Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Narzędzia bioinformatyczne do automatycznej identyfikacji obszarów guza i jego heterogeniczności na bazie profili metabolomicznych pozyskiwanych spektrometrycznymi technikami obrazowania molekularnego

2015/19/B/ST6/01736

Słowa kluczowe:

bioinformatyka MALDI-IMS analiza widm masowych modelowanie matematyczne sztuczna inteligencja statystyka stosowana nowotwory

Deskryptory:

  • ST6_11: Uczenie maszynowe, statystyczne przetwarzanie danych i zastosowanie w przetwarzaniu sygnałów
  • ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
  • NZ2_4: Metabolomika

Panel:

ST6 - Informatyka i technologie informacyjne: technologie i systemy informacyjne, informatyka, obliczenia naukowe, systemy inteligentne

Jednostka realizująca:

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

woj. śląskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Joanna Polańska 

Liczba wykonawców projektu: 7

Konkurs: OPUS 10 - ogłoszony 2015-09-15

Przyznana kwota: 850 640 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2016-06-28

Zakończenie projektu: 2020-06-27

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (26)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (35)
  • Publikacje książkowe (7)
  1. Discrimination of papillary thyroid cancer from non-cancerous thyroid tissue based on lipid profiling by mass spectrometry imaging IF: 1,059
    Autorzy:
    Wojakowska A., Cole L., Chekan M., Bednarczyk K., Maksymiak M., Oczko-Wojciechowska M., Jarząb B., Clench M., Polańska J., Pietrowska M., Widlak P.
    Czasopismo:
    Endokrynologia Polska (rok: 2018, tom: 69, strony: 44965), Wydawca: Via Medica
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.5603/EP.a2018.0003 - link do publikacji
  2. Identification of two novel mutations in human acute myeloid leukemia cases IF: 3,28
    Autorzy:
    O'Brien, G., Zyla, J., Manola, K., Pagoni, M., Polanska, J., Badie, C.
    Czasopismo:
    Leukemia and Lymphoma (rok: 2021, tom: 62 (2), strony: 454-461), Wydawca: Taylor & Francis Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1080/10428194.2020.1832664 - link do publikacji
  3. Ionizing radiation affects the composition of the proteome of extracellular vesicles released by head-and-neck cancer cells in vitro IF: 2,014
    Autorzy:
    Abramowicz A., Wojakowska A., Marczak Ł., Lysek-Gladysinska M., Smolarz M., Story M.D., Polańska J., Widlak P., Pietrowska M.
    Czasopismo:
    Journal of Radiation Research (rok: 2019, tom: 60(3), strony: 289-297), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/jrr/rrz001 - link do publikacji
  4. Proteomic profile of melanoma cell-derived sEV in patients' plasma: a potential correlate of melanoma progression IF: 14,976
    Autorzy:
    Pietrowska M., Zebrowska A., Gawin M., Marczak L., Sharma P., Mondal S., Mika J., Polańska J., Ferrone S., Kirkwood J. M., Widlak P., Whiteside T. L.
    Czasopismo:
    Journal of Extracellular Vesicles (rok: 2020, tom: 10, strony: 44940), Wydawca: Wiley Periodicals, LLC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/jev2.12063 - link do publikacji
  5. Broadside: Distributed high-dimensional feature selection and interaction mining for classification, regression and survival analysis. IF: 5,61
    Autorzy:
    Krol L., Tarnawski R., Polanska J.
    Czasopismo:
    Bioinformatics (rok: 2018, tom: bd, strony: bd), Wydawca: OXFORD UNIV PRESS
    Status:
    Złożona
    Doi:
    brak - link do publikacji
