Projects funded by the NCN


Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

Genetic and environmental determinants regulating biosynthesis of benzoxazinoids - key secondary metabolites of rye (Secale cereale L.)

2015/19/B/NZ9/00921

Keywords:

rye benzoxazinoids secondary metabolites gene expression indole allelopathy plant defense reactions

Descriptors:

  • NZ9_1: Agronomy
  • NZ2_1: Molecular genetics
  • NZ1_9: Biotechnology

Panel:

NZ9 - Fundamentals of applied life sciences and biotechnology: agricultural, forestry, horticulture, animal production and fishery, food and nutrition sciences, industrial biosciences, environmental biotechnology and remediation

Host institution :

Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie, Instytut Biologii

woj. mazowieckie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

prof. Monika Rakoczy-Trojanowska 

Number of co-investigators in the project: 8

Call: OPUS 10 - announced on 2015-09-15

Amount awarded: 821 400 PLN

Project start date (Y-m-d): 2016-07-04

Project end date (Y-m-d): 2020-07-03

Project duration:: 48 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Project description

Download the project description in a pdf file

Note - project descriptions were prepared by the authors of the applications themselves and placed in the system in an unchanged form.

Equipment purchased [PL]

  1. liofilizator z temperaturą kondensacji -85°C (74 000 PLN)
  2. waga laboratoryjna.
  3. Komputer z oprogramowaniem Windows Office (4 000 PLN)
  4. mini-wirówka.
  5. zestaw pipet nastawnych.
  6. termocykler do analiz PCR w czasie rzeczywistym (90 000 PLN)
  7. pipeta wielokanałowa sterowana ręcznie.
  8. lodówko-zamrażarka.
  9. pipety automatyczne (2 szt.) (12 000 PLN)
  10. zestaw pipet jednokanałowych sterowanych ręcznie.

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (7)
  • Articles in post-conference publications (8)
  1. Changes in benzoxazinoid contents and the expression of the associated genes in rye (Secale cereale L.) due to brown rust and the inoculation procedure
    Authors:
    Święcicka M, Dmochowska-Boguta M, Orczyk W, Grądzielewska A, Stochmal A, Kowalczyk M, Bolibok L, Rakoczy-Trojanowska M
    Academic press:
    PLoS ONE (rok: 2020, tom: 15(5), strony: e0233807), Wydawca: Public Library of Science
    Status:
    Published
  2. Chromosome-scale genome assembly provides insights into rye biology, evolution and agronomic potential
    Authors:
    Rabanus-Wallace MT, Hackauf B, …., Rakoczy-Trojanowska M, et al.
    Academic press:
    Nature Genetics (rok: 2021, tom: 53, strony: 564–573), Wydawca: Nature
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1038/s41588-021-00807-0 - link to the publication
  3. Co-cultivating rye with berseem clover affects benzoxazinoid production and expression of related genes
    Authors:
    Rakoczy-Trojanowska M, Święcicka M, Bakera B, Kowalczyk M, Stochmal A, Bolibok L
    Academic press:
    Crop Sci (rok: 2020, tom: 60, strony: 3228–3246), Wydawca: Wiley
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1002/csc2.20263 - link to the publication
  4. Genes ScBx1 and ScIgl – Competitors or Cooperators?
    Authors:
    Wlazło A., Święcicka M., Koter M.D., Krępski T., Bolibok L., Stochmal A., Kowalczyk M., Rakoczy-Trojanowska M.
    Academic press:
    Genes (rok: 2020, tom: 11223, strony: 45310), Wydawca: MDPI
    Status:
    Published
    DOI:
    10.3390/genes11020223 - link to the publication
  5. The roots of rye (Secale cereale L.) are capable of synthesizing benzoxazinoids
    Authors:
    Rakoczy-Trojanowska M, Szabała B, Różańska E, Kowalczyk M, Burza W, Bakera B, Święcicka M.
    Academic press:
    Int J Mol Sci (rok: 2021, tom: 22, strony: 4656), Wydawca: MDPI
    Status:
    Published
    DOI:
    10.3390/ijms22094656 - link to the publication
  6. Benzoxazinoids biosynthesis in rye (Secale cereale L.) is affected by low temperature
    Authors:
    Bakera B, Święecicka M, Stochmal A, Kowalczyk M, Bolibok L, Rakoczy-Trojanowska M
    Academic press:
    Agronomy (rok: 2020, tom: 10, strony: 1260), Wydawca: MDPI
    Status:
    Published
    DOI:
    10.3390/agronomy10091260 - link to the publication
  7. Identification and VIGS-based characterization of Bx1 ortholog in rye (Secale cereale L.).
    Authors:
    3.Groszyk J., Kowalczyk M., Yanushevska Y., Stochmal A., Rakoczy-Trojanowska M.,Orczyk W.
    Academic press:
    PLoS One (rok: 2017, tom: 12(2), strony: e0171506), Wydawca: Zhong-Hua Chen, University of Western Sydney, AUSTRALIA
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1371/journal.pone.0171506 - link to the publication
  1. Genetic and environmental determinants regulating benzoxazinoid biosynthesis in rye (Secale cereale L) - facts and myths.
    Authors:
    Rakoczy-Trojanowska M. (invited speaker), Święcicka M., Bakera B., Wlazło A.
    Conference:
    Integrative Plant Biology IPG PAS Conference (rok: 2018, ), Wydawca: Instytut Genetyki Roślin
    Data:
    konferencja 7-9 listopad
    Status:
    Published
  2. Geny ScBx1 i ScIgl — współpracownicy czy współzawodnicy?
    Authors:
    Anna Wlazło, Magdalena Święcicka, Monika Rakoczy-Trojanowska
    Conference:
    XIV Ogólnopolska Konferencja Naukowa "Nauka dla hodowli i nasiennictwa roślin uprawnych". (rok: 2019, ), Wydawca: IHAR
    Data:
    konferencja 5-8 luty
    Status:
    Published
  3. New aspects of the genetic background of benzoxazinoid biosynthesis in rye (Secale cereale L.).
    Authors:
    Rakoczy-Trojanowska M., Święcicka M., Rymuszka J., Stochmal A., Kowalczyk M.
    Conference:
    "Breeding cereals for sustainable agriculture, Eucarpia cereal section / IWIW2 meeting (rok: 2018, ), Wydawca: Thierry LANGIN, Gilles CHARMET, Jacques LE GOUIS & Philippe LEROY UMR INRA/UCA 1095 GDEC - 5 chemin de Beaulieu - 63000 CLERMONT-FERRAND - FRANCE
    Data:
    konferencja 18-22 marzec
    Status:
    Published
  4. Benzoksazynoidy – skuteczna broń żyta przeciwko stresom biotycznym i abiotycznym
    Authors:
    Rakoczy-Trojanowska M., Bakera B., Wlazło A., Dmochowska-Boguta M., Orczyk W., Kowalczyk M., Stochmal A., Święcicka M.
    Conference:
    XIV Ogólnopolska Konferencja Naukowa "Nauka dla hodowli i nasiennictwa roślin uprawnych". (rok: 2019, ), Wydawca: IHAR
    Data:
    konferencja 5-8.02.2019
    Status:
    Published
  5. Biosynthesis of benzoxazinoids in rye (Secale cereale L.) – where this story begins?
    Authors:
    Rakoczy-Trojanowska M.
    Conference:
    5th Conference on Cereal Biotechnology and Breeding, EUCARPIA (rok: 2019, ), Wydawca: EUCARPIA, ISBN 978-963-454-489-0
    Data:
    konferencja 4-7 November 2019
    Status:
    Published
  6. Genetyczne podłoże biosyntezy benzoksazynoidów żyta zwyczajnego (Secale cereale L.). Charakterystyka ekspresji genów ScBx w warunkach stresu podwyższonego zasolenia.
    Authors:
    Bakera B., Rakoczy-Trojanowska M.
    Conference:
    IV Krajowa Konferencja pt. "Naturalne substancje roślinne – aspekty strukturalne i aplikacyjne (rok: 2017, ), Wydawca: IUNG Puławy
    Data:
    konferencja 6-8 września 2017 r.
    Status:
    Published
  7. Nieznane aspekty genetycznego podłoza biosyntezy benzoksazynoidów - kluczowych metabolitów wtórnych żyta (Secale cereale L.)
    Authors:
    Rakoczy-Trojanowska M, Makowska B, Bakera B
    Conference:
    XIII Ogólnopolska Konferencja Naukowa "Nauka dla hodowli i nasiennictwa roślin uprawnych" (rok: 2017, ), Wydawca: IHAR
    Data:
    konferencja 31.01 - 3.02.2017
    Status:
    Published
  8. Genetyczne i środowiskowe uwarunkowania biosyntezy benzoksazynoidów u żyta zwyczajnego (Secale cereale L.).
    Authors:
    Rakoczy-Trojanowska M., Święcicka M., Bakera B., Stochmal A., Kowalczyk M.
    Conference:
    Ogólnopolska Konferencja Naukowa "Genetyka, hodowla i biotechnologia roślin – osiągnięcia, wyzwania, perspektywy (rok: 2018, ), Wydawca: Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie
    Data:
    konferencja 25-27 czerwiec
    Status:
    Published