Projects funded by the NCN

Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

Study of the capabilities and limits of the use of Petri nets for modeling and analysis of complex biological systems on the basis of the exemplary process of atherosclerosis formation and development in the human body

2012/07/B/ST6/01537

Keywords:

Petri nets complex biological systems modeling atherosclerosis

Descriptors:

  • ST6_13:
  • ST6_12:
  • NZ2_9:

Panel:

ST6 - Computer science and informatics: informatics and information systems, computer science, scientific computing, intelligent systems

Host institution :

Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk

woj. wielkopolskie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

prof. Piotr Formanowicz 

Number of co-investigators in the project: 12

Call: OPUS 4 - announced on 2012-09-15

Amount awarded: 684 000 PLN

Project start date (Y-m-d): 2013-07-25

Project end date (Y-m-d): 2017-07-24

Project duration:: 48 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Equipment purchased [PL]

  1. Stacja robocza (10 000 PLN)
  2. Komputer przenośny (6 000 PLN)
  3. Komputer stacjonarny (5 000 PLN)

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (11)
  • Book publications / chapters in book publications (11)
  1. The Association Of Serum Thrombomodulin With Endothelial Injuring Factors In Abdominal Aortic Aneurysm
    Authors:
    Magdalena Budzyń-Napierala, Bogna Gryszczyńska, Maria Iskra, Wacław Majewski, Zbigniew Krasiński, Magdalena Paulina Kasprzak, Dorota Formanowicz, Krzysztof Wojciech Strzyżewski
    Academic press:
    BioMed Research International (rok: 2017, tom: 2017, strony: Article ID 2791082), Wydawca: Hindawi
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1155/2017/2791082 - link to the publication
  2. The effect of cigarette smoking on endothelial damage and atherosclerosis development - modeled and analyzed using Petri nets
    Authors:
    Kaja Chmielewska, Dorota Formanowicz, Piotr Formanowicz
    Academic press:
    Archives of Control Sciences (rok: 2017, tom: 27, strony: 211-228), Wydawca: De Gruyter
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1515/acsc-2017-0013 - link to the publication
  3. Modelowanie udziału żelaza w powstawaniu miażdżycy - podejście systemowe
    Authors:
    Dorota Formanowicz, Marcin Radom, Piotr Formanowicz
    Academic press:
    Kosmos (rok: 2014, tom: 63, strony: 331-344), Wydawca: Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Mikołaja Kopernika
    Status:
    Published
    DOI:
    link to the publication
  4. Petri net based approach to modeling and analysis of selected aspects of molecular regulation of angiogenesis
    Authors:
    Dorota Formanowicz, Marcin Radom, Piotr Zawierucha, Piotr Formanowicz
    Academic press:
    PLOS ONE (rok: 2017, tom: 12, strony: e0173020), Wydawca: PLOS
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1371/journal.pone.0173020 - link to the publication
  5. Hemojuvelin-hepcidin axis modeled and analyzed using Petri nets
    Authors:
    Dorota Formanowicz, Adam Kozak, Tomasz Głowacki, Marcin Radom, Piotr Formanowicz
    Academic press:
    Journal of Biomedical Informatics (rok: 2013, tom: 46, strony: 1030-1043), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.jbi.2013.07.013 - link to the publication
  6. Modelowanie udziału żelaza w powstawaniu miażdżycy - podejście systemowe
    Authors:
    Dorota Formanowicz, Marcin Radom, Piotr Formanowicz
    Academic press:
    Kosmos (rok: 2014, tom: 63, strony: 331-344), Wydawca: Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Mikołaja Kopernika
    Status:
    Published
    DOI:
    brak - link to the publication
  7. The study of the influence of micro-environmental signals on macrophage differentiation using a quantitative Petri net based model
    Authors:
    Katarzyna Rżosińska, Dorota Formanowicz, Piotr Formanowicz
    Academic press:
    Archives of Control Sciences (rok: 2017, tom: 27, strony: 331–349), Wydawca: De Gruyter
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1515/acsc-2017-0022 - link to the publication
  8. Advanced Oxidation Protein Products and Carbonylated Proteins as Biomarkers of Oxidative Stress in Selected Atherosclerosis-Mediated Diseases
    Authors:
    Bogna Gryszczyńska, Dorota Formanowicz, Magdalena Budzyń, Maria Wanic-Kossowska, Elżbieta Pawliczak, Piotr Formanowicz, Wacław Majewski, Krzysztof Wojciech Strzyżewski, Magdalena P. Kasprzak, Maria Iskra
    Academic press:
    BioMed Research International (rok: 2017, tom: 2017, strony: Article ID 4975264), Wydawca: Hindawi
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1155/2017/4975264 - link to the publication
  9. Usefulness of serum interleukin-18 in predicting cardiovascular mortality in patients with chronic kidney disease - systems and clinical approach
    Authors:
    Dorota Formanowicz, Maria Wanic-Kossowska, Elżbieta Pawliczak, Marcin Radom, Piotr Formanowicz
    Academic press:
    Scientific Reports (rok: 2015, tom: 5, strony: 18322), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1038/srep18332 - link to the publication
  10. Selected aspects of essential hypertension and cardiovascular disease modeled and analyzed using stochastic Petri nets
    Authors:
    Dorota Formanowicz, Agnieszka Rybarczyk, Piotr Formanowicz
    Status:
    Accepted for publication
  11. Holmes: a graphical tool for development, simulation and analysis of Petri net based models of complex biological systems
    Authors:
    Marcin Radom, Agnieszka Rybarczyk, Bartłomiej Szawulak, Hubert Andrzejewski, Piotr Chabelski, Adam Kozak, Piotr Formanowicz
    Status:
    Accepted for publication
  1. Hamowanie procesów w opartych na sieciach Petriego modelach systemów technicznych oraz biologicznych
    Authors:
    Paulina Bogusławska, Dorota Formanowicz, Piotr Formanowicz
    Book:
    Automatyzacja procesów dyskretnych. Teoria i zastosowania (rok: 2016, tom: II, strony: 31-39), Wydawca: Wydawnictwo Pracowni Komputerowej Jacka Skalmierskiego
    Status:
    Published
  2. Kombinatoryczne aspekty analizy t-niezmienników w modelach systemów biologicznych opartych na sieciach Petriego
    Authors:
    Piotr Formanowicz
    Book:
    Automatyzacja procesów dyskretnych. Teoria i zastosowania (rok: 2016, tom: II, strony: 65-76), Wydawca: Wydawnictwo Pracowni Komputerowej Jacka Skalmierskiego
    Status:
    Published
  3. Ilościowy model procesu różnicowania makrofagów oparty na sieciach Petriego
    Authors:
    Katarzyna Rżosinska, Dorota Formanowicz, Piotr Formanowicz
    Book:
    Automatyzacja procesów dyskretnych. Teoria i zastosowania (rok: 2016, tom: II, strony: 205-216), Wydawca: Wydawnictwo Pracowni Komputerowej Jacka Skalmierskiego
    Status:
    Published
  4. Metody analizy modeli systemów biologicznych opartych na czasowych sieciach Petriego
    Authors:
    Marcin Radom, Jakub Olszak, Piotr Formanowicz
    Book:
    Automatyzacja Procesów Dyskretnych. Teoria i Zastosowania (rok: 2016, tom: II, strony: 189-203), Wydawca: Wydawnictwo Pracowni Komputerowej Jacka Skalmierskiego
    Status:
    Published
  5. Metody analizy ilościowych modeli systemów biologicznych opartych na sieciach Petriego
    Authors:
    Marcin Radom, Dorota Formanowicz, Piotr Formanowicz
    Book:
    Automatyzacja procesow dyskretnych. Teoria i zastosowania (rok: 2014, tom: II, strony: 197-205), Wydawca: Wydawnictwo Pracowni Komputerowej Jacka Skalmierskiego
    Status:
    Published
  6. Wykorzystanie sieci Petriego do analizy stresu oksydacyjnego towarzyszącego miażdżycy
    Authors:
    Dorota Formanowicz, Adam Kozak, Piotr Formanowicz
    Book:
    Automatyzacja procesow dyskretnych. Teoria i zastosowania (rok: 2014, tom: II, strony: 83-95), Wydawca: Wydawnictwo Pracowni Komputerowej Jacka Skalmierskiego
    Status:
    Published
  7. Zastosowanie sieci Petriego do modelowania i analizy złożonych systemów biologicznych
    Authors:
    Piotr Formanowicz, Dorota Formanowicz
    Book:
    Inzynieria biomedyczna. Podstawy i zastosowania (rok: 2014, tom: 10, strony: 117-139), Wydawca: Akademicka Oficyna Wydawnicza EXIT
    Status:
    Published
  8. Modelowanie i analiza uszkodzeń śródbłonka za pomocą sieci Petriego
    Authors:
    Kaja Chmielewska, Dorota Formanowicz, Piotr Formanowicz
    Book:
    Automatyzacja procesów dyskretnych. Teoria i zastosowania (rok: 2016, tom: II, strony: 41-56), Wydawca: Wydawnictwo Pracowni Komputerowej Jacka Skalmierskiego
    Status:
    Published
  9. Zastosowanie sieci Petriego do modelowania i analizy złożonych systemów biologicznych
    Authors:
    Piotr Formanowicz, Dorota Formanowicz
    Book:
    Inzynieria biomedyczna. Podstawy i zastosowania (rok: 2014, tom: 10, strony: 117-139), Wydawca: Akademicka Oficyna Wydawnicza EXIT
    Status:
    Published
  10. Metody analizy ilościowych modeli systemów biologicznych opartych na sieciach Petriego
    Authors:
    Marcin Radom, Dorota Formanowicz, Piotr Formanowicz
    Book:
    Automatyzacja procesow dyskretnych. Teoria i zastosowania (rok: 2014, tom: II, strony: 197-205), Wydawca: Wydawnictwo Pracowni Komputerowej Jacka Skalmierskiego
    Status:
    Published
  11. Mathematical Modeling of Aortic Aneurysm Progression
    Authors:
    Piotr Formanowicz, Michał Nowicki, Dorota Formanowicz
    Book:
    Status:
    Accepted for publication

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy