Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Modelowanie struktury RNA ukierunkowane na motywy funkcjonalne

2024/53/B/ST6/02789

Słowa kluczowe:

struktura RNA komputerowe modelowanie struktury kwasu nukleinowego analiza motywów strukturalnych motywocentryczna ewaluacja modelu edycja i udokładnianie struktury algorytmy optymalizacyjne sztuczna inteligencja uczenie maszynowe multimodalność

Deskryptory:

  • ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
  • ST6_12: Obliczenia naukowe, narzędzia modelowania i symulacji

Panel:

ST6 - Informatyka i technologie informacyjne: technologie i systemy informacyjne, informatyka, obliczenia naukowe, systemy inteligentne

Jednostka realizująca:

Politechnika Poznańska

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Marta Xymena Szachniuk 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: OPUS 27 - ogłoszony 2024-03-21

Przyznana kwota: 1 238 910 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2025-01-02

Zakończenie projektu: 2029-01-01

Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt w realizacji

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (5)
  1. A retroelement-derived mammalian ARC protein exhibits selective RNA recognition and nucleic acid chaperone functions
    Autorzy:
    Julita Gumna-Mikina, Angelika Andrzejewska-Romanowska, Maciej Antczak, Ewa Tykwinska, Marta Szachniuk, Katarzyna Pachulska-Wieczorek
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2026, tom: 54, strony: gkag207), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkag207 - link do publikacji
  2. FRET-guided selection of RNA 3D structures
    Autorzy:
    Mirko Weber, Felix Erichson, Maciej Antczak, Vanessa Schumann, Josephine Meitzner, Tomasz Zok, Fabio D. Steffen, Marta Szachniuk, Richard Borner
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2026, tom: 54, strony: gkag147), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkag147 - link do publikacji
  3. RNAsolo 2.0: multimodal database to study RNAs, their structural families and intermolecular interfaces
    Autorzy:
    Bartosz Adamczyk, Pawel Boinski, Marta Szachniuk, Maciej Antczak
    Czasopismo:
    Journal of Molecular Biology (rok: 2026, tom: 438, strony: 169570), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.jmb.2025.169570 - link do publikacji
  4. Graph Neural Network and Diffusion Model for modeling RNA interatomic interactions
    Autorzy:
    Marek Justyna, Craig L Zirbel, Maciej Antczak, Marta Szachniuk
    Czasopismo:
    Bioinformatics (rok: 2025, tom: 41, strony: btaf515), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bioinformatics/btaf515 - link do publikacji
  5. Detecting polynucleotide motifs: Pentads, hexads, and beyond
    Autorzy:
    Michal Zurkowski, Maja Marusic, Dorota Gudanis-Sobocinska, Marta Szachniuk
    Czasopismo:
    PLoS Computational Biology (rok: 2025, tom: 21, strony: e1013633), Wydawca: Public Library of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pcbi.1013633 - link do publikacji