Projekty finansowane przez NCN
Wieloskalowe symulacje dynamiki molekularnej w celu zbadania struktury oligomerów amyloidów beta.
2017/27/N/NZ1/02871
Słowa kluczowe:
oligomery amyloidów beta dynamika molekularna choroba Alzheimera pełnoatomowe i gruboziarniste pola siłowe
Deskryptory:
- NZ2_10: Modelowanie i symulacje biologiczne
- ST4_4: Struktura i architektura molekularna
- NZ1_1: Biologia molekularna
Panel:
NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia
Jednostka realizująca:
Instytut Fizyki Polskiej Akademii Nauk
woj. mazowieckie
Konkurs: PRELUDIUM 14 - ogłoszony 2017-09-15
Przyznana kwota: 113 400 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2018-07-20
Zakończenie projektu: 2021-07-19
Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- Dyski twarde. Za kwotę 3 138 PLN
- Karty graficzne. Za kwotę 7 212 PLN
- Stacja robocza z kartą graficzną. Za kwotę 10 000 PLN
- Magazyn danych. Za kwotę 9 000 PLN
- Program i pole siłowe Amber.. Za kwotę 2 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (2)
- Properties of monomeric Aβ42 probed by different sampling methods and force fields: Role of energy componentsAutorzy:Krupa Pawel and Pham Dinh Quoc Huy and Mai Suan LiCzasopismo:The Journal of chemical physics (rok: 2019, tom: 151, strony: 55101), Wydawca: AIP Publishing LLCStatus:OpublikowanaDoi:10.1063/1.5093184 - link do publikacji
- Structure and Physicochemical Properties of the Aβ42 Tetramer: Multiscale Molecular Dynamics SimulationsAutorzy:Hoang Linh Nguyen, Pawel Krupa, Nguyen Minh Hai, Huynh Quang Linh, and Mai Suan LiCzasopismo:The Journal of Physical Chemistry B (rok: 2019, tom: 123, strony: 7253-7269), Wydawca: ACS PublicationsStatus:OpublikowanaDoi:10.1021/acs.jpcb.9b04208 - link do publikacji