Projects funded by the NCN


Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

Molecular characterization of the complex of human cystatin C with natural autoantibodies.

2012/05/E/ST5/03796

Keywords:

antibodies mass spectrometry cystatin C amyloid angiopathy

Descriptors:

  • ST5_16:

Panel:

ST5 - Materials: materials synthesis, structure-properties relations, advanced and functional materials with designed properties, (macro)molecular architecture, material engineering

Host institution :

Uniwersytet Gdański/Wydział Chemii, Wydział Chemii

woj. pomorskie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

dr Paulina Czaplewska 

Number of co-investigators in the project: 6

Call: SONATA BIS 1 - announced on 2012-03-15

Amount awarded: 1 496 700 PLN

Project start date (Y-m-d): 2013-01-30

Project end date (Y-m-d): 2017-01-29

Project duration:: 48 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Equipment purchased [PL]

  1. Komputer/laptop (4 szt.) (16 000 PLN)
  2. System do izoelektroogniskowania (IEF) (66 000 PLN)
  3. Automatyczny podajnik próbek.
  4. Licencja na program Peak View (26 356 PLN)
  5. System do przygotowania i obróbki żelielektroforetycznych.
  6. Densytometr - skaner do żeli elektroforetycznych (69 000 PLN)
  7. Program do analizy skanów żeli elektroforetycznych (60 000 PLN)
  8. Spektrofotometr absorpcyjny do odczytu absorpcji z płytek wielodołkowych (145 000 PLN)
  9. Suszarka do szkła laboratoryjnego (2 szt.) (8 000 PLN)
  10. Licencja do serwera Mascot (55 000 PLN)

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (7)
  • Articles in post-conference publications (12)
  1. Epitope location for two monoclonal antibodies against human cystatin C, representing opposite aggregation inhibitory properties
    Authors:
    Izabela Behrendt, Martyna Pra ̨dzin ́ska, Marta Spodzieja, Aleksandra S. Kołodziejczyk, Sylwia Rodziewicz‑Motowidło, Aneta Szyman ́ska, Paulina Czaplewska
    Academic press:
    Amino Acids (rok: 2016, tom: 48(7), strony: 1717-1729), Wydawca: Springer
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1007/s00726-016-2242-z - link to the publication
  2. Application of amide hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry for epitope mapping in human cystatin C
    Authors:
    M. Prądzińska, I. Behrendt, J. Astorga-Wells, A. Manoilov, R. Zubarev, AS Kołodziejczyk, S. Rodziewicz-Motowidło, P Czaplewska
    Academic press:
    Amino Acids (rok: 2016, tom: 48(12), strony: 2809–2820), Wydawca: Springer
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1007/s00726-016-2316-y - link to the publication
  3. The identification of discontinuous epitope in the human cystatin C – Monoclonal antibody HCC3 complex
    Authors:
    M. Rafalik, M. Spodzieja, A.S. Kołodziejczyk, S. Rodziewicz-Motowidło, A. Szymańska, A. Grubb, P. Czaplewska
    Academic press:
    Journal of Proteomics (rok: 2019, tom: 191, strony: 58-67), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.jprot.2018.04.020 - link to the publication
  4. Hyphenated Mass Spectrometry Techniques in the Diagnosis of Amyloidosis.
    Authors:
    M Spodzieja, S Rodziewicz-Motowidło and A Szymanska
    Academic press:
    Current Medicinal Chemistry (rok: 2017, tom: 26(1), strony: 104-120), Wydawca: Bentham Science
    Status:
    Published
    DOI:
    10.2174/0929867324666171003113019 - link to the publication
  5. Structural studies of the C-terminal 19-peptide of serum amyloid A and its Pro ->Ala variants interacting with human cystatin C
    Authors:
    Martyna Maszota, Natalia Karska, Marta Spodzieja, Jerzy Ciarkowski, Aleksandra S. Kołodziejczyk, Sylwia Rodziewicz-Motowidło and Paulina Czaplewska
    Academic press:
    Journal of Molecular Recognition (rok: 2015, tom: 28, strony: 413-426), Wydawca: Wiley
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1002/jmr.2457 - link to the publication
  6. Characteristics of C‐terminal, β‐amyloid peptide binding fragment of neuroprotective protease inhibitor, cystatin C
    Authors:
    Marta Spodzieja, Katarzyna Kalejta, Aleksandra S. Kołodziejczyk, Martyna Maszota‐ Zieleniak, Sylwia Rodziewicz‐Motowidło, Wioletta Żmudzińska, Paulina Czaplewska
    Academic press:
    Journal of Molecular Recognition (rok: 2016, tom: 30(2), strony: 45304), Wydawca: Wiley
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1002/jmr.2581 - link to the publication
  7. Isolation and characterization of autoantibodies against human cystatin C
    Authors:
    M Prądzińska, I Behrendt, M Spodzieja, AS. Kołodziejczyk, S Rodziewicz-Motowidło, A Szymańska, SL. Lundström, RA. Zubarev, K Macur, P Czaplewska
    Academic press:
    Amino Acids (rok: 2016, tom: 48(11), strony: 2501–2518), Wydawca: Springer
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1007/s00726-016-2271-7 - link to the publication
  1. Epitope identification for antibodies against human cystatin C – comparison of two different methods.
    Authors:
    Izabela Behrendta, Martyna Prądzińskaa, Aleksandra S. Kołodziejczyka, Sylwia Rodziewicz-Motowidłoa, Paulina Czaplewskab and Aneta Szymańskaa
    Conference:
    23 Polish Peptide Symposium (rok: 2015, ), Wydawca: Instytut Chemii Organicznej, Politechnika Łódzka
    Data:
    konferencja 30 sierpnia - 3 września
    Status:
    Published
  2. Epitope identification for antibodies directed against human cystatin C
    Authors:
    I. Behrendt*, M. Prądzińska, P. Czaplewska, A. Szymańska, A. Kołodziejczyk, S. Rodziewicz-Motowidło
    Conference:
    10th European Biophysic Congress July 18-22 2015 Drezno (rok: 2015, ), Wydawca: Eur Biophys J 2015 44 (Suppl 1)
    Data:
    konferencja 18-22 lipca
    Status:
    Published
  3. Cooper bindign by human cystatin C and its C-terinal fragment
    Authors:
    P. Czaplewska, K. Macur, A. Szymańska
    Conference:
    34th Informal Meeting on Mass Spectrometry (rok: 2016, ), Wydawca: Pietro Traldi, SGEditoriali
    Data:
    konferencja 15-18 Maj
    Status:
    Published
  4. Epitope Mapping of the Human Cystatin C
    Authors:
    Paulina Czaplewska, Martyna Prądzińska , Izabela Behrendt, Monika Rafalik, Aneta Szymańska, Aleksandra S. Kołodziejczyk, Franciszek Kasprzykowski , Marta Spodzieja, Sylwia Rodziewicz-Motowidło, Anders Grubb, Roman Zubarev
    Conference:
    V International Conference on Analytical Proteomics (rok: 2017, ), Wydawca: UCIBIO-REQUIMTE, FCT- University NOVA of Lisbon (Lisbon, Portugal)
    Data:
    konferencja 3-6 Lipca
    Status:
    Published
  5. Epitopes Mapping of the Human Cystatin C
    Authors:
    Paulina Czaplewska , Martyna Prądzińska, Izabela Behrendt, Aneta Szymańska, Martyna Maszota - Zieleniak, Marta Spodzieja
    Conference:
    58 Zjazd Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2015, ), Wydawca: PTChem Gdańsk
    Data:
    konferencja 21-25 wrześna
    Status:
    Published
  6. Metal binding by cystatin C and its-C-terminal fragemtn
    Authors:
    A. Szymańska, P. Groves, P. Czaplewska
    Conference:
    2nd Congress BIO 2016 "Expanding beyond the limits", 50th Meeting of the Polish Biochemical Society (rok: 2016, ), Wydawca: Acta Biochimica Polonica
    Data:
    konferencja 13-16 Września
    Status:
    Published
  7. Characteristic of anti-cystatin C antibodies and identification of theirs epitopes
    Authors:
    M. Prądzińska, I. Behrendt , A. Szymańska ,A. Kołodziejczyk, S. Rodziewicz-Motowidło, P. Czaplewska
    Conference:
    10th European Biophysic Congress (rok: 2015, ), Wydawca: Eur Biophys J 2015 44 (Suppl 1)
    Data:
    konferencja 18-22 lipca
    Status:
    Published
  8. Identification of epitopes and characteristic of anticystatin C antibodies.
    Authors:
    Martyna Prądzińska, Izabela Behrendt, Aneta Szymańska, Sylwia Rodziewicz-Motowidło, Paulina Czaplewska
    Conference:
    20th International Mass Spectrometry Conference (rok: 2014, ), Wydawca: International Mass Spectrometry Foundation (IMSF)
    Data:
    konferencja August 24-29, 2014 Geneva, Switzerland
    Status:
    Published
  9. In search of inhibitors of Abeta aggregation process based on C-terminal fragment of human cystatin C
    Authors:
    Marta Spodzieja, Katarzyna Kalejta, Aleksandra S. Kołodziejczyk, Aneta Szymańska and Paulina Czaplewska
    Conference:
    23 Polish Peptide Symposium (rok: 2015, ), Wydawca: Instytut Chemii Organicznej, Politechnika Łódzka
    Data:
    konferencja 30 sierpnia -3 września
    Status:
    Published
  10. Mass spectrometry technique in studies of interactions of human cystatin C with antibodies
    Authors:
    Izabela Behrendt, Monika Rafalik, Paulina Czaplewska, Aneta Szymańska, Aleksandra Kołodziejczyk, Sylwia Rodziewicz- Motowidło
    Conference:
    20th International Mass Spectrometry Conference (rok: 2014, ), Wydawca: International Mass Spectrometry Foundation (IMSF)
    Data:
    konferencja August 24-29, 2014 Geneva, Switzerland
    Status:
    Published
  11. The application of mass spectrometry to identifi cation of the epitope in human cystatin C – monoclonal antibody HCC3 complex.
    Authors:
    Monika Rafalik, Martyna Prądzińska, Aleksandra Kołodziejczyk, Aneta Szymańska, Sylwia Rodziewicz-Motowidło, Paulina Czaplewska
    Conference:
    20th International Mass Spectrometry Conference (rok: 2014, ), Wydawca: International Mass Spectrometry Foundation (IMSF)
    Data:
    konferencja August 24-29, 2014 Geneva, Switzerland
    Status:
    Published
  12. Mass spectrometry as a powerful tool in antigen-antibody studies.
    Authors:
    Paulina Czaplewska, Anna Śladewska-Marquardt, Andreas Marquardt, Aleksandra S Kołodziejczyk, Martyna Prądzińska, Aneta Szymańska, Sylwia Rodziewicz-Motowidło
    Conference:
    20th International Mass Spectrometry Conference (rok: 2014, ), Wydawca: International Mass Spectrometry Foundation (IMSF)
    Data:
    konferencja August 24-29, 2014 Geneva, Switzerland
    Status:
    Published