna Kocyła, Adam Pomorski, Agnieszka Drozd, Justyna Adamczyk, Tomasz Kochańczyk, Artur Krężel
    Conference:
    14-th International Conference on Applied Bioinorganic Chemistry (rok: 2017, ), Wydawca: University of Toulouse
    Data:
    konferencja 7-10.06
    Status:
    Published
  13. Insight into the cellular buffering mechanism through structural characterization of partially-depleted methallothionein 2
    Authors:
    Manuel David Peris-Díaz, Dominika Wojewska, Agnieszka Drozd, Artur Krężel
    Conference:
    11th International Biometals Symposium (rok: 2018, ), Wydawca: University of Ottawa
    Data:
    konferencja 15-19.07
    Status:
    Published
  14. Peptide model study of the Zn2+-binuclear cluster formation inside S. cerevisiae Rad50 dimer
    Authors:
    Michał Padjasek
    Conference:
    24-th Polish Peptide Symposium (rok: 2017, ), Wydawca: Uniwersytet Gdański
    Data:
    konferencja 3-7.09
    Status:
    Published
  15. How proteins match Zn(II) affinity to fit their function? Relationship between thermodynamics and free zinc status
    Authors:
    Michał Padjasek, Anna Kocyła, Katarzyna Kluska, Justyna Adamczyk, Manuel David Peris-Díaz, Artur Krężel
    Conference:
    11th International Biometals Symposium (rok: 2018, ), Wydawca: University of Ottawa
    Data:
    konferencja 15-19.07
    Status:
    Published
  16. Systematyczny przegląd oddziaływań Zn(II) z motywem haczyka cynkowego hologów białka Rad50
    Authors:
    Michał Padjasek, Tomasz Kochańczyk, Józef Tran, Anna Kocyła, Artur Krężel
    Conference:
    60 Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2017, ), Wydawca: Politechnika Wrocławska
    Data:
    konferencja 17-21.09
    Status:
    Published
  17. Hg2+ binding properties of RAD50, conserved protein involved in DNA repair
    Authors:
    Marek Łuczkowski, Michal Padjasek, Artur Krężel
    Conference:
    14th European Biological Inorganic Chemistry Conference (rok: 2018, ), Wydawca: University of Birmingham
    Data:
    konferencja 26-30.08
    Status:
    Published
  18. Structural and thermodynamic factors that control zinc protein stability and functionality
    Authors:
    Justyna Adamczyk, Anna Kocyła, Tomasz Kochańczyk, Agnieszka Drozd, Michał Padjasek, Artur Krężel
    Conference:
    13-th European Biological Inorganic Chemistry Conference (rok: 2016, ), Wydawca: Eurobic
    Data:
    konferencja 28.08-01.09
    Status:
    Published
  19. Systematic overview of zinc hook domains from Rad50 proteins – insight into evolutionary diversification
    Authors:
    Michał Padjasek, Józef Tran, Olga Kerber, Tomasz Kochańczyk, Artur Krężel
    Conference:
    11th International Biometals Symposium (rok: 2018, ), Wydawca: University of Ottawa
    Data:
    konferencja 15-19.07
    Status:
    Published

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy