Projects funded by the NCN

Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

Influence of selection on a crop plant genome - identification and characterization of sequences targeted by domestication and breeding in rye (Secale cereale L.).

2014/14/E/NZ9/00285

Keywords:

rye structural genomic NGS genotyping DArT genetic diversity genetic map selection pressure

Descriptors:

  • NZ2_2:
  • NZ9_12:
  • NZ9_1:

Panel:

NZ9 - Fundamentals of applied life sciences and biotechnology: agricultural, forestry, horticulture, animal production and fishery, food and nutrition sciences, industrial biosciences, environmental biotechnology and remediation

Host institution :

Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie, Wydział Ogrodnictwa, Biotechnologii i Architektury Krajobrazu

woj. mazowieckie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

dr hab. Hanna Elżbieta Bolibok-Brągoszewska 

Number of co-investigators in the project: 4

Call: SONATA BIS 4 - announced on 2014-06-16

Amount awarded: 1 834 141 PLN

Project start date (Y-m-d): 2015-06-03

Project end date (Y-m-d): 2022-12-02

Project duration:: 90 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Equipment purchased [PL]

  1. komputer z oprogramowaniem Windows Office (4 szt.) (18 000 PLN)
  2. zamrażarka (-20 stopni C) (3 000 PLN)
  3. zestaw pipet (3 szt.) (16 500 PLN)
  4. lodówka (2 500 PLN)

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (4)
  • Articles in post-conference publications (9)
  1. Deep sampling and pooled amplicon sequencing reveals hidden genic variation in heterogeneous rye accessions
    Authors:
    Anna Hawliczek, Leszek Bolibok, Katarzyna Tofil, Ewa Borzęcka, Joanna Jankowicz-Cieślak, Piotr Gawroński, Adam Kral, Bradley J. Till, Hanna Bolibok-Brągoszewska
    Academic press:
    BMC Genomics (rok: 2020, tom: 21, strony: nie dotyczy), Wydawca: BioMed Central Ltd/Springer Nature
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1186/s12864-020-07240-3 - link to the publication
  2. Chromosome-scale genome assembly provides insights into rye biology, evolution and agronomic potential
    Authors:
    Timothy Rabanus-Wallace, M; Hackauf, Bernd; Mascher, Martin; Lux, Thomas; Wicker, Thomas; Gundlach, Heidrun; Baez, Mariana; Houben, Andreas; X Mayer, Klaus F; Guo, Liangliang; Poland, Jesse Pozniak, Curtis J; Walkowiak, Sean; Melonek, Joanna; Praz, Coraline R; Schreiber, Mona; Budak, Hikmet; Heuberger, Matthias; Steuernagel, Burkhard; Wulff, Brande; Börner, Andreas ;Byrns, Brook ;Čížková, Jana; Brian Fowler, D; Fritz, Allan; Himmelbach, Axel; Kaithakottil, Gemy; Keilwagen, Jens; Keller, Beat; Konkin, David; Larsen, Jamie; Li, Qiang; Myśków, Beata; Padmarasu, Sudharsan; Rawat, Nidhi; Sesiz, Uğur; Biyiklioglu-Kaya, Sezgi; Sharpe, Andy; Šimková, Hana; Small, Ian; Swarbreck, David; Toegelová, Helena; Tsvetkova, Natalia; Voylokov, Anatoly V ;Vrána, Jan; Bauer, Eva; Bolibok-Bragoszewska, Hanna; Doležel, Jaroslav; Hall, Anthony; Jia, Jizeng; Korzun, Viktor; Laroche, André; Ma, Xue-Feng; Ordon, Frank; Özkan, Hakan; Rakoczy-Trojanowska, Monika; Scholz, Uwe; Schulman, Alan H; Siekmann, Dörthe; Stojałowski, Stefa;n Tiwari, Vijay K; Spannagl, Manuel; Stein, Nils
    Academic press:
    Nature Genetics (rok: 2021, tom: 53, strony: 564-573), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1038/s41588-021-00807-0 - link to the publication
  3. Selective sweeps identification in distinct groups of cultivated rye (Secale cereale L.) germplasm provides potential candidate genes for crop improvement.
    Authors:
    Anna Hawliczek, Ewa Borzęcka, Katarzyna Tofil, Nikolaos Alachiotis, Leszek Bolibok, Piotr Gawroński, Dörthe Siekmann, Bernd Hackauf, Roman Dušinský, Miroslav Švec, Hanna Bolibok-Brągoszewska
    Academic press:
    BMC Plant Biology (rok: 2023, tom: 23, strony: 323), Wydawca: SpringerNature
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1186/s12870-023-04337-1 - link to the publication
  4. Effective BAC clone anchoring with genotyping-by-sequencig and Diveristy Arrays Technology in a large genome cereal rye
    Authors:
    Ewa Borzęcka, Anna Hawliczek-Strulak, Leszek Bolibok, Piotr Gawroński, Katarzyna Tofil, Paweł Milczarski, Stefan Stojałowski, Beata Myśków, Małgorzata Tagońska-Karasek, Agnieszka Grądzielewska, Miłosz Smolik, Andrzej Kilian, Hanna Bolibok-Brągoszewska
    Academic press:
    Scientific Reports (rok: 2018, tom: 8, strony: 8428), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1038/s41598-018-26541-y - link to the publication
  1. Insights into influence of domestication and selection on the rye (Secale L.) genome based on GBS genotyping of diverse accessions with different origin and improvement status
    Authors:
    Anna Hawliczek, Ewa Borzęcka, Nikolaos Alachiotis, Katarzyna Tofil, Piotr Gawroński, Dörthe Siekmann, Bernd Hackauf, Roman Dušinský, Miroslav Švec, Hanna Bolibok-Brągoszewska
    Conference:
    5th Conference on Cereal Biotechnology and Breeding (rok: 2019, ), Wydawca: AKJournals AkCongress
    Data:
    konferencja 4-7 November
    Status:
    Published
  2. Identyfikacja śladów presji selekcyjnej w genomach form żyta o różnym pochodzeniu i stopniu ulepszenia
    Authors:
    Hawliczek A, Borzecka E, Alachiotis A, Tofil K, Gawroński P, Siekman D, Hackakuf B, Dusinsky R, Svec M, Bolibok-Bragoszewska H
    Conference:
    Genetyka aplikacyjna roślin - wyzwania XXI wieku (rok: 2021, ), Wydawca: KGHiBR SGGW
    Data:
    konferencja 22-24.09.
    Status:
    Published
  3. Development of an efficient Ecotilling protocol for rye
    Authors:
    Hawliczek-Strulak A, Till B, Jankowicz-Cieślak J, Borzęcka E, Tofil K, Kral A, Bolibok-Brągoszewska H
    Conference:
    8th International Triticeae Symposium (rok: 2017, ), Wydawca: Helmut Knupffer
    Data:
    konferencja June 12-16
    Status:
    Published
  4. Development of genomics resources in a large-genome non-model species Secale cereale L
    Authors:
    Bolibok-Brągoszewska H, Gawroński P, Hawliczek-Strulak A, Borzęcka E, Tofil K, Pawełkowicz M, Schmittner K, Ringauf A, Plader W
    Conference:
    Polski Kongres Genetyki (rok: 2016, ), Wydawca: Polskie Towarzystwo Genetyczne
    Data:
    konferencja 19-22 września
    Status:
    Published
  5. Markery molekularne nowej generacji w genomice żyta
    Authors:
    Hanna Bolibok-Brągoszewska, Anna Hawliczek-Strulak, Ewa Borzęcka, Katarzyna Tofil
    Conference:
    Nowe osiągnięcia polskich zespołów badawczych w dziedzinie genetyki, hodowli i biotechnologii roślin (rok: 2016, ), Wydawca: Wydział Kształtowania Środowiska i Rolnictwa, Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny
    Data:
    konferencja 8-10 czerwca
    Status:
    Published
  6. Analiza genetycznego zróznicowania wewnątrz-i miedzyodmianowego u żyta z różnych obszarów geograficznych
    Authors:
    Kutlug Onal I, Kielak O, Hawliczek A, Abuya H, Droszcz M, Ur Rehman S, Bolibok-BragoszewskaH
    Conference:
    Konferencja Naukowa "Genetyka Aplikacyjna Roślin - wyzwania XXI wieku" (rok: 2021, ), Wydawca: SGGW KGHiBR
    Data:
    konferencja 22-24.09.
    Status:
    Published
  7. Wysokoprzepustowe sekwencjonowanie w ocenie zróżnicowania genów oraz w identyfikacji ich funkcjonalnych wariantów
    Authors:
    ANNA HAWLICZEK, BRADLEY TILL, JOANNA JANKOWICZ-CIEŚLAK, EWA BORZĘCKA, KATARZYNA TOFIL, ADAM KRAL, HANNA BOLIBOK-BRĄGOSZEWSKA
    Conference:
    XIV OGÓLNOPOLSKA KONFERENCJA NAUKOWA NAUKA DLA HODOWLI I NASIENNICTWA ROŚLIN UPRAWNYCH ZAKOPANE, 5.02 — 8.02.2019r. (rok: 2019, ), Wydawca: INSTYTUT HODOWLI I AKLIMATYZACJI ROŚLIN PAŃSTWOWY INSTYTUT BADAWCZY
    Data:
    konferencja 5.02 — 8.02.2019
    Status:
    Published
  8. High-throughput anchoring of BAC clones to a rye genetic map using DArTseq technology
    Authors:
    Borzęcka E, Hawliczek-Strulak A, Tofli K, Gawroński P, Bolibok-Brągoszewska H
    Conference:
    8th International Triticeae Symposium (rok: 2017, ), Wydawca: Helmut Knupfer
    Data:
    konferencja June 12-16
    Status:
    Published
  9. Biblioteka BAC i technologia Oxford Nanopore w poszukiwaniu genów warunkujących istotne użytkowo cechy żyta
    Authors:
    EWA BORZĘCKA, ANNA HAWLICZEK, PIOTR GAWROŃSKI, MAGDALENA PAWEŁKOWICZ, KATARZYNA TOFIL, HANNA BOLIBOK-BRĄGOSZEWSKA
    Conference:
    XIV OGÓLNOPOLSKA KONFERENCJA NAUKOWA NAUKA DLA HODOWLI I NASIENNICTWA ROŚLIN UPRAWNYCH ZAKOPANE, 5.02 — 8.02.2019 r. (rok: 2019, ), Wydawca: INSTYTUT HODOWLI I AKLIMATYZACJI ROŚLIN PAŃSTWOWY INSTYTUT BADAWCZY
    Data:
    konferencja 5.02 — 8.02.2019
    Status:
    Published

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy