Projects funded by the NCN

Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

Design and validation of multi-gene transcriptional signature as molecular diagnostic tool in paediatric brain tumours

2016/21/B/NZ2/01785

Keywords:

genes expression brain tumour children

Descriptors:

  • NZ2_2: Genomics, transcriptomics, epigenomics
  • NZ2_7: Bioinformatics
  • NZ2_12: Other related subjects

Panel:

NZ2 - Genetics, genomics: molecular genetics, genomics, proteomics, bioinformatics, systems biology, genetic epidemiology

Host institution :

Instytut "Pomnik - Centrum Zdrowia Dziecka"

woj. mazowieckie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

dr hab. Maria Łastowska 

Number of co-investigators in the project: 12

Call: OPUS 11 - announced on 2016-03-15

Amount awarded: 1 183 900 PLN

Project start date (Y-m-d): 2017-04-06

Project end date (Y-m-d): 2021-07-05

Project duration:: 51 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Project description

Download the project description in a pdf file

Note - project descriptions were prepared by the authors of the applications themselves and placed in the system in an unchanged form.

Equipment purchased [PL]

  1. Komputer z oprogramowaniem (7 958 PLN)
  2. Mikrowirówka z rotorem do wirowania 18 próbek (10 000 PLN)
  3. GeneSpring lub inny program komputerowy do analizy wyników mikromacierzy (62 000 PLN)
  4. Monitory komputerowe - 2 szt..
  5. Pozycja dodana omyłkowo.
  6. Komputer (8 000 PLN)
  7. Komputer.
  8. Spektrofotometr Nanodrop (58 000 PLN)

