Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Narzędzia CRISPR do badania rozwoju zarodkowego danio pręgowanego

2017/27/L/NZ2/03234

Słowa kluczowe:

CRISPR danio pręgowany kompleks Csm wyciszenie transkryptu

Deskryptory:

  • NZ1_9: Biotechnologia
  • NZ2_1: Genetyka molekularna
  • NZ3_13: Biologia rozwoju zwierząt

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Matthias Bochtler 

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs: DAINA 1 - ogłoszony 2017-09-15

Przyznana kwota: 1 634 500 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2018-09-01

Zakończenie projektu: 2023-08-31

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt w realizacji

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (8)
  1. DNA adenine methylation in eukaryotes: Enzymatic mark or a form of DNA damage?
    Autorzy:
    Bochtler M, Fernandes H.
    Czasopismo:
    Bioessays (rok: 2021, tom: 43, strony: e2000243), Wydawca: Wiley Periodicals LLC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/bies.202000243 - link do publikacji
  2. Protein Domain Guided Screen for Sequence Specific and Phosphorothioate-Dependent Restriction Endonucleases
    Autorzy:
    Lutz T, Czapinska H, Fomenkov A, Potapov V, Heiter DF, Cao B, Dedon P, Bochtler M, Xu SY.
    Czasopismo:
    Front Microbiol. (rok: 2020, tom: 11, strony: 1960), Wydawca: Frontiers Media SA
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fmicb.2020.01960 - link do publikacji
  3. A protein architecture guided screen for modification dependent restriction endonucleases
    Autorzy:
    Thomas Lutz, Kiersten Flodman, Alyssa Copelas, Honorata Czapinska, Megumu Mabuchi, Alexey Fomenkov, Xinyi He, Matthias Bochtler, and Shuang-yong Xu
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2019, tom: 47, strony: 9761–9776), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkz755 - link do publikacji
  4. Arrhenius-law-governed homo- and heteroduplex dissociation
    Autorzy:
    Matthias Bochtler
    Czasopismo:
    Physical Review E (rok: 2020, tom: 101, strony: 32405), Wydawca: American Physical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1103/PhysRevE.101.032405 - link do publikacji
  5. Crystal structure of the EcoKMcrA N-terminal domain (NEco): recognition of modified cytosine bases without flipping
    Autorzy:
    Anton Slyvka, Evelina Zagorskaite, Honorata Czapinska, Giedrius Sasnauskas, Matthias Bochtler
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2019, tom: 47, strony: 11943-11955), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkz101 - link do publikacji
  6. Crystal structures of the EVE-HNH endonuclease VcaM4I in the presence and absence of DNA.
    Autorzy:
    Pastor M, Czapinska H, Helbrecht I, Krakowska K, Lutz T, Xu SY, Bochtler M.
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Res. (rok: 2021, tom: 49, strony: 1708-1723), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkaa1218 - link do publikacji
  7. Reversal of nucleobase methylation by dioxygenases
    Autorzy:
    Xu GL, Bochtler M.
    Czasopismo:
    Nature Chemical Biology (rok: 2020, tom: 16, strony: 1160–1169), Wydawca: Springer Nature Limited
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41589-020-00675-5 - link do publikacji
  8. Targeted RNA Knockdown by a Type III CRISPR-Cas Complex in Zebrafish
    Autorzy:
    Thomas Fricke, Dalia Smalakyte, Maciej Lapinski, Abhishek Pateria, Charles Weige, Michal Pastor, Agnieszka Kolano, Cecilia Winata, Virginijus Siksnys, Gintautas Tamulaitis, and Matthias Bochtler
    Czasopismo:
    The CRISPR Journal (rok: 2020, tom: 4, strony: 299-313), Wydawca: Mary Ann Liebert, Inc
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1089/crispr.2020.0032 - link do publikacji