Rozszerzona charakteryzacja mikrobiomu z wykorzystaniem synergii wewnętrznych społeczności mikrobiomowej dla lepszego zrozumienia Ekspozomu.
2020/38/E/NZ2/00598
Słowa kluczowe
Deskryptory
- NZ2_007: Bioinformatyka
- ST6_013: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
- NZ2_002: Genomika, transkryptomika i epigenomika
Panel
NZ2 – Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca
Uniwersytet Jagielloński, Małopolskie Centrum Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego
woj. małopolskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 9
Konkurs
SONATA BIS 10 – ogłoszony 2020-07-29
- Przyznana kwota
- 2 784 522 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2021-05-05
- Zakończenie projektu
- 2026-05-04
- Planowany czas trwania projektu
- 60 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt zakończony
Opis projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga — opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (8)
-
Adaptation to space conditions of novel bacterial species isolated from the International Space Station revealed by functional gene annotations and comparative genome analysis
- Autorzy:
- Lukasz M. Szydlowski, Alper A. Bulbul, Anna C. Simpson, Deniz E. Kaya, Nitin K. Singh, Ugur O. Sezerman, Paweł P. Łabaj, Tomasz Kosciolek & Kasthuri Venkateswaran
- Czasopismo:
- Microbiome (rok: 2024, tom: 12, strony: 190), Wydawca: BioMed Central Ltd
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1186/s40168-024-01916-8 – link do publikacji
-
HCS—hierarchical algorithm for simulation of omics datasets
- Autorzy:
- Piotr Stomma, Witold R Rudnicki
- Czasopismo:
- Bioinformatics (rok: 2024, tom: 40, Issue Supplement 2, strony: ii98–ii104), Wydawca: OUP
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1093/bioinformatics/btae392 – link do publikacji
-
Gut microbiome dynamics and predictive value in hospitalized COVID-19 patients: a comparative analysis of shallow and deep shotgun sequencing
- Autorzy:
- Kopera K, Gromowski T, Wydmański W, Skonieczna-Żydecka K, Muszyńska A, Zielińska K, Wierzbicka-Woś A, Kaczmarczyk M, Kadaj-Lipka R, Cembrowska-Lech D, Januszkiewicz K, Kotfis K, Witkiewicz W, Nalewajska M, Feret W, Marlicz W, Łoniewski I, Łabaj PP, Rydzewska G and Kosciolek T
- Czasopismo:
- Frontier in Microbiology (rok: 2024, tom: 15, strony: 1342749), Wydawca: Frontiers
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3389/fmicb.2024.1342749 – link do publikacji
-
Unique Athletic Gut Microbiomes and Their Role in Sports Performance: A Narrative Review
- Autorzy:
- Kinga Humińska-Lisowska, Kinga Zielińska, Paweł P Łabaj
- Czasopismo:
- Journal of Human Kinetics (rok: 2025, tom: 99, strony: 79-97), Wydawca: Termedia Publishing House Ltd.
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.5114/jhk/202642 – link do publikacji
-
High-altitude mountaineering induces adaptive gut microbiome shifts associated with dietary intake and performance markers
- Autorzy:
- Ewa Karpęcka-Gałka, Kinga Zielińska, Barbara Frączek, Paweł P. Łabaj, Tomasz Kościółek & Kinga Humińska-Lisowska
- Czasopismo:
- Scientific Reports (rok: 2025, tom: 15, strony: 37529), Wydawca: Springer Nature
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1038/s41598-025-22848-9 – link do publikacji
-
Analysis of metagenomic data
- Autorzy:
- Liu, S., Rodriguez, J.S., Munteanu, V. et al.
- Czasopismo:
- Nature Reviews Methods Primers (rok: 2025, tom: 5, strony: 5), Wydawca: Springer Nature
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1038/s43586-024-00376-6 – link do publikacji
-
Healthy microbiome—moving towards functional interpretation
- Autorzy:
- Kinga Zielińska , Klas I Udekwu , Witold Rudnicki , Alina Frolova , Paweł P Łabaj
- Czasopismo:
- GigaScience (rok: 2025, tom: 14, strony: 1–14), Wydawca: OUP
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1093/gigascience/giaf015 – link do publikacji
-
Antimicrobial resistance in diverse urban microbiomes: uncovering patterns and predictive markers
- Autorzy:
- Rodolfo Brizola Toscan, Wojciech Lesiński, Piotr Stomma, Balakrishnan Subramanian, Paweł P. Łabaj, Witold R. Rudnicki
- Czasopismo:
- Frontiers in Genetics (rok: 2025, tom: 16, strony: 1460508), Wydawca: Frontiers
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3389/fgene.2025.1460508 – link do publikacji