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (6)
  • Articles in post-conference publications (6)
  1. Medulloblastoma with transitional features between Group 3 and Group 4 is associated with good prognosis.
    Authors:
    Maria Łastowska; Joanna Trubicka; Magdalena Niemira; Magdalena Paczkowska-Abdulsalam; Agnieszka Karkucińska-Więckowska; Magdalena Kaleta; Monika Drogosiewicz; Marta Perek-Polnik; Adam Krętowski; Bożena Cukrowska; Wiesława Grajkowska; Bożenna Dembowska-Bagińska; Ewa Matyja
    Academic press:
    Journal of Neuro-Oncology (rok: 2018, tom: Vol. 138, Nr 2, strony: 231-240), Wydawca: Springer
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1007/s11060-018-2797-5 - link to the publication
  2. Immunohistochemical detection of ALK protein identifies APC mutated medulloblastoma and differentiates the WNT-activated medulloblastoma from other types of posterior fossa childhood tumors.
    Authors:
    Maria Łastowska; Joanna Trubicka; Agnieszka Karkucińska-Więckowska; Magdalena Kaleta; Magdalena Tarasińska; Marta Perek-Polnik; Anna Antonina Sobocińska; Bożenna Dembowska-Bagińska; Wiesława Grajkowska; Ewa Matyja
    Academic press:
    Brain Tumor Pathology (rok: 2019, tom: Vol. 36, Nr 1, strony: 45297), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1007/s10014-018-0331-2 - link to the publication
  3. ALK expression is a novel marker for the WNT-activated type of pediatric medulloblastoma and an indicator of good prognosis for patients.
    Authors:
    Maria Łastowska; Joanna Trubicka; Magdalena Niemira; Magdalena Paczkowska-Abdulsalam; Agnieszka Karkucińska-Więckowska; Magdalena Kaleta; Monika Drogosiewicz; Magdalena Tarasińska; Marta Perek-Polnik; Adam Krętowski; Bożenna Dembowska-Bagińska; Wiesława Grajkowska; Maciej Pronicki; Ewa Matyja
    Academic press:
    American Journal of Surgical Pathology (rok: 2017, tom: Vol. 41, Nr 6, strony: 781 - 787), Wydawca: LIPPINCOTT WILLIAMS & WILKINS.
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1097/PAS.0000000000000847 - link to the publication
  4. Molecular identification of CNS NB-FOXR2, CNS EFT-CIC, CNS HGNET-MN1 and CNS HGNET-BCOR pediatric brain tumors using tumor-specific signature genes.
    Authors:
    Łastowska Maria, Trubicka Joanna, Sobocińska Anna, Wojtas Bartosz, Niemira Magdalena, Szałkowska Anna, Krętowski Adam, Karkucińska-Więckowska Agnieszka, Kaleta Magdalena, Ejmont Maria, Perek-Polnik Marta, Dembowska-Bagińska Bożenna, Grajkowska Wiesława, Matyja Ewa.
    Academic press:
    Acta Neuropathologica Communications (rok: 2020, tom: Vol. 8,, strony: Article 105), Wydawca: BioMed Central
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1168/s40478-020-00984-9 - link to the publication
  5. Constitutional mosaicism of a de novo TP53 mutation in a patient with bilateral choroid plexus carcinoma.
    Authors:
    Joanna Trubicka; Iwona Filipek; Piotr Iwanowski; Małgorzata Rydzanicz; Wiesława Grajkowska; Dorota Piekutowska-Abramczuk; Krystyna Chrzanowska; Agnieszka Karkucińska-Więckowska; Katarzyna Iwanicka-Pronicka; Maciej Pronicki; Maria Łastowska; Rafał Płoski; Bożenna Dembowska-Bagińska
    Academic press:
    Cancer Genetics (rok: 2017, tom: Vol. 216-217, strony: 79 - 85), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.cancergen.2017.07.001 - link to the publication
  6. Transcriptional profiling of paediatric ependymomas identifies prognostically significant groups
    Authors:
    Łastowska M, Matyja E, Sobocińska A , Wojtas B , Niemira B , Szałkowska A, Krętowski A, Karkucińska-Więckowska A , Kaleta M, Ejmont M, Tarasińska M, Perek-Polnik M , Dembowska-Bagińska B, Pronicki M, Grajkowska W, Trubicka J
    Academic press:
    Journal of Pathology: Clinical Research (rok: 2021, tom: 7, strony: 45303), Wydawca: Wiley Online Library
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1002/cjp2.236 - link to the publication
  1. Identification of Ependymoma-B Subgroup by Transcriptional Profiling of Tumours from Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Tissue Samples.
    Authors:
    Łastowska M, Sobocińska, A Niemira, M, Szałkowska,A, Wojtas B, Tarasińska M , Grajkowska W, Dembowska-Bagińska B, Matyja E.
    Conference:
    51st Congress of the International Society of Paediatric Oncology (SIOP), Lyon, Francja (rok: 2019, ), Wydawca: Pediatric Blood &Cancer 2019, 66 W
    Data:
    konferencja 23–26.10. 2019
    Status:
    Published
  2. Constitutional mosaicism of clinically important genetic markers in pediatric brain tumors detected by next-generation sequencing.
    Authors:
    Joanna Trubicka; Małgorzata Rydzanicz; Iwona Filipek; Piotr Iwanowski; Wiesława Grajkowska; Maciej Pronicki; Rafał Płoski; Bożenna Dembowska-Bagińska; Maria Łastowska
    Conference:
    18th International Symposium on Pediatric Neuro-Oncology (ISPNO 2018) (rok: 2018, ), Wydawca: Neuro-Oncology
    Data:
    konferencja 2018.06.30-2018.07.03
    Status:
    Published
  3. ALK expression at the protein level is a marker for the differentiation diagnosis of the WNT-activated type of pediatric medulloblastoma.
    Authors:
    Maria Łastowska; Joanna Trubicka; Magdalena Niemira; Magdalena Paczkowska-Abdulsalam; Agnieszka Karkucińska-Więckowska; Magdalena Kaleta; Monika Drogosiewicz; Magdalena Tarasińska; Marta Perek-Polnik; Adam Krętowski; Bożenna Dembowska-Bagińska; Wiesława Grajkowska; Maciej Pronicki; Ewa Matyja
    Conference:
    18th International Symposium on Pediatric Neuro-Oncology (ISPNO 2018) (rok: 2018, ), Wydawca: Neuro-Oncology
    Data:
    konferencja 2018.06.30-2018.07.03
    Status:
    Published
  4. Transcriptional profiling differentiates spinal cord ependymal tumours from other glial tumours in children
    Authors:
    A. Sobocińska, Magdalena Niemira, Anna Szałkowska, Bartosz Wojtaś, Joanna Trubicka, Wiesława Grajkowska , E. Matyja, M. Łastowska
    Conference:
    14th Meeting of the European Association of Neuro-Oncology (rok: 2019, ), Wydawca: Neuro-Oncology vol 21, Issue Supplement 3
    Data:
    konferencja 19-22.9.2019
    Status:
    Published
  5. ALK expression can differentiate the WNT-activated type of medulloblastoma from choroid plexus carcinoma and ependymoma.
    Authors:
    A.A. Sobocińska, J. Trubicka, A.Karkucińska-Więckowska, M. Kaleta, W. Grajkowska, E. Matyja, M. Łastowska
    Conference:
    18th International Symposium on Pediatric Neuro-Oncology (ISPNO 2018) (rok: 2018, ), Wydawca: Neuro-Oncology
    Data:
    konferencja 2018.06.30-2018.07.03
    Status:
    Published
  6. Germline mutations in MSH2 gene in pediatric patients with congenital and sporadic glioblastoma.
    Authors:
    Ejmont Maria, Rydzanicz Małgorzata, Grajkowska Wiesława, Perek-Polnik Marta, Sowińska Agnieszka, Kozłowska Magdalena, Łastowska Maria, Pronicki Maciej, Płoski Rafał, Dembowska-Bagińska Bożenna, Trubicka Joanna
    Conference:
    19th International Symposium on Pediatric Neuro-Oncology (ISPNO 2020) (rok: 2020, ), Wydawca: Oxford University Press
    Data:
    konferencja 2020.12.13-2020.12.16
    Status:
    Published

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy