Projekty finansowane przez NCN
Ustanowienie uniwersalnego modelu pangenomowego
2022/47/B/ST6/03154
Słowa kluczowe:
pangenom graf sekwencji DNA graf de Bruijna uliniowienie całych genomów sekwencjonowanie DNA algorytm
Deskryptory:
- ST6_013: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
- NZ2_008: Biologia obliczeniowa
- ST1_014: Matematyka dyskretna i kombinatoryka
Panel:
ST6 - Informatyka i technologie informacyjne: technologie i systemy informacyjne, informatyka, obliczenia naukowe, systemy inteligentne
Jednostka realizująca:
Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki
woj. mazowieckie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
Liczba wykonawców projektu: 8
Konkurs: OPUS 24 - ogłoszony 2022-07-15
Przyznana kwota: 488 000 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2023-07-01
Zakończenie projektu: 2026-07-05
Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt w realizacji
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (2)
- From de Bruijn graphs to variation graphs – relationships between pangenome modelsAutorzy:Adam Cicherski, Norbert DojerKonferencja:String Processing and Information Retrieval. SPIRE 2023. (rok: 2023, tom: SPIRE 2023, strony: 114-128), Wydawca: Springer NatureData:konferencja 26-28.09.2023Status:OpublikowanaDoi:10.1007/978-3-031-43980-3_10 - link do publikacji
- AlfaPang: Alignment Free Algorithm for Pangenome Graph ConstructionAutorzy:Adam Cicherski, Anna Lisiecka, Norbert DojerKonferencja:24th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2024) (rok: 2024, tom: WABI 2024, strony: 23:1-23:18), Wydawca: Schloss Dagstuhl – Leibniz-Zentrum für InformatikData:konferencja 2-4.09.2024.Status:OpublikowanaDoi:10.4230/LIPIcs.WABI.2024.23 - link do publikacji