Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Wieloskalowe symulacje dynamiki molekularnej w celu zbadania struktury oligomerów amyloidów beta.

2017/27/N/NZ1/02871

Słowa kluczowe:

oligomery amyloidów beta dynamika molekularna choroba Alzheimera pełnoatomowe i gruboziarniste pola siłowe

Deskryptory:

  • NZ2_10: Modelowanie i symulacje biologiczne
  • ST4_4: Struktura i architektura molekularna
  • NZ1_1: Biologia molekularna

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Instytut Fizyki Polskiej Akademii Nauk

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

Dinh Quoc Huy Pham 

Liczba wykonawców projektu: 3

Konkurs: PRELUDIUM 14 - ogłoszony 2017-09-15

Przyznana kwota: 113 400 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2018-07-20

Zakończenie projektu: 2021-07-19

Planowany czas trwania projektu: 24 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Magazyn danych. Za kwotę 9 000 PLN
  2. Program i pole siłowe Amber.. Za kwotę 2 000 PLN
  3. Dyski twarde. Za kwotę 3 138 PLN
  4. Stacja robocza z kartą graficzną. Za kwotę 10 000 PLN
  5. Karty graficzne. Za kwotę 7 212 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (2)
  1. Properties of monomeric Aβ42 probed by different sampling methods and force fields: Role of energy components IF: 2,997
    Autorzy:
    Krupa Pawel and Pham Dinh Quoc Huy and Mai Suan Li
    Czasopismo:
    The Journal of chemical physics (rok: 2019, tom: 151, strony: 55101), Wydawca: AIP Publishing LLC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1063/1.5093184 - link do publikacji
  2. Structure and Physicochemical Properties of the Aβ42 Tetramer: Multiscale Molecular Dynamics Simulations IF: 2,923
    Autorzy:
    Hoang Linh Nguyen, Pawel Krupa, Nguyen Minh Hai, Huynh Quang Linh, and Mai Suan Li
    Czasopismo:
    The Journal of Physical Chemistry B (rok: 2019, tom: 123, strony: 7253-7269), Wydawca: ACS Publications
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpcb.9b04208 - link do publikacji