Projekty finansowane przez NCN
Zastosowanie danych transkryptomicznych do identyfikacji nowych miRNA oraz przewidywania budowy genów miRNA
2011/01/N/NZ2/01653
Słowa kluczowe:
mikroRNA baza danych RNA-seq EST budowa genów SVM
Deskryptory:
- NZ2_7: Bioinformatyka
- NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
- NZ2_1: Genetyka molekularna
Panel:
NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca:
Uniwersytet im. Adama Mickiewicza, Wydział Biologii
woj. wielkopolskie
Konkurs: PRELUDIUM 1 - ogłoszony 2011-03-15
Przyznana kwota: 76 999 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2011-12-07
Zakończenie projektu: 2014-09-06
Planowany czas trwania projektu: 33 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Serwer wielozadaniowy DELL. Za kwotę 25 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (4)
- Bazy danych mikroRNAAutorzy:Michał Wojciech Szcześniak, Elżbieta Owczarkowska, Jakub Gapski, Izabela MakałowskaCzasopismo:Postępy Biochemii (rok: 2012, tom: 58, strony: 91-99), Wydawca: Polskie Towarzystwo BiochemiczneStatus:OpublikowanaDoi:brak - link do publikacji
- miRNEST 2.0: a database of plant and animal microRNAsAutorzy:Michał Wojciech Szcześniak, Izabela MakałowskaCzasopismo:Nucleic Acids Research (rok: 2013, tom: 42, strony: D74-D77), Wydawca: Oxford JournalsStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/nar/gkt1156 - link do publikacji
- HuntMi: an efficient and taxon-specific approach in pre-miRNA identificationAutorzy:Adam Gudyś, Michał Wojciech Szcześniak, Marek Sikora, Izabela MakałowskaCzasopismo:BMC Bioinformatics (rok: 2013, tom: 14, strony: brak numeracji stron), Wydawca: BioMed CentralStatus:OpublikowanaDoi:10.1186/1471-2105-14-83 - link do publikacji
- ERISdb: A Database of Plant Splice Sites and Splicing SignalsAutorzy:Michał Wojciech Szcześniak, Michał Kabza, Rafał Pokrzywa, Adam Gudyś, Izabela MakałowskaCzasopismo:Plant and Cell Physiology (rok: 2013, tom: 54, strony: Pp. e10), Wydawca: Oxford JournalsStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/pcp/pct001 - link do publikacji