Zastosowanie danych transkryptomicznych do identyfikacji nowych miRNA oraz przewidywania budowy genów miRNA
2011/01/N/NZ2/01653
Słowa kluczowe
Deskryptory
- NZ2_7: Bioinformatyka
- NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
- NZ2_1: Genetyka molekularna
Panel
NZ2 – Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca
Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii
woj. wielkopolskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 2
Konkurs
PRELUDIUM 1 – ogłoszony 2011-03-15
- Przyznana kwota
- 76 999 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2011-12-07
- Zakończenie projektu
- 2014-09-06
- Planowany czas trwania projektu
- 33 miesiące (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Serwer wielozadaniowy DELL. Za kwotę 25 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (4)
-
HuntMi: an efficient and taxon-specific approach in pre-miRNA identification
- Autorzy:
- Adam Gudyś, Michał Wojciech Szcześniak, Marek Sikora, Izabela Makałowska
- Czasopismo:
- BMC Bioinformatics (rok: 2013, tom: 14, strony: brak numeracji stron), Wydawca: BioMed Central
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1186/1471-2105-14-83 – link do publikacji
-
miRNEST 2.0: a database of plant and animal microRNAs
- Autorzy:
- Michał Wojciech Szcześniak, Izabela Makałowska
- Czasopismo:
- Nucleic Acids Research (rok: 2013, tom: 42, strony: D74-D77), Wydawca: Oxford Journals
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1093/nar/gkt1156 – link do publikacji
-
ERISdb: A Database of Plant Splice Sites and Splicing Signals
- Autorzy:
- Michał Wojciech Szcześniak, Michał Kabza, Rafał Pokrzywa, Adam Gudyś, Izabela Makałowska
- Czasopismo:
- Plant and Cell Physiology (rok: 2013, tom: 54, strony: Pp. e10), Wydawca: Oxford Journals
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1093/pcp/pct001 – link do publikacji
-
Bazy danych mikroRNA
- Autorzy:
- Michał Wojciech Szcześniak, Elżbieta Owczarkowska, Jakub Gapski, Izabela Makałowska
- Czasopismo:
- Postępy Biochemii (rok: 2012, tom: 58, strony: 91-99), Wydawca: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
- Status:
- Opublikowana