  6. Initializing the EM Algorithm for Univariate Gaussian, Multi-Component, Heteroscedastic Mixture Models by Dynamic Programming Partitions IF: 1,053
    Autorzy:
    Polanski A., Marczyk M., Pietrowska M., Widlak P., Polanska J.
    Czasopismo:
    International Journal of Computational Methods (rok: 2018, tom: 15, strony: 1850012-1 - 1850012-21), Wydawca: World Scientific
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1142/S0219876218500123 - link do publikacji
  7. Kras mutations and PU.1 promoter methylation are new pathways in murine radiation-induced AML IF: 4,603
    Autorzy:
    O'Brien G., Cruz-Garcia L., Zyla J., , Brown N., Finnon R., Polanska J., Badie C.
    Czasopismo:
    Carcinogenesis (rok: 2020, tom: 41(8), strony: 1104–1112), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/carcin/bgz175 - link do publikacji
  8. Machine learning techniques combined with dose profiles indicate radiation response biomarkers IF: 1,504
    Autorzy:
    Papież A., Badie C., Polańska J.
    Czasopismo:
    International Journal of Applied Mathematics and Computer Science (rok: 2019, tom: 29(1), strony: 169-178), Wydawca: University of Zielona Góra
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.2478/amcs-2019-0013 - link do publikacji
  9. Systemic Effects of Radiotherapy and Concurrent Chemo-Radiotherapy in Head and Neck Cancer Patients—Comparison of Serum Metabolome Profiles IF: 4,097
    Autorzy:
    Jelonek K., Krzywon A., Jablonska P., Slominska E.M., Smolenski R.T., Polanska J., Rutkowski T., Mrochem-Kwarciak J., Skladowski K., Widlak P.
    Czasopismo:
    Metabolites (rok: 2020, tom: 10(60), strony: 44941), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/metabo10020060 - link do publikacji
  10. A new approach to isotopic envelope identification by analysis of spatial distribution of components in Mass Spectrometry Imaging IF: 3,756
    Autorzy:
    Glodek A., Joanna Polańska J., Marta Gawin M.
    Czasopismo:
    PROTEINS: Structure, Function, and Bioinformatics (rok: 2021, tom: bd, strony: bd), Wydawca: Wiley Periodicals LLC
    Status:
    Złożona
    Doi:
    brak - link do publikacji
  11. Germline DNA Retention in Murine and Human Rearranged T Cell Receptor Gene Coding Joints: Alternative Recombination Signal Sequences and V(D)J Recombinase Errors IF: 4,716
    Autorzy:
    Mika J., Kabacik S., Badie C., Polanska J., Candéias S.
    Czasopismo:
    Frontiers in Immunology (rok: 2019, tom: 2,24791666666667, strony: 44941), Wydawca: Front. Immunol.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fimmu.2019.02637 - link do publikacji
  12. MiMSeg - an algorithm for automated detection of tumor tissue on NMR apparent diffusion coefficient maps IF: 4,832
    Autorzy:
    Binczyk F., Bram S., Weber C., Goetz M., Maier-Hein K., Meinzer H., Bobek-Billewicz B., Tarnawski R., Polanska J.
    Czasopismo:
    Information Sciences (rok: 2017, tom: 384, strony: 235–248), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.ins.2016.07.052 - link do publikacji
  13. Platelets Restrict the Oxidative Burst in Phagocytes and Facilitate Primary Progressive Tuberculosis IF: 17,452
    Autorzy:
    Scheuermann L., Pei G., Domaszewska T., Zyla J., Oberbeck-Müller D., Bandermann S., Feng Y., Ruiz Moreno J.S., Bastian B., Mollenkopf H., Kaufmann S., Dorhoi A.
    Czasopismo:
    AMERICAN JOURNAL OF RESPIRATORY AND CRITICAL CARE MEDICINE (rok: 2020, tom: 202, strony: 730-744), Wydawca: AMER THORACIC SOC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1164/rccm.201910-2063OC - link do publikacji
  14. Systemic modulation of stress and immune parameters in patients treated for prostate adenocarcinoma by intensity-modulated radiation therapy or stereotactic ablative body radiotherapy IF: 2,899
    Autorzy:
    Frey B., Mika J., Jelonek K., Cruz-Garcia L., Roelants C., Testard I., Cherradi N., Lumniczky K., Polozov S., Napieralska A., Widlak P., Gaipl U.S, Badie C., Polanska J., .Candéias S.M.
    Czasopismo:
    Strahlentherapie und Onkologie (rok: 2020, tom: 2020, strony: 44942), Wydawca: SPRINGER
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00066-020-01637-5 - link do publikacji
  15. Discrimination of normal oral mucosa from oral cancer by mass spectrometry imaging of proteins and lipids IF: 2,937
    Autorzy:
    Bednarczyk K, Gawin M., Chekan M., Kurczyk A., Mrukwa G., Monika Pietrowska M., Polanska J., Widlak P.
    Czasopismo:
    Journal of Molecular Histology (rok: 2019, tom: 50(1), strony: 44936), Wydawca: 2,937
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s10735-018-9802-3 - link do publikacji
  16. DiviK: Divisive intelligent K-means for hands-free unsupervised clustering in biological big data (publikacja złożona w czasopiśmie bmc bioinformatics)
    Autorzy:
    Mrukwa Grzegorz, Polanska Joanna
    Czasopismo:
    arXiv [q-bio.QM] (rok: 2020, tom: nd, strony: 2009,10706), Wydawca: arXiv.org
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    brak - link do publikacji
  17. Gene set enrichment for reproducible science: comparison of CERNO and eight other algorithms IF: 4,531
    Autorzy:
    Joanna Zyla J., Marczyk M., Domaszewska T., Kaufmann S., Polanska J., Weiner J.
    Czasopismo:
    Bioinformatics (rok: 2019, tom: 35(24), strony: 5146–5154), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bioinformatics/btz447 - link do publikacji
  18. Low-dose radiation accelerates aging of the T-cell receptor repertoire in CBA/Ca mice IF: 5,788
    Autorzy:
    Candeias S., Mika J., Finnon P., Verbiest T., Finnon R., Brown N., Bouffler S., Polanska J., Badie C.
    Czasopismo:
    Cellular and Molecular Life Sciences (rok: 2017, tom: 74, strony: 4339–4351), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00018-017-2581-2 - link do publikacji
  19. Molecular Profiling for Predictors of Radiosensitivity in Patients with Breast or Head-and-Neck Cancer IF: 6,126
    Autorzy:
    Drobin K., Marczyk M., Halle M., Danielsson D., Papiez A., Sangsuwan T., Bendes A., Hong M., Qundos U., Harms-Ringdahl M., Wersäll P., Polanska J., Schwenk J., Haghdoost S.
    Czasopismo:
    Cancers (rok: 2020, tom: 12, strony: 44944), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/cancers12030753 - link do publikacji
  20. BatchI: Batch effect Identication in high-throughput screening data using a dynamic programming algorithm IF: 5,481
    Autorzy:
    Papiez A., Polanska J., Marczyk M., Polanski A.
    Czasopismo:
    Bioinformatics (rok: 2019, tom: 35(11), strony: 1885-1892), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bioinformatics/bty900 - link do publikacji
  21. GaMRed – adaptive filtering of high-throughput biological data IF: 2,127
    Autorzy:
    Marczyk M., Jaksik R., Polanski A., Polanska J.
    Czasopismo:
    IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (rok: 2020, tom: 17, strony: 147-159), Wydawca: Institute of Electrical and Electronics Engineers
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1109/TCBB.2018.2858825 - link do publikacji
  22. Integrative multiomics study for validation of mechanisms in radiation-induced ischemic heart disease in Mayak workers IF: 2,766
    Autorzy:
    Papiez A., Azimzadeh O., Azizova T., Moseeva M., Anastasov M., Smida J., Tapio S., Polanska J.
    Czasopismo:
    PLoS ONE (rok: 2018, tom: 13(12), strony: e0209626), Wydawca: Public Library of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0209626 - link do publikacji
  23. Method for deisotoping based on fuzzy inference systems.
    Autorzy:
    Glodek A. Joanna Polańska J.
    Czasopismo:
    Mathematica Applicanda (rok: 2018, tom: 46, strony: 77–86), Wydawca: Polskie Towarzystwo Matematyczne
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.14708/ma.v46i1.6384 - link do publikacji
  24. Molecular Heterogeneity of Papillary Thyroid Cancer: Comparison of Primary Tumors and Synchronous Metastases in Regional Lymph Nodes by Mass Spectrometry Imaging IF: 3,366
    Autorzy:
    Gawin M., Kurczyk A., Stobiecka E., Frątczak K., Polańska J., Pietrowska M., Widłak P.
    Czasopismo:
    Endocrine Pathology (rok: 2019, tom: 30, strony: 250-261), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s12022-019-09593-2 - link do publikacji
  25. Molecular profiles of thyroid cancer subtypes: Classification based on features of tissue revealed by mass spectrometry imaging IF: 2,773
    Autorzy:
    Pietrowska M., Hanna Diehl H., Mrukwa G., Kalinowska-Herok M., Gawin M, Chekan M., Elm J., Drazek G., Krawczyk A., Lange D., Meyer H., Polanska J., Henkel C., Widlak P.
    Czasopismo:
    Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics (rok: 2017, tom: 1865, strony: 837-845), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.006 - link do publikacji
  26. Region-Specific Methylation Profiling in Acute Myeloid Leukemia IF: 0,753
    Autorzy:
    Cecotka A., Polańska J.
    Czasopismo:
    Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences (rok: 2018, tom: 10, strony: 33–42), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s12539-018-0285-4 - link do publikacji
  1. Biological diversity or numeric artifact? MSI data clustering robustness.
    Autorzy:
    Mrukwa G., Fratczak K., Gawin M., Chekan M., Pietrowska M., Widlak P., Polanska J.
    Konferencja:
    14th European Molecular Imaging Meeting EMIM 2019 (rok: 2019, ), Wydawca: ESMI–European Society for Molecular Imaging
    Data:
    konferencja 2019-03-19/22
    Status:
    Opublikowana
  2. Can the spatial distribution in MSI support the identification of the isotopic envelope? A.
    Autorzy:
    Glodek A., Gawin M., Chekan M., Pietrowska M., Łęski J., Polańska J.
    Konferencja:
    13th Central and Eastern European Proteomic Conference (rok: 2019, ), Wydawca: Maria Sklodowska-Curie Institute - Oncology Center
    Data:
    konferencja 2019-09-23/25
    Status:
    Opublikowana
  3. Detection of lymphocytes in stained whole tissue images by signal modelling approach
    Autorzy:
    Binczyk F., Marczyk M., Polanska J.
    Konferencja:
    Computational Approaches in Precision Medicine (rok: 2017, ), Wydawca: bd
    Data:
    konferencja 27-28.07.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  4. Machine Learning in the processing of proteomics data
    Autorzy:
    Polanska J.
    Konferencja:
    13th Central and Eastern European Proteomic Conference (rok: 2019, ), Wydawca: Maria Sklodowska-Curie Institute - Oncology Center
    Data:
    konferencja 2019-09-23/25
    Status:
    Opublikowana
  5. Proteomics validation analysis for ischemic heart disease in Mayak workers
    Autorzy:
    Papiez A., Azimzadeh O., Tapio S., Polanska J.
    Konferencja:
    13th Central and Eastern European Proteomic Conference (rok: 2019, ), Wydawca: Maria Sklodowska-Curie Institute - Oncology Center
    Data:
    konferencja 2019-09-23/25
    Status:
    Opublikowana
  6. Rough local reshaping for multimodal imagesco-registration using ellipsis' shape approximation
    Autorzy:
    Wolny M., Mrukwa G., Polańska J.
    Konferencja:
    21th Gliwice Scientific Meetings GSN 2017 (rok: 2017, ), Wydawca: Association for the Support of Cancer Research
    Data:
    konferencja 17-18.11.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  7. Can unsupervised clustering of the mass spectrometry imaging data serve as a nearly lossless compression method?
    Autorzy:
    Pendziałek P., Polanska J.
    Konferencja:
    21-st Polish Conference on Biocybernetics and Biomedical Engineering (rok: 2019, ), Wydawca: University of Zielona Góra
    Data:
    konferencja 2019-09-25/27
    Status:
    Opublikowana
  8. Detection of lymphocytes in stained whole tissue images by signal modelling approach
    Autorzy:
    Franciszek Bińczyk, Michał Marczyk, Joanna Polańska
    Konferencja:
    Computational Approaches in Precision Medicine (rok: 2017, ), Wydawca: BOKU University, Vienna
    Data:
    konferencja 27-28.07
    Status:
    Opublikowana
  9. Discrimination of normal oral mucosa from oral cancer by Mass Spectrometry Imaging of proteins and lipids
    Autorzy:
    Bednarczyk K, Gawin M., Chekan M., Kurczyk A., Mrukwa G., Monika Pietrowska M., Polanska J., Widlak P.
    Konferencja:
    22th Gliwice Scientific Meetings GSN 2018 (rok: 2018, ), Wydawca: Association for the Support of Cancer Research
    Data:
    konferencja 17-18.11.2018r.
    Status:
    Opublikowana
  10. Gaussian Mixture modelling in MSI-based search for molecularly homogenous regions in cancer tissue
    Autorzy:
    Polanska J., Mrukwa G., Drazek G., Krawczyk A., Chekan M., Pietrowska M., Widlak P.
    Konferencja:
    Imaging Mass Spectrometry Conference 2016 - OurCon IV (rok: 2016, ), Wydawca: MS Imaging
    Data:
    konferencja 17-21.10.2016
    Status:
    Opublikowana
  11. Genetic algorithm in training set selection for tumor segmentation problem
    Autorzy:
    Wilgierz W., Kuchta D., Mrukwa G., Chekan M., Widłak P., Pietrowska M., Polańska J.
    Konferencja:
    21th Gliwice Scientific Meetings GSN 2017 (rok: 2017, ), Wydawca: Association for the Support of Cancer Research
    Data:
    konferencja 17-18.11.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  12. Heterogeneity-based training set selection for classification in mass spectrometry imaging data
    Autorzy:
    Mrukwa G., Frątczak K., Pietrowska M., Gawin M., Widłak P., Polańska J.
    Konferencja:
    Imaging Mass Spectrometry Conference 2018 - OurConVI (rok: 2018, ), Wydawca: MS Imaging
    Data:
    konferencja 1-14.11.2018r.
    Status:
    Opublikowana
  13. How Does Sample Preparation In MALDI-MSI Imaging Influence The Molecular Signature
    Autorzy:
    Bednarczyk K., Sammour D., Hopf C., Polańska J.
    Konferencja:
    21th Gliwice Scientific Meetings GSN 2017 (rok: 2017, ), Wydawca: Association for the Support of Cancer Research
    Data:
    konferencja 17-18.11.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  14. Quantification of differences in brain tumor detection on multimodal MRI using deep neural network
    Autorzy:
    Leszczorz K., Dudzik W., Nalepa J., Polanska J.
    Konferencja:
    European Congress of Radiology 2020 (rok: 2020, ), Wydawca: uropean Society of Radiology (ESR)
    Data:
    konferencja 15-19.07.2020
    Status:
    Opublikowana
  15. The application of deep convolutional neural networksin the automated diagnosis of early alzheimer's diseaseon magnetic resonance images
    Autorzy:
    Suwalska A., Binczyk F.
    Konferencja:
    21th Gliwice Scientific Meetings GSN 2017 (rok: 2017, ), Wydawca: Association for the Support of Cancer Research
    Data:
    konferencja 17-18.11.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  16. Application of fully convolutional deep neural networks as an efficient technique for automated segmentation of gliomas
    Autorzy:
    Kocot S., Binczyk F.
    Konferencja:
    21th Gliwice Scientific Meetings GSN 2017 (rok: 2017, ), Wydawca: Association for the Support of Cancer Research
    Data:
    konferencja 17-18.11.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  17. Discrimination of normal oral mucosa from oral cancer by mass spectrometry imaging of proteins and lipids
    Autorzy:
    Gawin M., Bednarczyk K., Mykola Chekan M., Kurczyk A., Mrukwa G., Pietrowska M., Polanska J., Widlak P.
    Konferencja:
    Imaging Mass Spectrometry Conference 2018 - OurConVI (rok: 2018, ), Wydawca: MS Imaging
    Data:
    konferencja 1-14.11.2018r.
    Status:
    Opublikowana
  18. Hybrid Clustering Method for Highly Dimensional Data
    Autorzy:
    Mrukwa G., Frątczak K., Polańska J.
    Konferencja:
    12th Symposium of Polish Bioinformatics Society (rok: 2019, ), Wydawca: Polskie Towarzystwo Bioinformatyczne
    Data:
    konferencja 2019-09-19/21
    Status:
    Opublikowana
  19. Intra-tumor heterogeneity of thyroid cancer; comparison of primary tumor and its spread to regional lymph nodes by MALDI-MSI
    Autorzy:
    Gawin M., Ewa Stobiecka E., Bednarczyk K., Chekan M., Pietrowska M., Polańska J., Widlak P.
    Konferencja:
    Imaging Mass Spectrometry Conference 2017 - OurCon V (rok: 2017, ), Wydawca: MS Imaging
    Data:
    konferencja 25-28.09.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  20. Is there any similarity in gene expression profile in response to radiation therapy, independently of the cancer type?
    Autorzy:
    Cruz-Garcia L., Kamuda M., Badie C., Polanska J.
    Konferencja:
    23rd Nuclear Medical Defence Conference ConRad2019 (rok: 2019, ), Wydawca: University of Ulm
    Data:
    konferencja 2019-05-13/16
    Status:
    Opublikowana
  21. SPECTRE – a web service for efficient tumor molecular heterogeneity assessment in MALDI - MSI data
    Autorzy:
    Mrukwa G., Kuchta D., Pustelnik S., Wolny M., Babiak D., Gallus M., Wilgierz W., Gamrat M., Lisak R., Polańska J.
    Konferencja:
    21th Gliwice Scientific Meetings GSN 2017 (rok: 2017, ), Wydawca: Association for the Support of Cancer Research
    Data:
    konferencja 17-18.11.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  22. Spectre - an open source tool for comprehensive Mass Spectrometry Imaging data analysis
    Autorzy:
    Mrukwa G., Kuchta D., Babiak D., Pustelnik S., Gallus M., Gamrat M., Lisak R., Wolny M., Wilgierz W., Polańska J.
    Konferencja:
    13th European Molecular Imaging Meeting EMIM 2018 (rok: 2018, ), Wydawca: ESMI–European Society for Molecular Imaging
    Data:
    konferencja 20-23.03.2018r.
    Status:
    Opublikowana
  23. System klasyfikacji danych obrazowania molekularnego MALDI-MSI
    Autorzy:
    Paweł Pendziałek, Joanna Polańska
    Konferencja:
    Computational Oncology and Personalized Medicine COPM2021 Conference (rok: 2021, ), Wydawca: Politechnika Śląska
    Data:
    konferencja 21.04.2021r.
    Status:
    Opublikowana
