Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Opracowanie kompleksowego zestawu narzędzi obliczeniowych do poszukiwania ligandów określonego receptora na przykładzie receptora serotoninowego 5-HT7.

2018/31/B/NZ2/00165

Słowa kluczowe:

uczenie maszynowe cheminformatyka komputerowo wspomagane projektowanie leków wirtualny skrining

Deskryptory:

  • NZ2_7: Bioinformatyka
  • NZ7_14: Farmacja, farmakoterapia, farmakologia
  • ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Instytut Farmakologii im. Jerzego Maja Polskiej Akademii Nauk

woj. małopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Sabina Podlewska 

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs: OPUS 16 - ogłoszony 2018-09-14

Przyznana kwota: 645 200 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2019-11-26

Zakończenie projektu: 2023-11-25

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt w realizacji

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (1)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (8)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. Emulating Docking Results Using a Deep Neural Network: A New Perspective for Virtual Screening IF: 4,549
    Autorzy:
    Jastrzębski, S.; Szymczak, M.; Pocha, A.; Mordalski, S.; Tabor, J.; Bojarski, A.J.; Podlewska, S.
    Czasopismo:
    Journal of Chemical Information and Modeling (rok: 2020, tom: 60, strony: 4246-4262), Wydawca: Americal Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jcim.9b01202 - link do publikacji
  1. Optimization of pharmacokinetic compound profile of serotonin receptor ligands via machine learning
    Autorzy:
    Podlewska, S.; Kafel, R.
    Konferencja:
    1st International Electronic Conference on Biomedicine (rok: 2021, ), Wydawca: MDPI
    Data:
    konferencja 2021-06-01-2021-06-26
    Status:
    Opublikowana
  2. Detection of structural features influencing compound physicochemical properties with the use of SHAP values
    Autorzy:
    Pocha, A.; Jankowski, R.; Podlewska, S.
    Konferencja:
    Paul Ehrlich Euro-PhD Network Virtual Meeting 2021 (rok: 2021, ), Wydawca: Paul Ehrlich Euro-PhD Network
    Data:
    konferencja 2021-07-26-2021-07-28
    Status:
    Opublikowana
  3. Not only affinity - machine-learning-based tools for optimization of ligand physicochemical properties
    Autorzy:
    Kafel, R.; Podlewska, S.
    Konferencja:
    EMFC-ISMC&EFMC-YMCS (rok: 2020, ), Wydawca: The European Federation for Medicinal Chemistry
    Data:
    konferencja 44083
    Status:
    Opublikowana
  4. Optimization of Metabolic Stability of Ligands of Serotonin Receptor 5-HT7 Using SHAP Values
    Autorzy:
    Pocha, A.; Jankowski, R.; Podlewska, S.
    Konferencja:
    1st International Electronic Conference on Biomedicine (rok: 2021, ), Wydawca: MDPI
    Data:
    konferencja 2021-06-01-2021-06-26
    Status:
    Opublikowana
  5. SHAP-based tools for ADMET compounds profiling on the example of metabolic stability optimization
    Autorzy:
    Wojtuch, A.; Jankowski, R.; Podlewska, S.
    Konferencja:
    7th International Electronic Conference on Medicinal Chemistry (rok: 2021, ), Wydawca: MDPI
    Data:
    konferencja 2021-11-01-2021-11-30
    Status:
    Opublikowana
  6. Optimization of ADMET properties – ligand- and structure-based approach
    Autorzy:
    Kafel, R.; Podlewska, S.
    Konferencja:
    7th International Electronic Conference on Medicinal Chemistry (rok: 2021, ), Wydawca: MDPI
    Data:
    konferencja 2021-11-01-2021-11-30
    Status:
    Opublikowana
  7. Profiling compound ADMET properties with the assistance of SHAP values
    Autorzy:
    Wojtuch, A.; Jankowski, R.; Podlewska, S.
    Konferencja:
    The Fifth General Meeting of the European Research Network on Signal Transduction: Bridging Perspectives and Networking in Signal Transduction Research (rok: 2021, ), Wydawca: University of Bari
    Data:
    konferencja 2021-10-04-2021-10-08
    Status:
    Opublikowana
  8. Optimization of compounds ADMET properties via machine-learning-based tools
    Autorzy:
    Podlewska, S.; Kafel, R.
    Konferencja:
    The 6th International Electronic Conference on Medicinal Chemistry (rok: 2020, ), Wydawca: MDPI
    Data:
    konferencja 2020-11-01-2020-11-30
    Status:
    Opublikowana
  1. Post-processing of Docking Results: Tools and Strategies
    Autorzy:
    Podlewska, S.; Bojarski, A.J.
    Książka:
    Molecular Docking for Computer-Aided Drug Design. Fundamentals, Techniques, Resources and Applications (rok: 2021, tom: 1, strony: 57-74), Wydawca: Academic Press
    Status:
    Opublikowana