Projects funded by the NCN

Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

Insight into biochemistry, structure, evolution and biology of bacterial serpins on example of miropin from human pathogen Tannerella forsythia.

2015/17/B/NZ1/00666

Keywords:

periodontitis Tannerella forsythia bacterial serpins miropin inhibition of serine and cysteine proteases

Descriptors:

  • NZ1_2: Biochemistry
  • NZ1_1: Molecular biology

Panel:

NZ1 - Molecular biology, structural biology, biotechnology: molecular biology, structural biology, biotechnology

Host institution :

Uniwersytet Jagielloński, Małopolskie Centrum Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego

woj. małopolskie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

dr Mirosław Książek 

Number of co-investigators in the project: 3

Call: OPUS 9 - announced on 2015-03-16

Amount awarded: 1 255 700 PLN

Project start date (Y-m-d): 2016-02-04

Project end date (Y-m-d): 2019-12-03

Project duration:: 46 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Project description

Download the project description in a pdf file

Note - project descriptions were prepared by the authors of the applications themselves and placed in the system in an unchanged form.

Equipment purchased [PL]

  1. Komputer niestacjonarny typu laptop.
  2. Mieszadło magentyczne (3 szt.) (7 950 PLN)
  3. Oprogramowanie do analizy sekwencji DNA Lasergene (DNAStar).
  4. Termoblok z wymiennymi blokami grzejnymi (7 000 PLN)
  5. Horyzontalny zestaw do elektroforezy żeli agarozowych (2 400 PLN)
  6. Zestaw do elektroforezy w żelach poliakrylamidowych (2 szt.) (18 500 PLN)
  7. Zamrażarka -20oC (5 000 PLN)
  8. Lodówka (6 000 PLN)
  9. Mała cieplarka laboratoryjna (5 750 PLN)
  10. Poręczny homogenizator laboratoryjny (10 500 PLN)
  11. Spektrofotometryczny czytnik mikropłytek z laptopem sterującym.
  12. Termomikser z blokami na probówki 1.5, 2 ml i płytki (19 000 PLN)
  13. Prosty worteks laboratoryjny (2 szt.) (1 600 PLN)
  14. Wirówka z zestawem rotorów (60 000 PLN)
  15. Zestaw do elektrotransferu "mokrego" (2 szt.) (14 000 PLN)

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (6)
  1. Structure-based mechanism of cysteine-switch latency and of catalysis by pappalysin-family metallopeptidases
    Authors:
    Tibisay Guevara, Arturo Rodriguez-Banqueri, Miroslaw Ksiazek, Jan Potempa, F. Xavier Gomis-Rüth
    Academic press:
    IUCrJ (rok: 2020, tom: 7, strony: 18-29), Wydawca: International Union of Crystallography (IUCr)
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1107/S2052252519013848 - link to the publication
  2. A structure-derived snap-trap mechanism of a multispecific serpin from the dysbiotic human oral microbiome
    Authors:
    Goulas T, Ksiazek M (równorzędny I autor), Garcia-Ferrer I, Sochaj-Gregorczyk AM, Waligorska I, Wasylewski M, Potempa J, Gomis-Rüth FX
    Academic press:
    Journal of Biological Chemistry (rok: 2017, tom: 292(26), strony: 10883-10898), Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular Biology
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1074/jbc.M117.786533 - link to the publication
  3. Structural and functional probing of PorZ, an essential bacterial surface component of the type-IX secretion system of human oral-microbiomic Porphyromonas gingivalis.
    Authors:
    Lasica AM, Goulas T, Mizgalska D, Zhou X, de Diego I, Ksiazek M, Madej M, Guo Y, Guevara T, Nowak M, Potempa B, Goel A, Sztukowska M, Prabhakar AT, Bzowska M, Widziolek M, Thøgersen IB, Enghild JJ, Simonian M, Kulczyk AW, Nguyen KA, Potempa J, Gomis-Rüth FX.
    Academic press:
    Scientific reports (rok: 2016, tom: 6, strony: 37708), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1038/srep37708 - link to the publication
  4. Structural determinants of inhibition of Porphyromonas gingivalis gingipain K by KYT-36, a potent, selective, and bioavailable peptidase inhibitor.
    Authors:
    Guevara T, Rodríguez-Banqueri A, Lasica AM, Ksiazek M, Potempa BA, Potempa J, Gomis-Rüth FX
    Academic press:
    Scientific reports (rok: 2019, tom: 9, strony: 4935), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1038/s41598-019-41354-3 - link to the publication
  5. Plasmin inhibition by bacterial serpin: Implications in gum disease.
    Authors:
    Sochaj-Gregorczyk A, Ksiazek M (równorzędny I autor; autor korespondencyjny), Waligorska I, Straczek A, Benedyk M, Mizgalska D, Thøgersen IB, Enghild JJ, Potempa J
    Academic press:
    FASEB J (rok: 2020, tom: 34, strony: 619-630), Wydawca: Wiley
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1096/fj.201901490RR - link to the publication
  6. Mirolysin, a LysargiNase from Tannerella forsythia, proteolytically inactivates the human cathelicidin, LL-37.
    Authors:
    Lahari Koneru, Miroslaw Ksiazek (równorzędny I autor; autor korespondencyjny), Irena Waligorska, Anna Straczek, Magdalena Lukasik, Mariusz Madej, Ida B. Thøgersen, Jan J. Enghild and Jan Potempa
    Academic press:
    Biological Chemistry (rok: 2017, tom: 398(3), strony: 365-409), Wydawca: De Gruyter
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1515/hsz-2016-0267 - link to the publication

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy