Charakterystyka molekularna kompleksu ludzkiej cystatyny C z naturalnymi autoprzeciwciałami.
2012/05/E/ST5/03796
Słowa kluczowe
Deskryptory
- ST5_16: Chemia biologiczna
Panel
ST5 – Synteza i materiały: otrzymywanie materiałów, związki struktury z właściwościami, nowoczesne materiały o założonych właściwościach, architektura (makro)molekularna, chemia organiczna, chemia nieorganiczna
Jednostka realizująca
Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii
woj. pomorskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 6
Konkurs
SONATA BIS 1 – ogłoszony 2012-03-15
- Przyznana kwota
- 1 496 700 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2013-01-30
- Zakończenie projektu
- 2017-01-29
- Planowany czas trwania projektu
- 48 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Automatyczny podajnik próbek.
- Densytometr - skaner do żeli elektroforetycznych. Za kwotę 69 000 PLN
- Komputer/laptop (4 szt.). Za kwotę 16 000 PLN
- Licencja do serwera Mascot. Za kwotę 55 000 PLN
- Licencja na program Peak View. Za kwotę 26 356 PLN
- Program do analizy skanów żeli elektroforetycznych. Za kwotę 60 000 PLN
- Spektrofotometr absorpcyjny do odczytu absorpcji z płytek wielodołkowych. Za kwotę 145 000 PLN
- Suszarka do szkła laboratoryjnego (2 szt.). Za kwotę 8 000 PLN
- System do izoelektroogniskowania (IEF). Za kwotę 66 000 PLN
- System do przygotowania i obróbki żelielektroforetycznych.
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (7)
-
Application of amide hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry for epitope mapping in human cystatin C
- Autorzy:
- M. Prądzińska, I. Behrendt, J. Astorga-Wells, A. Manoilov, R. Zubarev, AS Kołodziejczyk, S. Rodziewicz-Motowidło, P Czaplewska
- Czasopismo:
- Amino Acids (rok: 2016, tom: 48(12), strony: 2809–2820), Wydawca: Springer
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1007/s00726-016-2316-y – link do publikacji
-
Isolation and characterization of autoantibodies against human cystatin C
- Autorzy:
- M Prądzińska, I Behrendt, M Spodzieja, AS. Kołodziejczyk, S Rodziewicz-Motowidło, A Szymańska, SL. Lundström, RA. Zubarev, K Macur, P Czaplewska
- Czasopismo:
- Amino Acids (rok: 2016, tom: 48(11), strony: 2501–2518), Wydawca: Springer
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1007/s00726-016-2271-7 – link do publikacji
-
Epitope location for two monoclonal antibodies against human cystatin C, representing opposite aggregation inhibitory properties
- Autorzy:
- Izabela Behrendt, Martyna Pra ̨dzin ́ska, Marta Spodzieja, Aleksandra S. Kołodziejczyk, Sylwia Rodziewicz‑Motowidło, Aneta Szyman ́ska, Paulina Czaplewska
- Czasopismo:
- Amino Acids (rok: 2016, tom: 48(7), strony: 1717-1729), Wydawca: Springer
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1007/s00726-016-2242-z – link do publikacji
-
The identification of discontinuous epitope in the human cystatin C – Monoclonal antibody HCC3 complex
- Autorzy:
- M. Rafalik, M. Spodzieja, A.S. Kołodziejczyk, S. Rodziewicz-Motowidło, A. Szymańska, A. Grubb, P. Czaplewska
- Czasopismo:
- Journal of Proteomics (rok: 2019, tom: 191, strony: 58-67), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.jprot.2018.04.020 – link do publikacji
-
Structural studies of the C-terminal 19-peptide of serum amyloid A and its Pro ->Ala variants interacting with human cystatin C
- Autorzy:
- Martyna Maszota, Natalia Karska, Marta Spodzieja, Jerzy Ciarkowski, Aleksandra S. Kołodziejczyk, Sylwia Rodziewicz-Motowidło and Paulina Czaplewska
- Czasopismo:
- Journal of Molecular Recognition (rok: 2015, tom: 28, strony: 413-426), Wydawca: Wiley
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1002/jmr.2457 – link do publikacji
-
Characteristics of C‐terminal, β‐amyloid peptide binding fragment of neuroprotective protease inhibitor, cystatin C
- Autorzy:
- Marta Spodzieja, Katarzyna Kalejta, Aleksandra S. Kołodziejczyk, Martyna Maszota‐ Zieleniak, Sylwia Rodziewicz‐Motowidło, Wioletta Żmudzińska, Paulina Czaplewska
- Czasopismo:
- Journal of Molecular Recognition (rok: 2016, tom: 30(2), strony: 46035), Wydawca: Wiley
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1002/jmr.2581 – link do publikacji
-
Hyphenated Mass Spectrometry Techniques in the Diagnosis of Amyloidosis.
- Autorzy:
- M Spodzieja, S Rodziewicz-Motowidło and A Szymanska
- Czasopismo:
- Current Medicinal Chemistry (rok: 2017, tom: 26(1), strony: 104-120), Wydawca: Bentham Science
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.2174/0929867324666171003113019 – link do publikacji
Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (12)
-
The application of mass spectrometry to identifi cation of the epitope in human cystatin C – monoclonal antibody HCC3 complex.
- Autorzy:
- Monika Rafalik, Martyna Prądzińska, Aleksandra Kołodziejczyk, Aneta Szymańska, Sylwia Rodziewicz-Motowidło, Paulina Czaplewska
- Konferencja:
- 20th International Mass Spectrometry Conference (rok: 2014, strony: 495-496), Wydawca: International Mass Spectrometry Foundation (IMSF)
- Data:
- konferencja August 24-29, 2014 Geneva, Switzerland
- Status:
- Opublikowana
-
Epitopes Mapping of the Human Cystatin C
- Autorzy:
- Paulina Czaplewska , Martyna Prądzińska, Izabela Behrendt, Aneta Szymańska, Martyna Maszota - Zieleniak, Marta Spodzieja
- Konferencja:
- 58 Zjazd Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2015, strony: 22-23), Wydawca: PTChem Gdańsk
- Data:
- konferencja 21-25 wrześna
- Status:
- Opublikowana
-
Characteristic of anti-cystatin C antibodies and identification of theirs epitopes
- Autorzy:
- M. Prądzińska, I. Behrendt , A. Szymańska ,A. Kołodziejczyk, S. Rodziewicz-Motowidło, P. Czaplewska
- Konferencja:
- 10th European Biophysic Congress (rok: 2015, strony: S243), Wydawca: Eur Biophys J 2015 44 (Suppl 1)
- Data:
- konferencja 18-22 lipca
- Status:
- Opublikowana
-
Epitope identification for antibodies against human cystatin C – comparison of two different methods.
- Autorzy:
- Izabela Behrendta, Martyna Prądzińskaa, Aleksandra S. Kołodziejczyka, Sylwia Rodziewicz-Motowidłoa, Paulina Czaplewskab and Aneta Szymańskaa
- Konferencja:
- 23 Polish Peptide Symposium (rok: 2015, strony: S129), Wydawca: Instytut Chemii Organicznej, Politechnika Łódzka
- Data:
- konferencja 30 sierpnia - 3 września
- Status:
- Opublikowana
-
Identification of epitopes and characteristic of anticystatin C antibodies.
- Autorzy:
- Martyna Prądzińska, Izabela Behrendt, Aneta Szymańska, Sylwia Rodziewicz-Motowidło, Paulina Czaplewska
- Konferencja:
- 20th International Mass Spectrometry Conference (rok: 2014, strony: 497-498), Wydawca: International Mass Spectrometry Foundation (IMSF)
- Data:
- konferencja August 24-29, 2014 Geneva, Switzerland
- Status:
- Opublikowana
-
Mass spectrometry technique in studies of interactions of human cystatin C with antibodies
- Autorzy:
- Izabela Behrendt, Monika Rafalik, Paulina Czaplewska, Aneta Szymańska, Aleksandra Kołodziejczyk, Sylwia Rodziewicz- Motowidło
- Konferencja:
- 20th International Mass Spectrometry Conference (rok: 2014, strony: 498-498), Wydawca: International Mass Spectrometry Foundation (IMSF)
- Data:
- konferencja August 24-29, 2014 Geneva, Switzerland
- Status:
- Opublikowana
-
Mass spectrometry as a powerful tool in antigen-antibody studies.
- Autorzy:
- Paulina Czaplewska, Anna Śladewska-Marquardt, Andreas Marquardt, Aleksandra S Kołodziejczyk, Martyna Prądzińska, Aneta Szymańska, Sylwia Rodziewicz-Motowidło
- Konferencja:
- 20th International Mass Spectrometry Conference (rok: 2014, strony: 496-497), Wydawca: International Mass Spectrometry Foundation (IMSF)
- Data:
- konferencja August 24-29, 2014 Geneva, Switzerland
- Status:
- Opublikowana
-
In search of inhibitors of Abeta aggregation process based on C-terminal fragment of human cystatin C
- Autorzy:
- Marta Spodzieja, Katarzyna Kalejta, Aleksandra S. Kołodziejczyk, Aneta Szymańska and Paulina Czaplewska
- Konferencja:
- 23 Polish Peptide Symposium (rok: 2015, strony: S126), Wydawca: Instytut Chemii Organicznej, Politechnika Łódzka
- Data:
- konferencja 30 sierpnia -3 września
- Status:
- Opublikowana
-
Epitope identification for antibodies directed against human cystatin C
- Autorzy:
- I. Behrendt*, M. Prądzińska, P. Czaplewska, A. Szymańska, A. Kołodziejczyk, S. Rodziewicz-Motowidło
- Konferencja:
- 10th European Biophysic Congress July 18-22 2015 Drezno (rok: 2015, strony: S242), Wydawca: Eur Biophys J 2015 44 (Suppl 1)
- Data:
- konferencja 18-22 lipca
- Status:
- Opublikowana
-
Metal binding by cystatin C and its-C-terminal fragemtn
- Autorzy:
- A. Szymańska, P. Groves, P. Czaplewska
- Konferencja:
- 2nd Congress BIO 2016 Expanding beyond the limits, 50th Meeting of the Polish Biochemical Society (rok: 2016, strony: 85-85), Wydawca: Acta Biochimica Polonica
- Data:
- konferencja 13-16 Września
- Status:
- Opublikowana
-
Cooper bindign by human cystatin C and its C-terinal fragment
- Autorzy:
- P. Czaplewska, K. Macur, A. Szymańska
- Konferencja:
- 34th Informal Meeting on Mass Spectrometry (rok: 2016, strony: 120-120), Wydawca: Pietro Traldi, SGEditoriali
- Data:
- konferencja 15-18 Maj
- Status:
- Opublikowana
-
Epitope Mapping of the Human Cystatin C
- Autorzy:
- Paulina Czaplewska, Martyna Prądzińska , Izabela Behrendt, Monika Rafalik, Aneta Szymańska, Aleksandra S. Kołodziejczyk, Franciszek Kasprzykowski , Marta Spodzieja, Sylwia Rodziewicz-Motowidło, Anders Grubb, Roman Zubarev
- Konferencja:
- V International Conference on Analytical Proteomics (rok: 2017, strony: 97-98), Wydawca: UCIBIO-REQUIMTE, FCT- University NOVA of Lisbon (Lisbon, Portugal)
- Data:
- konferencja 3-6 Lipca
- Status:
- Opublikowana