Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Lokalne zmiany struktury cząsteczek DNA w wyniku uszkodzenia i naprawy

2018/31/B/ST4/02292

Słowa kluczowe:

DNA spektroskopia Ramana wzmocniona na ostrzu sondy skanującej powierzchniowo wzmocniona spektroskopia Ramana spektroskopia w zakresie podczerwieni uszkodzenia i naprawa DNA zmiana konformacji DNA

Deskryptory:

  • ST4_13: Chemia fizyczna układów biologicznych
  • ST4_3: Metody spektroskopowe i spektrometryczne
  • ST4_4: Struktura i architektura molekularna

Panel:

ST4 - Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej

woj. małopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Marek Szymoński 

Liczba wykonawców projektu: 8

Konkurs: OPUS 16 - ogłoszony 2018-09-14

Przyznana kwota: 2 075 854 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2019-09-01

Zakończenie projektu: 2023-03-29

Planowany czas trwania projektu: 42 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Mikroskop ze skanującą sondą wraz z akcesoriami, model "Omega Scope".
  2. Piezoelektryczny skaner do pozycjonowania wiązki lasera ramanowskiego, instalacja wymaga także zakupu nowego kontrolera AFM/STM. Za kwotę 243 500 PLN
  3. oprogramowanie PLS Toolbox, Mia Toolbox (Eigenvector) (4 szt.). Za kwotę 26 500 PLN
  4. System do wytrawiania chemicznego srebrnych próbników STM. Za kwotę 22 500 PLN
  5. Skaner piezo XYZ pracujący w pętli zamkniętej wraz z akcesoriami.
  6. Kamera CCD z systemem chłodzenia. Za kwotę 130 000 PLN
  7. System to wytrawiania chemicznego złotych próbników STM. Za kwotę 22 500 PLN
  8. program SPIP (Image metrology) (4 szt.). Za kwotę 55 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (10)
  1. Molecular Spectroscopic Markers of Abnormal Protein Aggregation
    Autorzy:
    Natalia Wilkosz, Michał Czaja, Sara Seweryn, Katarzyna Skirlinska-Nosek, Marek Szymonski, Ewelina Lipiec, Kamila Sofinska
    Czasopismo:
    Molecules (rok: 2020, tom: 25, strony: 2498, 1-26), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/molecules25112498 - link do publikacji
  2. Plasmonic hot spots reveal local conformational transitions induced by DNA double-strand breaks
    Autorzy:
    Sara Seweryn, Katarzyna Skirlinska-Nosek, Natalia Wilkosz, Kamila Sofinska, David Perez-Guaita, Magdalena Ocwieja, Jakub Barbasz, Marek Szymonski, Ewelina Lipiec
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2022, tom: 12, strony: 12158), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-022-15313-4 - link do publikacji
  3. Alterations in DNA conformation and histone phosphorylation resulting from double-strand breaks induced in HeLa cells – a spectroscopic and immunostaining approach
    Autorzy:
    Michał Czaja, Magdalena Giergiel, Katarzyna Skirlińska-Nosek, Kamila Sofińska, Dawid Lupa, Sara Seweryn, Olga Adamczyk, Zenon Rajfur, Giovanni Birarda, Federica Piccirilli, Lisa Vaccari, Marek Szymoński, Ewelina Lipiec
    Czasopismo:
    Cell Chemical Biology , Wydawca: Cell Press
    Status:
    Złożona
    Doi:
    brak - link do publikacji
  4. Revealing DNA Structure at Liquid/Solid Interfaces by AFM-Based High-Resolution Imaging and Molecular Spectroscopy
    Autorzy:
    Ewelina Lipiec, Kamila Sofińska, Sara Seweryn, Natalia Wilkosz and Marek Szymoński
    Czasopismo:
    Molecules (rok: 2021, tom: 26(21), strony: 6476), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/molecules26216476 - link do publikacji
  5. Spectroscopic screening of pancreatic cancer
    Autorzy:
    Krzysztof Szymoński, Ewelina Lipiec, Kamila Sofińska, Katarzyna Skirlińska-Nosek, Katarzyna Milan-Ciesielska, Joanna Szporc, Michał Czaja, Sara Seweryn, Natalia Wilkosz, Giovanni Buarda, Federica Piccirilli, Lisa Vaccari, Marek Szymoński
    Czasopismo:
    Clinical Spectroscopy (rok: 2021, tom: 3, strony: 100016(4)), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.clispe.2021.100016 - link do publikacji
  6. Morphological and molecular alterations in metaphase chromosomes induced by bleomycin
    Autorzy:
    Marta Urbańska, Michał Czaja, Kamila Sofińska, Krzysztof Szymoński, Dawid Lupa, Sara Seweryn, Katarzyna Skirlińska - Nosek, Marek Szymoński, Ewelina Lipiec
    Czasopismo:
    Spectrochemica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy , Wydawca: Elsevier
    Status:
    Złożona
    Doi:
    brak - link do publikacji
  7. Optimization of tip-enhanced Raman spectroscopy for probing the chemical structure of DNA
    Autorzy:
    Sara Seweryn, Katarzyna Skirlinska-Nosek, Kamila Sofinska, Konrad Szajna, Jan Kobierski, Kamil Awsiuk, Marek Szymonski, Ewelina Lipiec
    Czasopismo:
    Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy (rok: 2022, tom: 281, strony: 121595), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.saa.2022.121595 - link do publikacji
  8. Detection of bleomycin-induced DNA strand breaks and repair processes in living cells by Raman microscopy
    Autorzy:
    Michał Czaja, Katarzyna Skirlińska-Nosek, Olga Adamczyk, Kamila Sofińska, Natalia Wilkosz, Zenon Rajfur, Marek Szymoński, Ewelina Lipiec
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2022, tom: 23, strony: 3524(1-21)), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms23073524 - link do publikacji
  9. Double-Strand Breaks Quantification by Statistical Length Analysis of DNA Fragments Imaged with AFM
    Autorzy:
    Kamila Sofińska, Michał Cieśla, Jakub Barbasz, Natalia Wilkosz, Ewelina Lipiec, Marek Szymoński, and Piotr Białas
    Czasopismo:
    Measurement (rok: 2022, tom: 198, strony: 111362), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.measurement.2022.111362 - link do publikacji
  10. Molecular Spectroscopic Markers of DNA Damage
    Autorzy:
    Kamila Sofinska , Natalia Wilkosz, Marek Szymonski, Ewelina Lipiec
    Czasopismo:
    Molecules (rok: 2020, tom: 25, strony: 561, 1-24), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/molecules25030561 - link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy