Projects funded by the NCN


Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

Determination of the crystal structure of the 10-23 deoxyribozyme and elucidation of the mechanism of action

2012/05/B/NZ1/01661

Keywords:

structural studies crystallography crystallization deoxyribozyme DNAzyme

Descriptors:

  • NZ1_4: Structural biology

Panel:

NZ1 - Molecular biology, structural biology, biotechnology: molecular biology, structural biology, biotechnology

Host institution :

Centrum Badań Molekularnych i Makromolekularnych PAN

woj. łódzkie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

dr Rafał Dolot 

Number of co-investigators in the project: 4

Call: OPUS 3 - announced on 2012-03-15

Amount awarded: 700 210 PLN

Project start date (Y-m-d): 2013-03-01

Project end date (Y-m-d): 2016-08-31

Project duration:: 42 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Equipment purchased [PL]

  1. Koszty udziału w komputerowej bazie danych SciFinder (5 000 PLN)
  2. Lodówka z zamrażarką (3 500 PLN)
  3. Zestaw do elektroforezy poziomej (5 885 PLN)
  4. Blok grzejąco-chłodzący z cyfrową regulacją temperatury (8 000 PLN)
  5. Zestaw do prowadzenia elektroforezy pionowej (9 349 PLN)
  6. Kolumna do oczyszczania na odwrotnej fazie do HPLC (5 000 PLN)
  7. Komputer przenośny (7 000 PLN)
  8. Zestaw do przygotowania i zamrażania kryształów do transportu w warunkach kriogenicznych wraz z dedykowanym diuarem.
  9. Termostat do kolumn HPLC (5 000 PLN)
  10. Kolumna jonowymienna do HPLC (8 000 PLN)
  11. Pompa olejowa próżniowa dwustopniowa (12 000 PLN)

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (1)
  1. Synthesis, crystallization and preliminary crystallographic analysis of a 52-nucleotide DNA/2'-OMe-RNA oligomer mimicking 10-23 DNAzyme in the complex with a substrate
    Authors:
    Dolot R., Sobczak M., Mikołajczyk B., Nawrot B.
    Academic press:
    Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids (rok: 2017, tom: 36, strony: 292-301), Wydawca: Taylor & Francis, Inc., 530 Walnut Street, Suite 850, Philadelphia, PA 19106
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1080/15257770.2016.1276291 - link to the publication