Projects funded by the NCN

Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

Controling of the intracellular processes

2012/05/D/ST7/02072

Keywords:

control bio-mathematical moldeling p53 control unit bifurcation analysis sensitivity analysis

Descriptors:

  • ST7_4: Micro- and nanosystems engineering
  • ST7_11: Electronic, optoelectronic and photonic components and systems for applications (e.g. in biomedical engineering)
  • ST7_1: Control engineering in automation and robotics

Panel:

ST7 - Systems and communication engineering: electronics, communication, optoelectronics

Host institution :

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

woj. śląskie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

dr Krzysztof Puszyński 

Number of co-investigators in the project: 4

Call: SONATA 3 - announced on 2012-03-15

Amount awarded: 499 980 PLN

Project start date (Y-m-d): 2013-03-06

Project end date (Y-m-d): 2016-09-05

Project duration:: 42 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (4)
  • Articles in post-conference publications (8)
  • Book publications / chapters in book publications (10)
  1. Pharmacodynamics of the p53-Mdm2 targeting drug Nutlin: the role of gene switching noise
    Authors:
    Krzysztof Puszynski, Alberto Gandolfi, Alberto d'Onofrio
    Academic press:
    PLOS Computational Biology (rok: 2014, tom: 11(3), strony: online), Wydawca: Publish Library Science
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1371/journal.pcbi.1003991. - link to the publication
  2. Application of Bifurcation Theory and siRNA-based Control Signal to Restore the Proper Response of Cancer Cells to DNA Damage
    Authors:
    Kozlowska E. Puszynski K.
    Academic press:
    Journal of Theoretical Biology (rok: 2016, tom: 408, strony: 213-221), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.jtbi.2016.08.017 - link to the publication
  3. A novel mathematical model of ATM/p53/NF-kappaB pathways points to the importance of the DDR switch-off mechanisms
    Authors:
    Jonak K, Kurpas M, Szoltysek K, Janus P, Abramowicz A, Puszynski K.
    Academic press:
    BMC Bioinformatics (rok: 2016, tom: 10(1), strony: 45303), Wydawca: BioMed Central
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1186/s12918-016-0293-0 - link to the publication
  4. The role of stochastic gene switching in determining the pharmacodynamics of certain drugs: basic mechanisms
    Authors:
    Puszynski K. Gandolfi A. d'Onofrio A.
    Academic press:
    Journal of Pharmacokinetics and Pharmacodynamics (rok: 2016, tom: 43(4), strony: 395-410), Wydawca: Springer
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1007/s10928-016-9480-2 - link to the publication
  1. Reachability of the Therapeutic Target in the Systems with Parameters Switch
    Authors:
    Magdalena Ochab, Krzysztof Puszynski, Andrzej Świerniak
    Conference:
    4th International Conference, IWBBIO 2016 (rok: 2016, ), Wydawca: Springer: Bioinformatics and Biomedical Engineering
    Data:
    konferencja 20-22.04.2016
    Status:
    Published
  2. Structural stability of biological models with switchings
    Authors:
    Magdalena Ochab, Krzysztof Puszynski, Andrzej Swierniak
    Conference:
    21st International Conference on Methods and Models in Automation and Robotics (rok: 2016, ), Wydawca: Methods and Models in Automation and Robotics (MMAR), 2016 21st International Conference on, IEEE Xplore
    Data:
    konferencja 29.08-1.09.2016
    Status:
    Published
  3. Analiza symulacyjna procesu ubikwitynacji bałka p53
    Authors:
    Wojciech Bensz, Krzysztof Puszyński
    Conference:
    XVIII Krajowa Konferencja Biocybernetyki i Inżynierii Biomedycznej (rok: 2013, ), Wydawca: Politechnika Gdańska
    Data:
    konferencja 10-12 października
    Status:
    Published
    DOI:
    link to the publication
  4. Wpływ poziomu białka p53 na los komórki
    Authors:
    Magdalena Ochab, Krzysztof Puszyński
    Conference:
    XVIII Krajowa Konferencja Biocybernetyki i Inżynierii Biomedycznej (rok: 2013, ), Wydawca: Politechnika Gdańska
    Data:
    konferencja 10-12 października
    Status:
    Published
  5. A simulation study of the relationship between replication stress detection pathway and the cell cycle
    Authors:
    Kurpas Monika, Puszynski Krzysztof
    Conference:
    Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics (rok: 2015, ), Wydawca: Springer
    Data:
    konferencja 10-12.09.2015
    Status:
    Published
  6. The Resection Mechanism Promotes Cell Survival after Exposure to IR
    Authors:
    Kurpas Monika, Jonak Katarzyna, Puszynski Krzysztof
    Conference:
    4th International Conference on Man–Machine Interactions (rok: 2015, ), Wydawca: Springer
    Data:
    konferencja 6-9.10.2015
    Status:
    Published
  7. Application of the piece-wise linear models for description of nonlinear biological systems based on p53 regulatory unit
    Authors:
    Magdalena Ochab, Krzysztof Puszynski, Andrzej Świerniak
    Conference:
    XXII Krajowa Konferencja Zastosowań Matematyki w Biologii i Medycynie (rok: 2016, ), Wydawca: Wydawnictwo Uniwersytetu Jana Kochanowskiego w Kielcach
    Data:
    konferencja 5-9.09.2016
    Status:
    Published
  8. Controlling the Intracellular Processes
    Authors:
    Puszynski, Krzysztof; Jaksik, Roman; Lalik, Anna
    Conference:
    19th IFAC World Congress, 2014 (rok: 2014, ), Wydawca: International Federation of Automatic Control
    Data:
    konferencja 24-29.08.2014
    Status:
    Published
    DOI:
    link to the publication
  1. Wybrane metody uproszczonego modelowania matematycznego procesów wewnątrzkomórkowych
    Authors:
    Bensz Wojciech, Kurpas Monika, Ochab Magdalena
    Book:
    Badania i Rozwój Młodych Naukowców w Polsce – Inżynieria w medycynie. (rok: 2016, tom: brak, strony: 58-63), Wydawca: Młodzi naukowcy
    Status:
    Published
  2. Modelowanie regulatorowych sieci genowych (GRN) - przegląd metod
    Authors:
    Ochab Magdalena, Kurpas Monika, Bensz Wojciech
    Book:
    Badania i Rozwój Młodych Naukowców w Polsce – Inżynieria w medycynie (rok: 2016, tom: brak, strony: 36-44), Wydawca: Młodzi Naukowcy
    Status:
    Published
  3. Modelowanie wybranych skutków ubocznych chemioterapii
    Authors:
    Bensz Wojciech, Kurpas Monika, Ochab Magdalena
    Book:
    Badania i Rozwój Młodych Naukowców w Polsce – Inżynieria w medycynie (rok: 2016, tom: brak, strony: 53-57), Wydawca: Młodzi Naukowcy
    Status:
    Published
  4. Prediction of the behavior of mammalian cells after exposure to ionizing radiation based on the new mathematical model of ATM-Mdm2-p53 regulatory pathway
    Authors:
    Katarzyna Jonak, Monika Kurpas, and Krzysztof Puszynski
    Book:
    Advances in Intelligent Systems and Computing. Information Technologies in Biomedicine. (rok: 2014, tom: 283 (3), strony: 349-362), Wydawca: Springer
    Status:
    Published
    DOI:
    link to the publication
  5. Przegląd modeli matematycznych cyklu komórkowego
    Authors:
    Kurpas Monika, Bensz Wojciech, Ochab Magdalena
    Book:
    Badania i Rozwój Młodych Naukowców w Polsce – Inżynieria w medycynie (rok: 2016, tom: brak, strony: 64-71), Wydawca: Młodzi Naukowcy
    Status:
    Published
  6. Przegląd modeli matematycznych szlaków detekcji uszkodzeń DNA
    Authors:
    Kurpas Monika, Bensz Wojciech, Ochab Magdalena
    Book:
    Badania i Rozwój Młodych Naukowców w Polsce – Inżynieria w medycynie (rok: 2016, tom: brak, strony: 72-79), Wydawca: Młodzi Naukowcy
    Status:
    Published
  7. Modele komórkowych szlaków sygnałowych i estymacja ich parametrów
    Authors:
    Krzysztof Fujarewicz i Krzysztof Puszyński
    Book:
    Biocybernetyka i Inżynieria Biomedyczna - Tom 10 Bioinformatyka (rok: 2014, tom: 10, strony: 141-174), Wydawca: Akademicka Oficyna Wydawnicza EXIT
    Status:
    Published
  8. Monografia - współudział wszystkich rozdziałów
    Authors:
    Andrzej Swierniak, Marek Kimmel, Jaroslaw Smieja, Krzysztof Puszynski, Krzysztof Psiuk-Maksymowicz
    Book:
    System Engineering Approach to Planning Anticancer Therapies (rok: 2016, tom: osobna książka, strony: 235 stron), Wydawca: Springer
    Status:
    Published
  9. Simulation Analysis of the ATR Module as a Detector of UV-Induced DNA Damage
    Authors:
    Monika Kurpas, Katarzyna Jonak, Krzysztof Puszyński
    Book:
    Advances in Intelligent Systems and Computing. Information Technologies in Biomedicine. (rok: 2014, tom: 283 (3), strony: 317-326), Wydawca: Springer
    Status:
    Published
    DOI:
    link to the publication
  10. Systemy biologiczne jako układy z przełączeniami na przykładzie modułu regulatorowego p53
    Authors:
    Ochab Magdalena, Kurpas Monika, Bensz Wojciech
    Book:
    Badania i Rozwój Młodych Naukowców w Polsce – Inżynieria w medycynie (rok: 2016, tom: brak, strony: 44-53), Wydawca: Młodzi Naukowcy
    Status:
    Published

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy