Projects funded by the NCN


Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

Identification of biomarkers for colon carcinoma by the use of mass spectroscopy

2011/01/N/NZ5/04253

Keywords:

biomarkers colon carcinoma mass spectroscopy laser microdissection

Descriptors:

  • NZ5_3: Pathogenesis of human diseases
  • NZ5_7: Human disease treatment
  • NZ2_3: Proteomics

Panel:

NZ5 - Human and animal noninfectious diseases: etiology, mechanisms, diagnosis and treatment of diseases, poisonings and injuries (without neurological diseases)

Host institution :

Uniwersytet Medyczny we Wrocławiu, Wydział Lekarski

woj. dolnośląskie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

dr Paweł Ostasiewicz 

Number of co-investigators in the project: 5

Call: PRELUDIUM 1 - announced on 2011-03-15

Amount awarded: 1 122 400 PLN

Project start date (Y-m-d): 2011-12-01

Project end date (Y-m-d): 2015-05-31

Project duration:: 42 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Equipment purchased [PL]

  1. Komputer o dużej mocy obliczeniowej (10 000 PLN)
  2. Drobny sprzet laboratoryjny (40 000 PLN)
  3. Urządzenie do real time PCR, amplificator DNA (220 000 PLN)
  4. Mikroskop jasnego pola z wysokiej jakości kamerą (70 000 PLN)
  5. Przystawka fluorescencyjna do mikroskopu (30 000 PLN)

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (6)
  • Articles in post-conference publications (7)
  1. Pattern of Melanotransferrin Expression in Human Colorectal Tissues: An Immunohistochemical Study on Potential Clinical Application
    Authors:
    Kamila Duś-Szachniewicz, Paweł Ostasiewicz, Marta Woźniak, Paweł Kołodziej, Jacek Wiśniewski, Piotr Ziółkowski
    Academic press:
    Anticancer Research (rok: 2015, tom: 35, strony: 6551-6562), Wydawca: International Institute of Anticancer Research
    Status:
    Published
  2. Quantitative analysis of gene expression in fixed colorectal carcinoma samples can be used as a method for biomarkers validation
    Authors:
    Beata Ostasiewicz, Paweł Ostasiewicz, Kamila Duś-Szachniewicz, Katarzyna Ostasiewicz, Piotr Ziółkowski
    Academic press:
    Molecular Medicine Reports , Wydawca: Spandidos Publications
    Status:
    Accepted for publication
  3. Absolute proteome analysis of colorectal mucosa, adenoma and cancer reveals drastic changes in fatty acid metabolism and plasma membrane transporters
    Authors:
    Wiśniewski, Jacek; Dus-Szachniewicz, Kamila; Ostasiewicz, Pawel; Ziolkowski, Piotr; Rakus, Dariusz; Mann, Matthias
    Academic press:
    Journal of Proteome Research (rok: 2015, tom: Sep 4;14(9), strony: 4005-18), Wydawca: ACS Publications
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1021/acs.jproteome.5b00523 - link to the publication
  4. Extensive quantitative remodeling of the proteome between normal colon tissue and adenocarcinoma.
    Authors:
    Wiśniewski JR, Ostasiewicz P, Duś K, Zielińska DF, Gnad F, Mann M.
    Academic press:
    Molecular Systems Biology (rok: 2012, tom: 8, strony: 45303), Wydawca: EMBO and Macmillan Publishers Limited
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1038/msb.2012.44. - link to the publication
  5. Proteomic workflow for analysis of archival formalin-fixed and paraffin-embedded clinical samples to a depth of 10 000 proteins
    Authors:
    Wiśniewski JR, Duś K, Mann M.
    Academic press:
    Proteomics Clinical Applications (rok: 2013, tom: Apr 7(3-4), strony: 225-233), Wydawca: Wiley
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1002/prca.201200046 - link to the publication
  6. Zastosowanie hodowli komórkowych, płynów ustrojowych i tkanek w onkoproteomice
    Authors:
    Duś-Szachniewicz K, Ostasiewicz P, Woźniak M, Gamian A
    Academic press:
    Postępy Higieny i Medycyny Doświadczalnej (rok: 2014, tom: 68, strony: 1312-1324), Wydawca: Państwowy Zakład Higieny
    Status:
    Published
  1. Immunohistochemical studies on melanoma-associated antigen D2 (MAGED2) expression profile in colorectal cancer.
    Authors:
    1.Kamila Duś-Szachniewicz, Paweł Ostasiewicz, Marta Woźniak, Paweł Kołodziej, Barbara Ziółkowska, Piotr Ziółkowski
    Conference:
    9th International Conference of Anticancer Research (rok: 2014, ), Wydawca: International Institute of Anticancer Research
    Data:
    konferencja 6-10.10
    Status:
    Published
  2. Proteomics approaches to identifying proteins involved in adenoma-to-colorectal carcinoma progression
    Authors:
    2.Kamila Duś-Szachniewicz, Paweł Ostasiewicz, Piotr Ziółkowski, Marta Woźniak, Barbara Ziółkowska, Matthias Mann, Jacek R. Wiśniewski
    Conference:
    9th International Conference of Anticancer Research (rok: 2014, ), Wydawca: International Institute of Anticancer Research
    Data:
    konferencja 6-10.10
    Status:
    Published
  3. New proteomic platform for utilization of formalin-fixed, paraffin- embedded samples in biomarkers search
    Authors:
    P. Ostasiewicz * , J. R. Wisniewski, D. Zielinska, K. Dus, P. Ziólkowski, M. Mann
    Conference:
    25th European Congress of Pathology (rok: 2013, ), Wydawca: Springer
    Data:
    konferencja 31.09-4.09.13
    Status:
    Published
  4. Zastosowanie spektrometrii masowej w identyfikacji markerów raka jelita grubego
    Authors:
    5.Kamila Duś-Szachniewicz, Marta Woźniak, Paweł Ostasiewicz, Barbara Ziółkowska, Piotr Ziółkowski
    Conference:
    VIII Kopernikańskie Seminarium Doktoranckie (rok: 2014, ), Wydawca: Wydawnictwo Naukowe Uniwersytetu Mikołaja Kopernika
    Data:
    konferencja 25-27.06
    Status:
    Published
  5. Osiagnięcia onkoproteomiki w zakresie identyfikacji profili białkowych wybranych nowotworów złośliwych człowieka
    Authors:
    4.Kamila Duś-Szachniewicz, Paweł Ostasiewicz, Marta Woźniak, Barbara Ziółkowska, Piotr Ziółkowski
    Conference:
    VIII Kopernikańskie Seminarium Doktoranckie (rok: 2014, ), Wydawca: Wydawnictwo Naukowe Uniwersytetu Mikołaja Kopernika
    Data:
    konferencja 25-27.06
    Status:
    Published
  6. How can human cell lines, body fluids and tissues be useful in oncoproteomics
    Authors:
    Duś-Szachniewicz K., Woźniak M., Ostasiewicz P., Ziółkowska B., Ziółkowski P.
    Conference:
    The 8th International Conference of Young Naturalists (rok: 2013, ), Wydawca: University of Zielona Góra
    Data:
    konferencja 07-09.11.13
    Status:
    Published
  7. The application of archival tissue in oncoproteomics- an insight into the colorectal cancer proteome
    Authors:
    3.Duś-Szachniewicz K., Ostasiewicz P., Ziółkowski P., Woźniak M., Kołodziej P., Mann M., Wiśniewski JR
    Conference:
    5th International Conference on Biomarkers and Clinical Research (rok: 2014, ), Wydawca: OMICS Group
    Data:
    konferencja 15-17.04
    Status:
    Published