Projects funded by the NCN

Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

Interdisciplinary studies into molecular mechanisms of conformational transitions underlying GABAA receptor activation

2015/18/A/NZ1/00395

Keywords:

GABAA receptor kinetics gating structure-function relationship mutagenesis patch-clamp ultrarapid applications molecular dynamics

Descriptors:

  • NZ1_3: Biophysics
  • NZ3_7: Signal transduction
  • NZ1_4: Structural biology

Panel:

NZ1 - Molecular biology, structural biology, biotechnology: molecular biology, structural biology, biotechnology

Host institution :

Uniwersytet Medyczny im. Piastów Śląskich we Wrocławiu, Wydział Lekarski

woj. dolnośląskie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

prof. Jerzy Mozrzymas 

Number of co-investigators in the project: 6

Call: MAESTRO 7 - announced on 2015-06-15

Amount awarded: 2 984 920 PLN

Project start date (Y-m-d): 2016-05-27

Project end date (Y-m-d): 2022-05-26

Project duration:: 72 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Project description

Download the project description in a pdf file

Note - project descriptions were prepared by the authors of the applications themselves and placed in the system in an unchanged form.

Equipment purchased [PL]

  1. Elektrofizjologiczne stanowisko do nieskoszumowych pomiarów aktywnosci pojedynczych kanalow (330 000 PLN)
  2. Fotometr do biologii molekularnej (np. Eppendorf BioPhotometer) (25 000 PLN)
  3. Komputer osobisty z dwoma monitorami LCD (6 000 PLN)
  4. System do elektroforezy poziomej (np. Mini-Sub-Cell GT System Bio-rad) (3 000 PLN)
  5. UPS wysokiej mocy do rekonstrukcji czystego zasilania (230 V, 50 Hz) z baterii dla stanowiska do pomiarów pojedynczych kanalów (15 000 PLN)
  6. Mikromanipulator elektroniczny do pomiarów elektrofizjologicznych wraz z platformą do mocowania preparatów oraz mikromanipulatora w pomiarach patch clamp.
  7. Mikroskop odwrócony do badań elektrofizjologicznych wyposażony w kamerę do obrazowania fluorescencji oraz niskoszumowe źródło wzbudzenia fluorescencji światłem LED.
  8. Komputer osobisty z monitorem LCD (4 000 PLN)
  9. Oprogramowanie MS Office Professional (3 sztuki).
  10. Przenosny komputer (4 000 PLN)
  11. Sterylizator na suche powietrze (np. Memmert SNB 400 Basic) (6 000 PLN)
  12. Termocykler (np. MJ PTC-200) (35 000 PLN)
  13. Komora laminarna (np. Aura Vertical SD4, Bioair/Euroclone) (35 000 PLN)
  14. Licencja AVAST na 3 lata (3 sztuki).
  15. System dokumantacji żelów Gel-doc (np. Gel Doc XR System, Bio-rad) (45 000 PLN)
  16. Wirówka z chłodzeniem i z wymiennymi rotorami (np. MPW-350R) (20 000 PLN)
  17. Łaźnia wodna z termostatem ( np. WNB 10 Memmert Basic) (4 000 PLN)
  18. System oczyszczania wody Millipore Synergy Ultrapure Water Systems (15 000 PLN)
  19. Termomisker z termoblokiem (np. bioSan TS-100) (5 000 PLN)
  20. Zamrażarka niskotemperaturowa do -86°C (np. SANYO MDF-U54V) (55 000 PLN)

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (13)
  • Articles in post-conference publications (20)
  1. GABAA receptor β2E155 residue located at the agonist-binding site is involved in the receptor gating.
    Authors:
    Magdalena Jatczak-Śliwa, Magdalena Kisiel, Marta Magdalena Czyżewska, Marek Brodzki, Jerzy Władysław Mozrzymas
    Academic press:
    Frontiers in Cellular Neuroscience (rok: 2020, tom: 14, strony: 2), Wydawca: Frontiers
    Status:
    Published
    DOI:
    10.3389/fncel.2020.00002 - link to the publication
  2. Glycine substitution of α1F64 residue at the loop D of GABA A receptor impairs gating - Implications for importance of binding site-channel gate linker rigidity
    Authors:
    Karol Kłopotowski, Marta M Czyżewska, Jerzy W Mozrzymas
    Academic press:
    Biochemical Pharmacology (rok: 2021, tom: 192, strony: 114668), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.bcp.2021.114668 - link to the publication
  3. The β2 subunit E155 residue as a proton sensor at the binding site on GABA type A receptors
    Authors:
    Michał A Michałowski, Marta M Czyżewska, Ilona Iżykowska, Jerzy W Mozrzymas
    Academic press:
    European Journal of Pharmacology (rok: 2021, tom: 906, strony: 174293), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.ejphar.2021.174293 - link to the publication
  4. Binding site opening by loop C shift and chloride ion-pore interaction in the GABA A receptor model.
    Authors:
    Michałowski, M. A., Kraszewski, S., & Mozrzymas, J. W.
    Academic press:
    Physical Chemistry Chemical Physics (rok: 2017, tom: 13664-13678, strony: 19), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1039/C7CP00582B - link to the publication
  5. GABAA receptor proline 273 at the interdomain interface of the β2 subunit regulates entry into desensitization and opening/closing transitions.
    Authors:
    Brodzki M., Mozrzymas, J. W.
    Academic press:
    Life Sciences (rok: 2022, tom: 308, strony: 10), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.lfs.2022.120943 - link to the publication
  6. Mutations of α1F45 residue of GABAA receptor loop G reveal its involvement in agonist binding and channel opening/closing transitions
    Authors:
    Marek Brodzki, Michał A. Michałowski, Michalina Gos, Jerzy W. Mozrzymas
    Academic press:
    Biochemical Pharmacology (rok: 2020, tom: 177, strony: 113917), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.bcp.2020.113917 - link to the publication
  7. α 1 Subunit Histidine 55 at the Interface between Extracellular and Transmembrane Domains Affects Preactivation and Desensitization of the GABA A Receptor
    Authors:
    Przemyslaw T Kaczor, Aleksandra D Wolska, Jerzy W Mozrzymas
    Academic press:
    ACS Chemical Neuroscience (rok: 2021, tom: 12, strony: 562-572), Wydawca: ACS Publications
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1021/acschemneuro.0c00781 - link to the publication
  8. α1 Proline 277 Residues Regulate GABAAR Gating through M2-M3 Loop Interaction in the Interface Region
    Authors:
    Przemyslaw T Kaczor 1, Michał A Michałowski 1, Jerzy W Mozrzymas 1
    Academic press:
    ACS Chemical Neuroscience (rok: 2022, tom: -, strony: 13), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1021/acschemneuro.2c00401 - link to the publication
  9. Distinct Modulation of Spontaneous and GABA-Evoked Gating by Flurazepam Shapes Cross-Talk Between Agonist-Free and Liganded GABAA Receptor Activity
    Authors:
    Jatczak-Śliwa M, Terejko K, Brodzki M, Michałowski MA, Czyzewska MM, Nowicka JM, Andrzejczak A, Srinivasan R, Mozrzymas JW
    Academic press:
    Frontiers in Cellular Neuroscience (rok: 2018, tom: 12, strony: 18), Wydawca: Frontiers
    Status:
    Published
    DOI:
    10.3389/fncel.2018.00237 - link to the publication
  10. Protons modulate gating of recombinant α1β2γ2 GABAA receptor by affecting desensitization and opening transitions
    Authors:
    Kisiel M, Jatczak-Śliwa M, Mozrzymas JW
    Academic press:
    Neuropharmacology (rok: 2019, tom: 146, strony: 300-315), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
    DOI:
    10.016 - link to the publication
  11. Interaction between GABAA receptor α1 and β2 subunits at the N-terminal peripheral regions is crucial for receptor binding and gating.
    Authors:
    Katarzyna Terejko, Michał A. Michałowski, Anna Dominik, Anna Andrzejczak, Jerzy W. Mozrzymas
    Academic press:
    Biochemical Pharmacology (rok: 2021, tom: 183, strony: 114338), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.bcp.2020.114338 - link to the publication
  12. Mutations at the M2 and M3 Transmembrane Helices of the GABA A Rs α 1 and β 2 Subunits Affect Primarily Late Gating Transitions Including Opening/Closing and Desensitization
    Authors:
    Katarzyna Terejko, Michał A Michałowski, Ilona Iżykowska, Anna Dominik, Aleksandra Brzóstowicz, Jerzy W Mozrzymas
    Academic press:
    ACS Chemical Neuroscience (rok: 2021, tom: 12, strony: 2421-2436), Wydawca: ACS Chemical Neuroscience
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1021/acschemneuro.1c00151 - link to the publication
  13. The C loop at the orthosteric binding site is critically involved in GABAA receptor gating
    Authors:
    Katarzyna Terejko, Przemysław T. Kaczor, Michał A. Michałowski, Agnieszka Dąbrowska, Jerzy W. Mozrzymas
    Academic press:
    Neuropharmacology (rok: 2020, tom: 166, strony: 107903), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.neuropharm.2019.107903 - link to the publication
  1. Desensitization and channel conductance of the GABA type A receptors depends on electrostatic interactions in the top part of the ion pore
    Authors:
    Michalowski M., Terejko K., Gos M., Czyżewska M., Mozrzymas J.
    Conference:
    66th Biophysical Society Annual Meeting BPS 2022 (rok: 2022, ), Wydawca: Elsevier
    Data:
    konferencja 19-23.02.2022
    Status:
    Published
  2. Extracellular domain intersubunit interaction of aromatic residues αF14 and βF31 substantially modulates GABAAR gating.
    Authors:
    Terejko K, Michałowski M.A., Dominik A., Andrzejczak A., Mozrzymas J.W.
    Conference:
    Neuronus 2020 IBRO NEUROSCIENCE FORUM (rok: 2020, ), Wydawca: Uniwersytet Jagielloński
    Data:
    konferencja 8-11.12
    Status:
    Published
  3. Refer analysis of α1β2γ2 GABA type a receptor suggests a slight phase shift between principal and complementary subunits at the extracellular domain upon channel activation
    Authors:
    Mozrzymas J.W, Michalowski M., Terejko K., Brodzki M., Kaczor P.
    Conference:
    66th Biophysical Society Annual Meeting BPS 2022 (rok: 2022, ), Wydawca: Elsevier
    Data:
    konferencja 19-23.02.2022
    Status:
    Published
  4. GABA and P4S Binding Site Interactions in α1β2γ2 GABAAR Novel Homology Model Compared to Crystal Structure of Benzamidine Bound β3 Homopentamer GABAAR
    Authors:
    Michał A. Michałowski, Jerzy W. Mozrzymas
    Conference:
    7th Conference Aspects of Neuroscience (rok: 2017, ), Wydawca: Wydział Biologii Uniwersytetu Warszawskiego
    Data:
    konferencja 24-26.11.2017
    Status:
    Published
  5. LOOP G OF THE GABAAR ORTHOSTERIC BINDING SITE IS INVOLVED BOTH IN BINDING AND GATING PROCESSES
    Authors:
    Marek Brodzki, Michal A. Michalowski, Jerzy W. Mozrzymas
    Conference:
    Biophysical Society Annual Meeting 2019 (rok: 2019, ), Wydawca: Biophysical Journal
    Data:
    konferencja 2019-03-02 - 2019-03-06
    Status:
    Published
  6. Rola B2F200 w obrębie struktury pętli C receptora GABAA w etapie wiązania ligandu i bramkowania
    Authors:
    Terejko K., Dąbrowska A., Mozrzymas J.W.
    Conference:
    IX Sympozjum Współczesna myśl techniczna w naukach medycznych i biologicznych (rok: 2018, ), Wydawca: Polska Akademia Nauk Oddział we Wrocławiu
    Data:
    konferencja 22-23.06
    Status:
    Published
  7. Complex effect of benzodiazepines on GABAA receptor mechanism of activation
    Authors:
    Terejko K., Jatczak-Śliwa M., Brodzki M., Czyżewska M., Michałowski M., Nowicka J., Andrzejczak
    Conference:
    Neuronus 2018 IBRO NEUROSCIENCE FORUM (rok: 2018, ), Wydawca: Neuronus 2018 IBRO NEUROSCIENCE FORUM
    Data:
    konferencja 20-22.04
    Status:
    Published
    DOI:
    link to the publication
  8. Important role of glutamate 155 of the GABAA receptor beta2 subunit in the mechanism of GABAA receptor activation
    Authors:
    Jatczak M., Brodzki M., Kisiel M., Czyżewska M. M., Mozrzymas J. W.
    Conference:
    7th Conference Aspects of Neuroscience (rok: 2017, ), Wydawca: Wydział Biologii Uniwersytetu Warszawskiego
    Data:
    konferencja 24-26.11.2017
    Status:
    Published
  9. Loop G of the GABAA receptor orthosteric binding site is involved in final stages of channel gating
    Authors:
    Marek Brodzki, Michal A. Michalowski, Michalina Gos, Jerzy W. Mozrzymas
    Conference:
    14th International Congress of the Polish Neuroscience Society (rok: 2019, ), Wydawca: Polish Neuroscience Society
    Data:
    konferencja 2019-08-28 - 2019-08-30
    Status:
    Published
  10. Robust impact of flurazepam on spontaneous activity of GABAA receptors indicates modulation of gating transitions by benzodiazepines
    Authors:
    Brodzki M, Jatczak-Śliwa M., Terejko K., Michałowski M., Nowicka J., Andrzejczak A., Srinivasan R., Mozrzymas J.W
    Conference:
    11th FENS Forum of Neuroscience (rok: 2018, ), Wydawca: Federation of European Neuroscience Societies
    Data:
    konferencja 07-11.07
    Status:
    Published
  11. Struktura pętli C oraz jej rola w procesie bramkowania i wiązania ligandu w receptorze GABAA
    Authors:
    Michałowski M.M., Terejko K., Mozrzymas J.W.
    Conference:
    IX Sympozjum Współczesna myśl techniczna w naukach medycznych i biologicznych (rok: 2018, ), Wydawca: Polska Akademia Nauk Oddział we Wrocławiu
    Data:
    konferencja 22-23.06
    Status:
    Published
  12. DISTINCT MECHANISMS OF FLURAZEPAM MODULATION OF RECEPTOR GATING OF SPONTANEOUS AND AGONIST‑EVOKED ACTIVITY OF GABAA RECEPTORS
    Authors:
    Jatczak-Śliwa M, Terejko K, Brodzki M, Michałowski MA, Czyzewska MM, Nowicka JM, Andrzejczak A, Rakenduvadhana S, Mozrzymas JW
    Conference:
    11th Conference on electrophysiological techniques in bioelectricity research (rok: 2018, ), Wydawca: Instytut Biologii Eksperymentalnej im. Nenckiego
    Data:
    konferencja 25-26.05
    Status:
    Published
  13. Flurazepam enhances spontaneous activity of α1β2γ2L GABAA receptors, both wild-type and mutated at the α1F64 residue in the agonist binding site
    Authors:
    K. Terejko, M. Jatczak, M. Brodzki, A. Andrzejczak, J. Nowicka, J.W. Mozrzymas
    Conference:
    7th Conference Aspects of Neuroscience (rok: 2017, ), Wydawca: Wydział Biologii Uniwersytetu Warszawskiego
    Data:
    konferencja 24-26.11.2017
    Status:
    Published
  14. Flurazepam modulationation of GABAA receptor gating depends of the receptor ligation
    Authors:
    Jatczak-Śliwa M, Terejko K, Brodzki M, Michałowski MA, Czyzewska MM, Nowicka JM, Andrzejczak A, Rakenduvadhana S, Mozrzymas JW
    Conference:
    Society for Neuroscience 2018 (rok: 2018, ), Wydawca: Society for Neuroscience
    Data:
    konferencja 03-07.11
    Status:
    Published
  15. GABAA β2 subunit loop C shapes binding and gating properties of receptor activation
    Authors:
    Terejko K., Kaczor P. T., Michałowski M. A., Dąbrowska A., Mozrzymas J.W.
    Conference:
    14th International Congress of the Polish Neuroscience Society (rok: 2019, ), Wydawca: Polish Neuroscience Society
    Data:
    konferencja 28-30.08
    Status:
    Published
  16. GABAA Receptor Binding Site Involvement in Modulation by Protons.
    Authors:
    Michał A. Michałowski, Marta M. Czyżewska, Jerzy W. Mozrzymas
    Conference:
    Neuronus 2020 IBRO NEUROSCIENCE FORUM (rok: 2020, ), Wydawca: Uniwersytet Jagielloński
    Data:
    konferencja 8-11.12
    Status:
    Published
  17. Intersubunit interactions mediated by loop C and F movement and anion interaction site in shut α1β2γ2 GABAA receptor homology model.
    Authors:
    M. A. Michałowski, S. Kraszewski, J. W. Mozrzymas
    Conference:
    FENS Regional Meeting 2017 (rok: 2017, ), Wydawca: FENS Regional Meeting 2017
    Data:
    konferencja 20-23.09.2017
    Status:
    Published
  18. Modulacja aktywności receptora GABAA przez flurazepam
    Authors:
    Jatczak-Śliwa M, Terejko K, Brodzki M, Michałowski MA, Czyzewska MM, Nowicka JM, Andrzejczak A, Rakenduvadhana S, Mozrzymas JW
    Conference:
    IX Sympozjum Współczesna Myśl Techniczna w Naukach Medycznych i Biologicznych (rok: 2018, ), Wydawca: Polska Akademia Nauk Oddział we Wrocławiu
    Data:
    konferencja 22-23.06
    Status:
    Published
  19. Mutation at the GABAA receptor binding site β2E155 residue affects mechanizm of GABAA receptor activation
    Authors:
    Jatczak M, Kisiel M, Czyżewska MM, Brodzki M, Czajkowski C, Mozrzymas JW
    Conference:
    FENS Regional Meeting 2017 (rok: 2017, ), Wydawca: FENS Regional Meeting 2017
    Data:
    konferencja 20-23.09.2017
    Status:
    Published
  20. Point mutation at beta2 subunit loop C (F200) affects both binding and gating of the GABAA receptor
    Authors:
    Terejko K., Michałowski M., Dąbrowska A.
    Conference:
    8th Conference Aspects of Neuroscience (rok: 2018, ), Wydawca: 2018 Aspects of Neuroscience Conference materials
    Data:
    konferencja 23-25.11
    Status:
    Published
    DOI:
    link to the publication

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy