Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Rozszerzona charakteryzacja mikrobiomu z wykorzystaniem synergii wewnętrznych społeczności mikrobiomowej dla lepszego zrozumienia Ekspozomu.

2020/38/E/NZ2/00598

Słowa kluczowe:

mikrobiom ekspozom bioinformatyka uczenie maszynowe

Deskryptory:

  • NZ2_007: Bioinformatyka
  • ST6_013: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
  • NZ2_002: Genomika, transkryptomika i epigenomika

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Jagielloński, Małopolskie Centrum Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego

woj. małopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Paweł Piotr Łabaj 

Liczba wykonawców projektu: 9

Konkurs: SONATA BIS 10 - ogłoszony 2020-07-29

Przyznana kwota: 2 784 522 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2021-05-05

Zakończenie projektu: 2026-05-04

Planowany czas trwania projektu: 60 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt zakończony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (8)
  1. Adaptation to space conditions of novel bacterial species isolated from the International Space Station revealed by functional gene annotations and comparative genome analysis
    Autorzy:
    Lukasz M. Szydlowski, Alper A. Bulbul, Anna C. Simpson, Deniz E. Kaya, Nitin K. Singh, Ugur O. Sezerman, Paweł P. Łabaj, Tomasz Kosciolek & Kasthuri Venkateswaran
    Czasopismo:
    Microbiome (rok: 2024, tom: 12, strony: 190), Wydawca: BioMed Central Ltd
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s40168-024-01916-8 - link do publikacji
  2. HCS—hierarchical algorithm for simulation of omics datasets
    Autorzy:
    Piotr Stomma, Witold R Rudnicki
    Czasopismo:
    Bioinformatics (rok: 2024, tom: 40, Issue Supplement 2, strony: ii98–ii104), Wydawca: OUP
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bioinformatics/btae392 - link do publikacji
  3. Unique Athletic Gut Microbiomes and Their Role in Sports Performance: A Narrative Review
    Autorzy:
    Kinga Humińska-Lisowska, Kinga Zielińska, Paweł P Łabaj
    Czasopismo:
    Journal of Human Kinetics (rok: 2025, tom: 99, strony: 79-97), Wydawca: Termedia Publishing House Ltd.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.5114/jhk/202642 - link do publikacji
  4. High-altitude mountaineering induces adaptive gut microbiome shifts associated with dietary intake and performance markers
    Autorzy:
    Ewa Karpęcka-Gałka, Kinga Zielińska, Barbara Frączek, Paweł P. Łabaj, Tomasz Kościółek & Kinga Humińska-Lisowska
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2025, tom: 15, strony: 37529), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-025-22848-9 - link do publikacji
  5. Healthy microbiome—moving towards functional interpretation
    Autorzy:
    Kinga Zielińska , Klas I Udekwu , Witold Rudnicki , Alina Frolova , Paweł P Łabaj
    Czasopismo:
    GigaScience (rok: 2025, tom: 14, strony: 1–14), Wydawca: OUP
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/gigascience/giaf015 - link do publikacji
  6. Antimicrobial resistance in diverse urban microbiomes: uncovering patterns and predictive markers
    Autorzy:
    Rodolfo Brizola Toscan, Wojciech Lesiński, Piotr Stomma, Balakrishnan Subramanian, Paweł P. Łabaj, Witold R. Rudnicki
    Czasopismo:
    Frontiers in Genetics (rok: 2025, tom: 16, strony: 1460508), Wydawca: Frontiers
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fgene.2025.1460508 - link do publikacji
  7. Analysis of metagenomic data
    Autorzy:
    Liu, S., Rodriguez, J.S., Munteanu, V. et al.
    Czasopismo:
    Nature Reviews Methods Primers (rok: 2025, tom: 5, strony: 5), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s43586-024-00376-6 - link do publikacji
  8. Gut microbiome dynamics and predictive value in hospitalized COVID-19 patients: a comparative analysis of shallow and deep shotgun sequencing
    Autorzy:
    Kopera K, Gromowski T, Wydmański W, Skonieczna-Żydecka K, Muszyńska A, Zielińska K, Wierzbicka-Woś A, Kaczmarczyk M, Kadaj-Lipka R, Cembrowska-Lech D, Januszkiewicz K, Kotfis K, Witkiewicz W, Nalewajska M, Feret W, Marlicz W, Łoniewski I, Łabaj PP, Rydzewska G and Kosciolek T
    Czasopismo:
    Frontier in Microbiology (rok: 2024, tom: 15, strony: 1342749), Wydawca: Frontiers
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fmicb.2024.1342749 - link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy