Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Zastosowanie danych transkryptomicznych do identyfikacji nowych miRNA oraz przewidywania budowy genów miRNA

2011/01/N/NZ2/01653

Słowa kluczowe:

mikroRNA baza danych RNA-seq EST budowa genów SVM

Deskryptory:

  • NZ2_7: Bioinformatyka
  • NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
  • NZ2_1: Genetyka molekularna

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza, Wydział Biologii

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Michał Szcześniak 

Liczba wykonawców projektu: 2

Konkurs: PRELUDIUM 1 - ogłoszony 2011-03-15

Przyznana kwota: 76 999 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2011-12-07

Zakończenie projektu: 2014-09-06

Planowany czas trwania projektu: 24 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Serwer wielozadaniowy DELL. Za kwotę 25 000 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (4)
  1. Bazy danych mikroRNA
    Autorzy:
    Michał Wojciech Szcześniak, Elżbieta Owczarkowska, Jakub Gapski, Izabela Makałowska
    Czasopismo:
    Postępy Biochemii (rok: 2012, tom: 58, strony: 91-99), Wydawca: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
    Status:
    Opublikowana
  2. ERISdb: A Database of Plant Splice Sites and Splicing Signals IF: 4,134
    Autorzy:
    Michał Wojciech Szcześniak, Michał Kabza, Rafał Pokrzywa, Adam Gudyś, Izabela Makałowska
    Czasopismo:
    Plant and Cell Physiology (rok: 2013, tom: 54, strony: Pp. e10), Wydawca: Oxford Journals
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/pcp/pct001 - link do publikacji
  3. HuntMi: an efficient and taxon-specific approach in pre-miRNA identification IF: 3,02
    Autorzy:
    Adam Gudyś, Michał Wojciech Szcześniak, Marek Sikora, Izabela Makałowska
    Czasopismo:
    BMC Bioinformatics (rok: 2013, tom: 14, strony: brak numeracji stron), Wydawca: BioMed Central
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/1471-2105-14-83 - link do publikacji
  4. miRNEST 2.0: a database of plant and animal microRNAs IF: 8,28
    Autorzy:
    Michał Wojciech Szcześniak, Izabela Makałowska
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2013, tom: 42, strony: D74-D77), Wydawca: Oxford Journals
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkt1156 - link do publikacji