  24. Adaptive training set selection for classification in mass spectrometry imaging data.
    Autorzy:
    Bednarczyk K., Mrukwa G., Polańska J.
    Konferencja:
    The 1st Summer School of the Malopolska Centre of Biotechnology (rok: 2018, ), Wydawca: Malopolska Centre of Biotechnology
    Data:
    konferencja 22-25.05.2018r.
    Status:
    Opublikowana
  25. Assessing feature transformations for clustering of MALDI-MSI data
    Autorzy:
    Mrukwa G., Sykacek P., Drążek G., Pietrowska M., Chekan M., Widłak P., Polańska J.
    Konferencja:
    Imaging Mass Spectrometry Conference 2016 - OurCon IV (rok: 2016, ), Wydawca: MS Imaging
    Data:
    konferencja 17-21.10.2016
    Status:
    Opublikowana
  26. Divisive iK-means algorithm as a tool for ROI selection in the search for MALDI-MSI based molecular signature of thyroid cancer
    Autorzy:
    Mrukwa G., Drazek G., Pietrowska M., Widlak P., Polanska J.
    Konferencja:
    Bio2016 Congress – Expanding beyond the limits" (rok: 2016, ), Wydawca: Acta Biochimica Polonica
    Data:
    konferencja 13-16.09.2016r.
    Status:
    Opublikowana
  27. Similarity and repeatability of molecular signatures for Pancancer MALDI-MSI data.
    Autorzy:
    Fratczak K. Polanska J.
    Konferencja:
    15th European Molecular Imaging Meeting EMIM 2020 (rok: 2020, ), Wydawca: ESMI–European Society for Molecular Imaging
    Data:
    konferencja 24-28.08.2020
    Status:
    Opublikowana
  28. Adaptive baseline correction algorithm for MALDI spectra
    Autorzy:
    Bednarczyk K., Gawin M., Pietrowska M., Widłak P., Polańska J.
    Konferencja:
    Imaging Mass Spectrometry Conference 2017 - OurCon V (rok: 2017, ), Wydawca: MS Imaging
    Data:
    konferencja 25-28.09.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  29. Analiza korekcji linii bazowej w widmach z obrazowania molekularnego MSI
    Autorzy:
    Bednarczyk K., Polańska J.
    Konferencja:
    IV Śląskie Spotkania Naukowe (rok: 2017, ), Wydawca: Association for the Support of Cancer Research
    Data:
    konferencja 24-25.03.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  30. Assesement of the low-dose dependence of the acute response to irradiation of murine hippocampal tissue
    Autorzy:
    Piecyk R., Hladik D., Polańska J., Tapio S.
    Konferencja:
    22th Gliwice Scientific Meetings GSN 2018 (rok: 2018, ), Wydawca: Association for the Support of Cancer Research
    Data:
    konferencja 17-18.11.2018r.
    Status:
    Opublikowana
  31. Automated detection of lymphocytes in whole slide histopathological images using MIMSEG2 approach
    Autorzy:
    Binczyk F., Marczyk M., Polanska J.
    Konferencja:
    21th Gliwice Scientific Meetings GSN 2017 (rok: 2017, ), Wydawca: Association for the Support of Cancer Research
    Data:
    konferencja 17-18.11.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  32. Can Deep Learning be a tool for feature engineering? Yes, it can. Lung tumor CT imaging case study
    Autorzy:
    Binczyk F., Polanska J.
    Konferencja:
    12th Symposium of Polish Bioinformatics Society (rok: 2019, ), Wydawca: Polskie Towarzystwo Bioinformatyczne
    Data:
    konferencja 2019-09-19/21
    Status:
    Opublikowana
  33. Comparative classification study for pan-cancer mass spectrometry imaging data
    Autorzy:
    Frątczak K., Gawin M., Chekan M., Pietrowska M., Widłak P., Polańska J.
    Konferencja:
    13th Central and Eastern European Proteomic Conference (rok: 2019, ), Wydawca: Maria Sklodowska-Curie Institute - Oncology Center
    Data:
    konferencja 2019-09-23/25
    Status:
