Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Kompresja wielkoskalowych kolekcji danych genomowych

2017/25/B/ST6/01525

Słowa kluczowe:

kompresja danych dane genomowe sekwencjonowanie genomów

Deskryptory:

  • ST6_6: Algorytmika, algorytmy równoległe, rozproszone i sieciowe, algorytmiczna teoria gier
  • ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne

Panel:

ST6 - Informatyka i technologie informacyjne: technologie i systemy informacyjne, informatyka, obliczenia naukowe, systemy inteligentne

Jednostka realizująca:

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

woj. śląskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Sebastian Deorowicz 

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs: OPUS 13 - ogłoszony 2017-03-15

Przyznana kwota: 457 800 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2018-02-01

Zakończenie projektu: 2022-02-13

Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Mobilna stacja robocza 2. Za kwotę 14 000 PLN
  2. Mobilna stacja robocza 1. Za kwotę 14 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (4)
  1. VCFShark: how to squeeze a VCF file
    Autorzy:
    Sebastian Deorowicz, Agnieszka Danek, Marek Kokot
    Czasopismo:
    Bioinformatics (rok: 2021, tom: 37, strony: 3358-3360), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bioinformatics/btab211 - link do publikacji
  2. FQSqueezer: k-mer-based compression of sequencing data
    Autorzy:
    Sebastian Deorowicz
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2020, tom: 10, strony: 578), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-020-57452-6 - link do publikacji
  3. GTShark: Genotype compression in large project
    Autorzy:
    Sebastian Deorowicz, Agnieszka Danek
    Czasopismo:
    Bioinformatics (rok: 2019, tom: 35, strony: 4791-4793), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bioinformatics/btz508 - link do publikacji
  4. AGC: Compact representation of assembled genomes
    Autorzy:
    Sebastian Deorowicz, Agnieszka Danek, Heng Li
    Czasopismo:
    Nature Biotechnology , Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Złożona
    Doi:
    brak - link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy