Metody klasyfikacji nadzorowanej i nienadzorowanej fragmentów metagenomowego DNA wyekstrahowanych z różnych próbek środowiskowych
2015/19/D/ST6/03252
Słowa kluczowe
Deskryptory
- ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
- ST6_6: Algorytmika, algorytmy równoległe, rozproszone i sieciowe, algorytmiczna teoria gier
Panel
ST6 – Informatyka i technologie informacyjne: technologie i systemy informacyjne, informatyka, obliczenia naukowe, systemy inteligentne
Jednostka realizująca
Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki
woj. śląskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 1
Konkurs
SONATA 10 – ogłoszony 2015-09-15
- Przyznana kwota
- 306 840 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2016-09-06
- Zakończenie projektu
- 2022-09-05
- Planowany czas trwania projektu
- 72 miesiące (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Opis projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga — opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- Wysokiej klasy komputer przenośny z dodatkowym monitorem. Za kwotę 15 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (1)
-
Environmental metagenome classification for constructing a microbiome fingerprint
- Autorzy:
- Jolanta Kawulok, Michal Kawulok, Sebastian Deorowicz
- Czasopismo:
- Biology Direct (rok: 2019, tom: 14, strony: 20), Wydawca: BioMed Central
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1186/s13062-019-0251-z – link do publikacji
Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (3)
-
Metagenomic Clustering in Search of Common Origin
- Autorzy:
- Jolanta Kawulok, Michal Kawulok
- Konferencja:
- 11th International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms (BIOINFORMATICS 2020)/13th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies (BIOSTEC 2020) (rok: 2020, strony: 218-225), Wydawca: SciTePress
- Data:
- konferencja 43885
- Status:
- Opublikowana
-
Environmental Metagenome Classification for Soil-based Forensic Analysis
- Autorzy:
- Jolanta Kawulok, Michal Kawulok
- Konferencja:
- 9th International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms (BIOINFORMATICS 2018) (rok: 2018, strony: 182-187), Wydawca: Proceedings of the 11th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies - Volume 4: BIOINFORMATICS
- Data:
- konferencja 19 sty 2018 – 21 sty 2018
- Status:
- Opublikowana
-
A genetic algorithm for classifying metagenomic data
- Autorzy:
- Jolanta Kawulok, Michal Kawulok
- Konferencja:
- The Genetic and Evolutionary Computation Conference (GECCO '22) (rok: 2022, strony: 59–60), Wydawca: Association for Computing Machinery
- Data:
- konferencja July 9-13, 2022
- Status:
- Opublikowana
Publikacje książkowe (1)
-
ANALYSIS OF THE READS OBTAINED FROM METAGENOME SEQUENCING
- Autorzy:
- Jolanta Kawulok
- Książka:
- Artificial Intelligence and Data Processing. The monograph presenting the achievements of the Silesian University of Technology research staff (strony: 308-314), Wydawca: Politechnika Śląska
- Status:
- Przyjęta do publikacji