Projekty finansowane przez NCN
Rozszerzona charakteryzacja mikrobiomu z wykorzystaniem synergii wewnętrznych społeczności mikrobiomowej dla lepszego zrozumienia Ekspozomu.
2020/38/E/NZ2/00598
Słowa kluczowe:
mikrobiom ekspozom bioinformatyka uczenie maszynowe
Deskryptory:
- NZ2_007: Bioinformatyka
- ST6_013: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
- NZ2_002: Genomika, transkryptomika i epigenomika
Panel:
NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca:
Uniwersytet Jagielloński, Małopolskie Centrum Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego
woj. małopolskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
Liczba wykonawców projektu: 9
Konkurs: SONATA BIS 10 - ogłoszony 2020-07-29
Przyznana kwota: 2 784 522 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2021-05-05
Zakończenie projektu: 2026-01-04
Planowany czas trwania projektu: 56 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt zakończony
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (3)
- Gut microbiome dynamics and predictive value in hospitalized COVID-19 patients: a comparative analysis of shallow and deep shotgun sequencingAutorzy:Kopera K, Gromowski T, Wydmański W, Skonieczna-Żydecka K, Muszyńska A, Zielińska K, Wierzbicka-Woś A, Kaczmarczyk M, Kadaj-Lipka R, Cembrowska-Lech D, Januszkiewicz K, Kotfis K, Witkiewicz W, Nalewajska M, Feret W, Marlicz W, Łoniewski I, Łabaj PP, Rydzewska G and Kosciolek TCzasopismo:Frontier in Microbiology (rok: 2024, tom: 15, strony: 1342749), Wydawca: FrontiersStatus:OpublikowanaDoi:10.3389/fmicb.2024.1342749 - link do publikacji
- HCS—hierarchical algorithm for simulation of omics datasetsAutorzy:Piotr Stomma, Witold R RudnickiCzasopismo:Bioinformatics (rok: 2024, tom: 40, Issue Supplement 2, strony: ii98–ii104), Wydawca: OUPStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/bioinformatics/btae392 - link do publikacji
- Adaptation to space conditions of novel bacterial species isolated from the International Space Station revealed by functional gene annotations and comparative genome analysisAutorzy:Lukasz M. Szydlowski, Alper A. Bulbul, Anna C. Simpson, Deniz E. Kaya, Nitin K. Singh, Ugur O. Sezerman, Paweł P. Łabaj, Tomasz Kosciolek & Kasthuri VenkateswaranCzasopismo:Microbiome (rok: 2024, tom: 12, strony: 190), Wydawca: BioMed Central LtdStatus:OpublikowanaDoi:10.1186/s40168-024-01916-8 - link do publikacji