    Opublikowana
  34. Investigation of molecular heterogeneity of head and neck cancer in MALDI-MSI preparations
    Autorzy:
    Mrukwa G., Pietrowska M., Widlak P., Polanska J.
    Konferencja:
    12th European Molecular Imaging Meeting EMIM 2017 (rok: 2017, ), Wydawca: ESMI–European Society for Molecular Imaging
    Data:
    konferencja 05-07.04.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  35. Pan Cancer analysis of similarities and differences in hormonal cancers and environmental cancers using MALDI-MSI
    Autorzy:
    Frątczak K., Gawin M., Pietrowska M., Chekan M., Widłak P., Polanska J.
    Konferencja:
    14th European Molecular Imaging Meeting EMIM 2019 (rok: 2019, ), Wydawca: ESMI–European Society for Molecular Imaging
    Data:
    konferencja 2019-03-19/22
    Status:
    Opublikowana
  1. Can an Integrative SNP Approach Substitute Standard Identification in Comprehensive Case/Control Analyses?
    Autorzy:
    Papiez A., Skrzypski M., Szymanowska-Narloch A., assem E., Maciejewska A., Pawlowski R., Dziadziuszko R., Jassem J., Rzyman W., Polanska J.
    Książka:
    Advances in Intelligent Systems and Computing. ISBN:978-3-319-98701-9 (rok: 2018, tom: 803, strony: 123-130), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
  2. Robustness of Pathway Enrichment Analysis to Transcriptome-Wide Gene Expression Platform
    Autorzy:
    Joanna Zyla J., Leszczorz K., Polanska J.
    Książka:
    Advances in Intelligent Systems and Computing. ISBN: 978-3-030-54568-0 (rok: 2020, tom: 1240, strony: 176-185), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
  3. Spatial Feature Selection For Finding Biomarkers Using Imaging Mass Spectrometry Data
    Autorzy:
    Marczyk M., Smejkal T.
    Książka:
    Proceedings of the Twenty Third National Conference on APPLICATIONS OF MATHEMATICS IN BIOLOGY AND MEDICINE. ISBN: 978-83-932893-3-2 (rok: 2017, tom: 23, strony: 123-129), Wydawca: Politechnika Śląska
    Status:
    Opublikowana
  4. Reproducibility of Finding Enriched Gene Sets in Biological Data Analysis.
    Autorzy:
    Zyla J., Marczyk M., Polanska J.
    Książka:
    Advances in Intelligent Systems and Computing. ISBN:978-3-319-60815-0 (rok: 2017, tom: 616, strony: 146-154), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
  5. Breast Cancer Heterogeneity Investigation: Multiple k-Means Clustering Approach
    Autorzy:
    Tobiasz J., Hatzis C., Polanska J.
    Książka:
    2019 IEEE 19th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE). ISBN: 978-1-7281-4617-1 (rok: 2019, tom: nd, strony: 410-414), Wydawca: Institute of Electrical and Electronics Engineers
    Status:
    Opublikowana
  6. Improving Peak Detection by Gaussian Mixture Modeling of Mass Spectral Signal
    Autorzy:
    Marczyk M., Polanski A., Polanska J.
    Książka:
    2017 3rd International Conference on Frontiers of Signal Processing ICFSP 2017. ISBN: 978-1-5386-1037-4 (rok: 2017, tom: nd, strony: 39-43), Wydawca: Institute of Electrical and Electronics Engineers
    Status:
    Opublikowana
  7. Mathematical modelling and effect size analysis in support of searching for the proteomic signature of radiotherapy toxicity
    Autorzy:
    Leszczorz K., Azimzadeh O., Tapio S., Atkinson M., Polańska J.
    Książka:
    2019 IEEE 19th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE). ISBN: 978-1-7281-4617-1 (rok: 2019, tom: nd, strony: 244-249), Wydawca: Institute of Electrical and Electronics Engineers
    Status:
    Opublikowana

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy