Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Metody klasyfikacji nadzorowanej i nienadzorowanej fragmentów metagenomowego DNA wyekstrahowanych z różnych próbek środowiskowych

2015/19/D/ST6/03252

Słowa kluczowe:

porównywanie ciągów symboli wyszukiwanie podobieństwa sekwencji klasyfikacja odczytów metagenomowych klasyfikacja taksonomiczna binning metagenomika

Deskryptory:

  • ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
  • ST6_6: Algorytmika, algorytmy równoległe, rozproszone i sieciowe, algorytmiczna teoria gier

Panel:

ST6 - Informatyka i technologie informacyjne: technologie i systemy informacyjne, informatyka, obliczenia naukowe, systemy inteligentne

Jednostka realizująca:

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

woj. śląskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Jolanta Kawulok 

Liczba wykonawców projektu: 1

Konkurs: SONATA 10 - ogłoszony 2015-09-15

Przyznana kwota: 306 840 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2016-09-06

Zakończenie projektu: 2022-09-05

Planowany czas trwania projektu: 72 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Wysokiej klasy komputer przenośny z dodatkowym monitorem. Za kwotę 15 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (1)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (3)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. Environmental metagenome classification for constructing a microbiome fingerprint
    Autorzy:
    Jolanta Kawulok, Michal Kawulok, Sebastian Deorowicz
    Czasopismo:
    Biology Direct (rok: 2019, tom: 14, strony: 20), Wydawca: BioMed Central
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s13062-019-0251-z - link do publikacji
  1. A genetic algorithm for classifying metagenomic data
    Autorzy:
    Jolanta Kawulok, Michal Kawulok
    Konferencja:
    The Genetic and Evolutionary Computation Conference (GECCO '22) (rok: 2022, ), Wydawca: Association for Computing Machinery
    Data:
    konferencja July 9-13, 2022
    Status:
    Opublikowana
  2. Environmental Metagenome Classification for Soil-based Forensic Analysis
    Autorzy:
    Jolanta Kawulok, Michal Kawulok
    Konferencja:
    9th International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms (BIOINFORMATICS 2018) (rok: 2018, ), Wydawca: Proceedings of the 11th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies - Volume 4: BIOINFORMATICS
    Data:
    konferencja 19 sty 2018 – 21 sty 2018
    Status:
    Opublikowana
  3. Metagenomic Clustering in Search of Common Origin
    Autorzy:
    Jolanta Kawulok, Michal Kawulok
    Konferencja:
    11th International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms (BIOINFORMATICS 2020)/13th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies (BIOSTEC 2020) (rok: 2020, ), Wydawca: SciTePress
    Data:
    konferencja 43885
    Status:
    Opublikowana
  1. ANALYSIS OF THE READS OBTAINED FROM METAGENOME SEQUENCING
    Autorzy:
    Jolanta Kawulok
    Książka:
    Artificial Intelligence and Data Processing. The monograph presenting the achievements of the Silesian University of Technology research staff (), Wydawca: Politechnika Śląska
    Status:
    Przyjęta do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy