Projekty finansowane przez NCN
Molekularne mechanizmy komunikacji allosterycznej w syntazie tymidylanowej
2017/27/N/NZ1/00716
Słowa kluczowe:
dynamika molekularna efekty allosteryczne syntaza tymidylanowa
Deskryptory:
- NZ2_10: Modelowanie i symulacje biologiczne
- NZ2_7: Bioinformatyka
- NZ1_2: Biochemia
Panel:
NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia
Jednostka realizująca:
Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego
woj. mazowieckie
Konkurs: PRELUDIUM 14 - ogłoszony 2017-09-15
Przyznana kwota: 106 000 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2018-08-27
Zakończenie projektu: 2022-02-26
Planowany czas trwania projektu: 42 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- Jednostka obliczeniowa (2 szt.). Za kwotę 23 000 PLN
- Komputer przenośny.
- Komputer stacjonarny z monitorem.
- Program Amber. Za kwotę 1 800 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (2)
- Rossmann-toolbox: a deep learning-based protocol for the prediction and design of cofactor specificity in Rossmann fold proteinsAutorzy:Kamil Kamiński, Jan Ludwiczak, Maciej Jasiński, Adriana Bukala, Rafal Madaj, Krzysztof Szczepaniak, Stanisław Dunin-HorkawiczCzasopismo:Briefings in Bioinformatics (rok: 2022, tom: 23, strony: 45302), Wydawca: Oxford University PressStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/bib/bbab371 - link do publikacji
- localpdb - a Python package to manage protein structures and their annotationsAutorzy:Jan Ludwiczak, Aleksander Wiński, Stanisław Dunin-HorkawiczCzasopismo:Bioinformatics (rok: 2022, tom: -, strony: -), Wydawca: Oxford University PressStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/bioinformatics/btac121 - link do publikacji