Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Bardziej dokładne modele potencjału elektrostatycznego makrocząsteczek biologicznych i kryształów organicznych niezbędne dla właściwej interpretacji danych z mikroskopii krioelektronowej i z dyfrakcji elektronów - studium możliwości

2017/27/B/ST4/02721

Słowa kluczowe:

atomowe czynniki rozpraszania elektronów krystalografia kwantowa udokładnianie struktury potencjał elektrostatyczny

Deskryptory:

  • ST4_4: Struktura i architektura molekularna
  • NZ1_4: Biologia strukturalna
  • ST3_1: Struktura ciał stałych i płynów

Panel:

ST4 - Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Paulina Dominiak 

Liczba wykonawców projektu: 8

Konkurs: OPUS 14 - ogłoszony 2017-09-15

Przyznana kwota: 1 792 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2018-08-01

Zakończenie projektu: 2022-08-02

Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Zestaw specjalistycznych komputerów wraz z niezbędnym oprogramowaniem i sprzętem uzupełniającym niezbędnym do realizacji projektu. Za kwotę 35 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (7)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (7)
  1. TAAM: A reliable and user friendly tool for hydrogen atom location using routine X-Ray diffraction data
    Autorzy:
    Kunal Kumar Jha, Barbara Gruza, Prashant Kumar, Michał Leszek Chodkiewicz, Paulina Maria Dominiak
    Czasopismo:
    Acta Crystallographica Section B-Structural Science Crystal Engineering And Materials (rok: 2020, tom: 76, strony: 296-306), Wydawca: INT UNION CRYSTALLOGRAPHY, 2 ABBEY SQ, CHESTER, CH1 2HU, ENGLAND
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1107/S2052520620002917 - link do publikacji
  2. Aspherical atom refinements on X-ray data of diverse structures including disordered and covalent organic framework systems: a time–accuracy trade-off
    Autorzy:
    Kunal Kumar Jha, Florian Kleemiss, Michal Leszek Chodkiewicz and Paulina Maria Dominiak
    Czasopismo:
    Journal of Applied Crystallography (rok: 2023, tom: 56, strony: brak), Wydawca: INT UNION CRYSTALLOGRAP HY, 2 ABBEY SQ, CHESTER, CH1 2HU, ENGLAND
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1107/S1600576722010883 - link do publikacji
  3. Theoretical 3D ED electrostatic potential density maps of proteins modeled with multipolar pseudoatom data bank
    Autorzy:
    Marta Kulik, Michał Leszek Chodkiewicz, Paulina Maria Dominiak
    Czasopismo:
    Acta Crystallographica Section D STRUCTURAL BIOLOGY (rok: 2022, tom: 78, strony: 1010-1020), Wydawca: INT UNION CRYSTALLOGRAPHY, 2 ABBEY SQ, CHESTER, CH1 2HU, ENGLAND
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1107/S2059798322005836 - link do publikacji
  4. Multipolar Atom Types from Theory and Statistical Clustering (MATTS) Data Bank: Restructurization and Extension of UBDB
    Autorzy:
    Kunal Kumar Jha, Barbara Gruza, Aleksandra Sypko, Prashant Kumar, Michał Leszek Chodkiewicz, Paulina Maria Dominiak
    Czasopismo:
    Journal of Chemical Information and Modeling (rok: 2022, tom: 62, strony: 3752-3765), Wydawca: AMER CHEMICAL SOC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jcim.2c00144 - link do publikacji
  5. Multipolar Atom Types from Theory and Statistical Clustering (MATTS) Data Bank: Impact of Surrounding Atoms on Electron Density from Cluster Analysis
    Autorzy:
    Paulina Maria Rybicka, Marta Kulik, Michał Leszek Chodkiewicz, Paulina Maria Dominiak
    Czasopismo:
    Journal of Chemical Information and Modeling (rok: 2022, tom: 62, strony: 3766-3783), Wydawca: AMER CHEMICAL SOC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jcim.2c00145 - link do publikacji
  6. Refinement of organic crystal structures with multipolar electron scattering factors
    Autorzy:
    Barbara Gruza, Michał Leszek Chodkiewicz, Joanna Krzeszczakowska and Paulina Maria Dominiak
    Czasopismo:
    Acta Crystallographica Section A-Foundation And Advances (rok: 2020, tom: 76, strony: 92-109), Wydawca: INT UNION CRYSTALLOGRAPHY, 2 ABBEY SQ, CHESTER, CH1 2HU, ENGLAND
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1107/S2053273319015304 - link do publikacji
  7. Refinements on electron diffraction data of β-glycine in MoPro: a quest for an improved structure model
    Autorzy:
    K. K. Jha, B. Gruza, M. L. Chodkiewicz, C. Jelsch and P. M. Dominiak
    Czasopismo:
    Journal of Applied Crystallography (rok: 2021, tom: 54, strony: 1234-1243), Wydawca: INT UNION CRYSTALLOGRAP HY, 2 ABBEY SQ, CHESTER, CH1 2HU, ENGLAND
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1107/S160057672100580X - link do publikacji
  1. Model dependence (IAM versus TAAM) of B factors – cases of X-ray and electron diffraction
    Autorzy:
    B. Gruza, C. Jelsch and P. M. Dominiak
    Konferencja:
    School on Electron Crystallography, the XXV IUCr Congress, Prague, Czech Republic (rok: 2021, ), Wydawca: INT UNION CRYSTALLOGRAP HY, 2 ABBEY SQ, CHESTER, CH1 2HU, ENGLAND
    Data:
    konferencja 11-13.08.2021, 14-22.08.2021
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    link do publikacji
  2. TAAM: a reliable and user-friendly tool for hydrogen-atom location using X-ray diffraction data
    Autorzy:
    M. Chodkiewicz, K. Jha, B. Gruza and P. Dominiak
    Konferencja:
    the 32nd European Crystallographic Meeting, Vienna, Austria (rok: 2019, ), Wydawca: INT UNION CRYSTALLOGRAP HY, 2 ABBEY SQ, CHESTER, CH1 2HU, ENGLAND
    Data:
    konferencja 18-23.08.2019
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    link do publikacji
  3. Refinement on electron diffraction data in MoPro: a quest for improved structure model
    Autorzy:
    K. K. Jha, B. Gruza, M. Chodkiewicz, C. Jelsch and P. Dominiak
    Konferencja:
    the XXV IUCr Congress, Prague, Czech Republic (rok: 2021, ), Wydawca: INT UNION CRYSTALLOGRAP HY, 2 ABBEY SQ, CHESTER, CH1 2HU, ENGLAND
    Data:
    konferencja 14-22.08.2021
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    link do publikacji
  4. Refinement of organic crystal structure with multipolar electron scattering factors
    Autorzy:
    B. Gruza, M. Chodkiewicz, J. Krzeszczakowska and P. Dominiak
    Konferencja:
    the 32nd European Crystallographic Meeting, Vienna, Austria (rok: 2019, ), Wydawca: INT UNION CRYSTALLOGRAP HY, 2 ABBEY SQ, CHESTER, CH1 2HU, ENGLAND
    Data:
    konferencja 18-23.08.2019
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    link do publikacji
  5. Moving quantum crystallography from sub-atomic XRD to near-atomic 3D-ED
    Autorzy:
    P. M. Dominiak, M. L. Chodkiewicz, B. Gruza, K. K. Jha, M. Kulik, P. Rybicka and A. Sypko
    Konferencja:
    the XXV IUCr Congress, Prague, Czech Republic (rok: 2021, ), Wydawca: INT UNION CRYSTALLOGRAP HY, 2 ABBEY SQ, CHESTER, CH1 2HU, ENGLAND
    Data:
    konferencja 14-22.08.2021
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    link do publikacji
  6. Refinement with multipolar scattering factors
    Autorzy:
    B. Gruza, M. L. Chodkiewicz and P. M. Dominiak
    Konferencja:
    the XXV IUCr Congress, Prague, Czech Republic (rok: 2021, ), Wydawca: INT UNION CRYSTALLOGRAP HY, 2 ABBEY SQ, CHESTER, CH1 2HU, ENGLAND
    Data:
    konferencja 14-22.08.2021
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    link do publikacji
  7. Theoretical electrostatic potential maps of macromolecules calculated with multipolar electron scattering factors
    Autorzy:
    M. Kulik, M. L. Chodkiewicz and P. M. Dominiak
    Konferencja:
    the XXV IUCr Congress, Prague, Czech Republic (rok: 2021, ), Wydawca: INT UNION CRYSTALLOGRAP HY, 2 ABBEY SQ, CHESTER, CH1 2HU, ENGLAND
    Data:
    konferencja 14-22.08.2021
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy