Projects funded by the NCN

Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

Analysis of interaction between Tumor Educated Platelets and ovarian cancer cells

2018/31/D/NZ5/01263

Keywords:

single cell RNA seq

Descriptors:

  • NZ5_3:
  • NZ5_5:
  • NZ3_1:

Panel:

NZ5 - Human and animal noninfectious diseases: etiology, mechanisms, diagnosis and treatment of diseases, poisonings and injuries (without neurological diseases)

Host institution :

Gdański Uniwersytet Medyczny, Międzyuczelniany Wydział Biotechnologii Uniwersytetu Gdańskiego i Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego

woj. pomorskie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

dr Anna Maria Supernat 

Number of co-investigators in the project: 4

Call: SONATA 14 - announced on 2018-09-14

Amount awarded: 1 044 088 PLN

Project start date (Y-m-d): 2019-07-24

Project end date (Y-m-d): 2023-07-23

Project duration:: 48 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Project description

Download the project description in a pdf file

Note - project descriptions were prepared by the authors of the applications themselves and placed in the system in an unchanged form.

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (7)
  1. imPlatelet classifier: Image-converted RNA biomarker profiles enable blood-based cancer diagnostics
    Authors:
    Krzysztof Pastuszak (równy wkład pracy), Anna Supernat (równy wkład pracy), Myron G Best, Sjors G J G In 't Veld, Sylwia Łapińska-Szumczyk, Anna Łojkowska, Robert Różański, Anna J Żaczek, Jacek Jassem, Tom Würdinger, Tomasz Stokowy
    Academic press:
    Molecular Oncology (rok: 2021, tom: 10, strony: 2688-2701), Wydawca: Wiley Online Library
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1002/1878-0261.13014. - link to the publication
  2. imPlatelet classifier: Image-converted RNA biomarker profiles enable blood-based cancer diagnostics
    Authors:
    Krzysztof Pastuszak (równy wkład pracy), Anna Supernat (równy wkład pracy), Myron G Best, Sjors G J G In 't Veld, Sylwia Łapińska-Szumczyk, Anna Łojkowska, Robert Różański, Anna J Żaczek, Jacek Jassem, Tom Würdinger, Tomasz Stokowy
    Academic press:
    Molecular Oncology (rok: 2021, tom: 10, strony: 2688-2701), Wydawca: Wiley Online Library
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1002/1878-0261.13014. - link to the publication
  3. Platelet-Based Liquid Biopsies through the Lens of Machine Learning
    Authors:
    Cygert S, Pastuszak K, Górski F, Sieczczyński M, Juszczyk P, Rutkowski A, Lewalski S, Różański R, Jopek MA, Jassem J, Czyżewski A, Wurdinger T, Best MG, Żaczek AJ, Supernat A (autor korespondencyjny)
    Academic press:
    Cancers (Basel) (rok: 2023, tom: 15, strony: 45669), Wydawca: MDPI
    Status:
    Published
    DOI:
    10.3390/cancers15082336 - link to the publication
  4. Platelet-Based Liquid Biopsies through the Lens of Machine Learning
    Authors:
    Cygert S, Pastuszak K, Górski F, Sieczczyński M, Juszczyk P, Rutkowski A, Lewalski S, Różański R, Jopek MA, Jassem J, Czyżewski A, Wurdinger T, Best MG, Żaczek AJ, Supernat A (autor korespondencyjny)
    Academic press:
    Cancers (Basel) (rok: 2023, tom: 15, strony: 45669), Wydawca: MDPI
    Status:
    Published
    DOI:
    10.3390/cancers15082336 - link to the publication
  5. Transcriptomic landscape of blood platelets in healthy donors
    Authors:
    Anna Supernat, Marta Popęda, Krzysztof Pastuszak, Myron G. Best, Peter Grešner, Sjors In 't Veld, Bartłomiej Siek, Natalia Bednarz-Knoll, Matthew T. Rondina, Tomasz Stokowy, Thomas Wurdinger, Jacek Jassem, Anna J. Żaczek
    Academic press:
    Scientific Reports (rok: 2021, tom: 11(1):15679, strony: 45667), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1038/s41598-021-94003-z - link to the publication
  6. Transcriptomic landscape of blood platelets in healthy donors
    Authors:
    Anna Supernat, Marta Popęda, Krzysztof Pastuszak, Myron G. Best, Peter Grešner, Sjors In 't Veld, Bartłomiej Siek, Natalia Bednarz-Knoll, Matthew T. Rondina, Tomasz Stokowy, Thomas Wurdinger, Jacek Jassem, Anna J. Żaczek
    Academic press:
    Scientific Reports (rok: 2021, tom: 11(1):15679, strony: 45667), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1038/s41598-021-94003-z - link to the publication
  7. Deep Learning-Based, Multiclass Approach to Cancer Classification on Liquid Biopsy Data
    Authors:
    Jopek A, Pastuszak K, Cygert S, Best MG, Wurdinger T, Jassem J, Żaczek AJ, Supernat A
    Status:
    Accepted for publication

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy