Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Narzędzia bioinformatyczne do automatycznej identyfikacji obszarów guza i jego heterogeniczności na bazie profili metabolomicznych pozyskiwanych spektrometrycznymi technikami obrazowania molekularnego

2015/19/B/ST6/01736

Słowa kluczowe:

bioinformatyka MALDI-IMS analiza widm masowych modelowanie matematyczne sztuczna inteligencja statystyka stosowana nowotwory

Deskryptory:

  • ST6_11: Uczenie maszynowe, statystyczne przetwarzanie danych i zastosowanie w przetwarzaniu sygnałów
  • ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
  • NZ2_4: Metabolomika

Panel:

ST6 - Informatyka i technologie informacyjne: technologie i systemy informacyjne, informatyka, obliczenia naukowe, systemy inteligentne

Jednostka realizująca:

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

woj. śląskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Joanna Polańska 

Liczba wykonawców projektu: 7

Konkurs: OPUS 10 - ogłoszony 2015-09-15

Przyznana kwota: 850 640 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2016-06-28

Zakończenie projektu: 2020-06-27

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. wysokorozdzielczy monitor.
  2. Matlab licencja.
  3. TeamViewer licencja (2 szt.). Za kwotę 20 000 PLN
  4. Ingenuity Pathway Analysis licencja. Za kwotę 40 000 PLN
  5. profesjonalny komputer przenośny (2 szt.). Za kwotę 20 000 PLN
  6. Serwer dyskowy NAS. Za kwotę 11 890 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (26)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (35)
  • Publikacje książkowe (7)
  1. Identification of two novel mutations in human acute myeloid leukemia cases IF: 3,28
    Autorzy:
    O'Brien, G., Zyla, J., Manola, K., Pagoni, M., Polanska, J., Badie, C.
    Czasopismo:
    Leukemia and Lymphoma (rok: 2021, tom: 62 (2), strony: 454-461), Wydawca: Taylor & Francis Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1080/10428194.2020.1832664 - link do publikacji
  2. Low-dose radiation accelerates aging of the T-cell receptor repertoire in CBA/Ca mice IF: 5,788
    Autorzy:
    Candeias S., Mika J., Finnon P., Verbiest T., Finnon R., Brown N., Bouffler S., Polanska J., Badie C.
    Czasopismo:
    Cellular and Molecular Life Sciences (rok: 2017, tom: 74, strony: 4339–4351), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00018-017-2581-2 - link do publikacji
  3. Method for deisotoping based on fuzzy inference systems.
    Autorzy:
    Glodek A. Joanna Polańska J.
    Czasopismo:
    Mathematica Applicanda (rok: 2018, tom: 46, strony: 77–86), Wydawca: Polskie Towarzystwo Matematyczne
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.14708/ma.v46i1.6384 - link do publikacji
  4. Molecular profiles of thyroid cancer subtypes: Classification based on features of tissue revealed by mass spectrometry imaging IF: 2,773
    Autorzy:
    Pietrowska M., Hanna Diehl H., Mrukwa G., Kalinowska-Herok M., Gawin M, Chekan M., Elm J., Drazek G., Krawczyk A., Lange D., Meyer H., Polanska J., Henkel C., Widlak P.
    Czasopismo:
    Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics (rok: 2017, tom: 1865, strony: 837-845), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
  5. Proteomic profile of melanoma cell-derived sEV in patients' plasma: a potential correlate of melanoma progression IF: 14,976
    Autorzy:
    Pietrowska M., Zebrowska A., Gawin M., Marczak L., Sharma P., Mondal S., Mika J., Polańska J., Ferrone S., Kirkwood J. M., Widlak P., Whiteside T. L.
    Czasopismo:
    Journal of Extracellular Vesicles (rok: 2020, tom: 10, strony: 44575), Wydawca: Wiley Periodicals, LLC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/jev2.12063 - link do publikacji
  6. Broadside: Distributed high-dimensional feature selection and interaction mining for classification, regression and survival analysis. IF: 5,61
    Autorzy:
    Krol L., Tarnawski R., Polanska J.
    Czasopismo:
    Bioinformatics (rok: 2018, tom: bd, strony: bd), Wydawca: OXFORD UNIV PRESS
    Status:
    Złożona
  7. Discrimination of normal oral mucosa from oral cancer by mass spectrometry imaging of proteins and lipids IF: 2,937
    Autorzy:
    Bednarczyk K, Gawin M., Chekan M., Kurczyk A., Mrukwa G., Monika Pietrowska M., Polanska J., Widlak P.
    Czasopismo:
    Journal of Molecular Histology (rok: 2019, tom: 50(1), strony: 44571), Wydawca: 2,937
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s10735-018-9802-3 - link do publikacji
  8. DiviK: Divisive intelligent K-means for hands-free unsupervised clustering in biological big data (publikacja złożona w czasopiśmie bmc bioinformatics)
    Autorzy:
    Mrukwa Grzegorz, Polanska Joanna
    Czasopismo:
    arXiv [q-bio.QM] (rok: 2020, tom: nd, strony: 2009,10706), Wydawca: arXiv.org
    Status:
    Opublikowana
  9. Machine learning techniques combined with dose profiles indicate radiation response biomarkers IF: 1,504
    Autorzy:
    Papież A., Badie C., Polańska J.
    Czasopismo:
    International Journal of Applied Mathematics and Computer Science (rok: 2019, tom: 29(1), strony: 169-178), Wydawca: University of Zielona Góra
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.2478/amcs-2019-0013 - link do publikacji
  10. Molecular Heterogeneity of Papillary Thyroid Cancer: Comparison of Primary Tumors and Synchronous Metastases in Regional Lymph Nodes by Mass Spectrometry Imaging IF: 3,366
    Autorzy:
    Gawin M., Kurczyk A., Stobiecka E., Frątczak K., Polańska J., Pietrowska M., Widłak P.
    Czasopismo:
    Endocrine Pathology (rok: 2019, tom: 30, strony: 250-261), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s12022-019-09593-2 - link do publikacji
  11. GaMRed – adaptive filtering of high-throughput biological data IF: 2,127
    Autorzy:
    Marczyk M., Jaksik R., Polanski A., Polanska J.
    Czasopismo:
    IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (rok: 2020, tom: 17, strony: 147-159), Wydawca: Institute of Electrical and Electronics Engineers
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1109/TCBB.2018.2858825 - link do publikacji
  12. Gene set enrichment for reproducible science: comparison of CERNO and eight other algorithms IF: 4,531
    Autorzy:
    Joanna Zyla J., Marczyk M., Domaszewska T., Kaufmann S., Polanska J., Weiner J.
    Czasopismo:
    Bioinformatics (rok: 2019, tom: 35(24), strony: 5146–5154), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bioinformatics/btz447 - link do publikacji
  13. Initializing the EM Algorithm for Univariate Gaussian, Multi-Component, Heteroscedastic Mixture Models by Dynamic Programming Partitions IF: 1,053
    Autorzy:
    Polanski A., Marczyk M., Pietrowska M., Widlak P., Polanska J.
    Czasopismo:
    International Journal of Computational Methods (rok: 2018, tom: 15, strony: 1850012-1 - 1850012-21), Wydawca: World Scientific
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1142/S0219876218500123 - link do publikacji
  14. Ionizing radiation affects the composition of the proteome of extracellular vesicles released by head-and-neck cancer cells in vitro IF: 2,014
    Autorzy:
    Abramowicz A., Wojakowska A., Marczak Ł., Lysek-Gladysinska M., Smolarz M., Story M.D., Polańska J., Widlak P., Pietrowska M.
    Czasopismo:
    Journal of Radiation Research (rok: 2019, tom: 60(3), strony: 289-297), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/jrr/rrz001 - link do publikacji
  15. Systemic Effects of Radiotherapy and Concurrent Chemo-Radiotherapy in Head and Neck Cancer Patients—Comparison of Serum Metabolome Profiles IF: 4,097
    Autorzy:
    Jelonek K., Krzywon A., Jablonska P., Slominska E.M., Smolenski R.T., Polanska J., Rutkowski T., Mrochem-Kwarciak J., Skladowski K., Widlak P.
    Czasopismo:
    Metabolites (rok: 2020, tom: 10(60), strony: 44576), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/metabo10020060 - link do publikacji
  16. Discrimination of papillary thyroid cancer from non-cancerous thyroid tissue based on lipid profiling by mass spectrometry imaging IF: 1,059
    Autorzy:
    Wojakowska A., Cole L., Chekan M., Bednarczyk K., Maksymiak M., Oczko-Wojciechowska M., Jarząb B., Clench M., Polańska J., Pietrowska M., Widlak P.
    Czasopismo:
    Endokrynologia Polska (rok: 2018, tom: 69, strony: 44600), Wydawca: Via Medica
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.5603/EP.a2018.0003 - link do publikacji
  17. Integrative multiomics study for validation of mechanisms in radiation-induced ischemic heart disease in Mayak workers IF: 2,766
    Autorzy:
    Papiez A., Azimzadeh O., Azizova T., Moseeva M., Anastasov M., Smida J., Tapio S., Polanska J.
    Czasopismo:
    PLoS ONE (rok: 2018, tom: 13(12), strony: e0209626), Wydawca: Public Library of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0209626 - link do publikacji
  18. Molecular Profiling for Predictors of Radiosensitivity in Patients with Breast or Head-and-Neck Cancer IF: 6,126
    Autorzy:
    Drobin K., Marczyk M., Halle M., Danielsson D., Papiez A., Sangsuwan T., Bendes A., Hong M., Qundos U., Harms-Ringdahl M., Wersäll P., Polanska J., Schwenk J., Haghdoost S.
    Czasopismo:
    Cancers (rok: 2020, tom: 12, strony: 44579), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/cancers12030753 - link do publikacji
  19. Platelets Restrict the Oxidative Burst in Phagocytes and Facilitate Primary Progressive Tuberculosis IF: 17,452
    Autorzy:
    Scheuermann L., Pei G., Domaszewska T., Zyla J., Oberbeck-Müller D., Bandermann S., Feng Y., Ruiz Moreno J.S., Bastian B., Mollenkopf H., Kaufmann S., Dorhoi A.
    Czasopismo:
    AMERICAN JOURNAL OF RESPIRATORY AND CRITICAL CARE MEDICINE (rok: 2020, tom: 202, strony: 730-744), Wydawca: AMER THORACIC SOC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1164/rccm.201910-2063OC - link do publikacji
  20. BatchI: Batch effect Identication in high-throughput screening data using a dynamic programming algorithm IF: 5,481
    Autorzy:
    Papiez A., Polanska J., Marczyk M., Polanski A.
    Czasopismo:
    Bioinformatics (rok: 2019, tom: 35(11), strony: 1885-1892), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bioinformatics/bty900 - link do publikacji
  21. Germline DNA Retention in Murine and Human Rearranged T Cell Receptor Gene Coding Joints: Alternative Recombination Signal Sequences and V(D)J Recombinase Errors IF: 4,716
    Autorzy:
    Mika J., Kabacik S., Badie C., Polanska J., Candéias S.
    Czasopismo:
    Frontiers in Immunology (rok: 2019, tom: 2,24791666666667, strony: 44576), Wydawca: Front. Immunol.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fimmu.2019.02637 - link do publikacji
  22. Kras mutations and PU.1 promoter methylation are new pathways in murine radiation-induced AML IF: 4,603
    Autorzy:
    O'Brien G., Cruz-Garcia L., Zyla J., , Brown N., Finnon R., Polanska J., Badie C.
    Czasopismo:
    Carcinogenesis (rok: 2020, tom: 41(8), strony: 1104–1112), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/carcin/bgz175 - link do publikacji
  23. MiMSeg - an algorithm for automated detection of tumor tissue on NMR apparent diffusion coefficient maps IF: 4,832
    Autorzy:
    Binczyk F., Bram S., Weber C., Goetz M., Maier-Hein K., Meinzer H., Bobek-Billewicz B., Tarnawski R., Polanska J.
    Czasopismo:
    Information Sciences (rok: 2017, tom: 384, strony: 235–248), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.ins.2016.07.052 - link do publikacji
  24. Region-Specific Methylation Profiling in Acute Myeloid Leukemia IF: 0,753
    Autorzy:
    Cecotka A., Polańska J.
    Czasopismo:
    Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences (rok: 2018, tom: 10, strony: 33–42), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s12539-018-0285-4 - link do publikacji
  25. Systemic modulation of stress and immune parameters in patients treated for prostate adenocarcinoma by intensity-modulated radiation therapy or stereotactic ablative body radiotherapy IF: 2,899
    Autorzy:
    Frey B., Mika J., Jelonek K., Cruz-Garcia L., Roelants C., Testard I., Cherradi N., Lumniczky K., Polozov S., Napieralska A., Widlak P., Gaipl U.S, Badie C., Polanska J., .Candéias S.M.
    Czasopismo:
    Strahlentherapie und Onkologie (rok: 2020, tom: 2020, strony: 44577), Wydawca: SPRINGER
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00066-020-01637-5 - link do publikacji
  26. A new approach to isotopic envelope identification by analysis of spatial distribution of components in Mass Spectrometry Imaging IF: 3,756
    Autorzy:
    Glodek A., Joanna Polańska J., Marta Gawin M.
    Czasopismo:
    PROTEINS: Structure, Function, and Bioinformatics (rok: 2021, tom: bd, strony: bd), Wydawca: Wiley Periodicals LLC
    Status:
    Złożona
  1. Biological diversity or numeric artifact? MSI data clustering robustness.
    Autorzy:
    Mrukwa G., Fratczak K., Gawin M., Chekan M., Pietrowska M., Widlak P., Polanska J.
    Konferencja:
    14th European Molecular Imaging Meeting EMIM 2019 (rok: 2019, ), Wydawca: ESMI–European Society for Molecular Imaging
    Data:
    konferencja 2019-03-19/22
    Status:
    Opublikowana
  2. Can unsupervised clustering of the mass spectrometry imaging data serve as a nearly lossless compression method?
    Autorzy:
    Pendziałek P., Polanska J.
    Konferencja:
    21-st Polish Conference on Biocybernetics and Biomedical Engineering (rok: 2019, ), Wydawca: University of Zielona Góra
    Data:
    konferencja 2019-09-25/27
    Status:
    Opublikowana
  3. How Does Sample Preparation In MALDI-MSI Imaging Influence The Molecular Signature
    Autorzy:
    Bednarczyk K., Sammour D., Hopf C., Polańska J.
    Konferencja:
    21th Gliwice Scientific Meetings GSN 2017 (rok: 2017, ), Wydawca: Association for the Support of Cancer Research
    Data:
    konferencja 17-18.11.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  4. Rough local reshaping for multimodal imagesco-registration using ellipsis' shape approximation
    Autorzy:
    Wolny M., Mrukwa G., Polańska J.
    Konferencja:
    21th Gliwice Scientific Meetings GSN 2017 (rok: 2017, ), Wydawca: Association for the Support of Cancer Research
    Data:
    konferencja 17-18.11.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  5. Similarity and repeatability of molecular signatures for Pancancer MALDI-MSI data.
    Autorzy:
    Fratczak K. Polanska J.
    Konferencja:
    15th European Molecular Imaging Meeting EMIM 2020 (rok: 2020, ), Wydawca: ESMI–European Society for Molecular Imaging
    Data:
    konferencja 24-28.08.2020
    Status:
    Opublikowana
  6. Assessing feature transformations for clustering of MALDI-MSI data
    Autorzy:
    Mrukwa G., Sykacek P., Drążek G., Pietrowska M., Chekan M., Widłak P., Polańska J.
    Konferencja:
    Imaging Mass Spectrometry Conference 2016 - OurCon IV (rok: 2016, ), Wydawca: MS Imaging
    Data:
    konferencja 17-21.10.2016
    Status:
    Opublikowana
  7. Detection of lymphocytes in stained whole tissue images by signal modelling approach
    Autorzy:
    Binczyk F., Marczyk M., Polanska J.
    Konferencja:
    Computational Approaches in Precision Medicine (rok: 2017, ), Wydawca: bd
    Data:
    konferencja 27-28.07.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  8. Detection of lymphocytes in stained whole tissue images by signal modelling approach
    Autorzy:
    Franciszek Bińczyk, Michał Marczyk, Joanna Polańska
    Konferencja:
    Computational Approaches in Precision Medicine (rok: 2017, ), Wydawca: BOKU University, Vienna
    Data:
    konferencja 27-28.07
    Status:
    Opublikowana
  9. Discrimination of normal oral mucosa from oral cancer by Mass Spectrometry Imaging of proteins and lipids
    Autorzy:
    Bednarczyk K, Gawin M., Chekan M., Kurczyk A., Mrukwa G., Monika Pietrowska M., Polanska J., Widlak P.
    Konferencja:
    22th Gliwice Scientific Meetings GSN 2018 (rok: 2018, ), Wydawca: Association for the Support of Cancer Research
    Data:
    konferencja 17-18.11.2018r.
    Status:
    Opublikowana
  10. Discrimination of normal oral mucosa from oral cancer by mass spectrometry imaging of proteins and lipids
    Autorzy:
    Gawin M., Bednarczyk K., Mykola Chekan M., Kurczyk A., Mrukwa G., Pietrowska M., Polanska J., Widlak P.
    Konferencja:
    Imaging Mass Spectrometry Conference 2018 - OurConVI (rok: 2018, ), Wydawca: MS Imaging
    Data:
    konferencja 1-14.11.2018r.
    Status:
    Opublikowana
  11. Intra-tumor heterogeneity of thyroid cancer; comparison of primary tumor and its spread to regional lymph nodes by MALDI-MSI
    Autorzy:
    Gawin M., Ewa Stobiecka E., Bednarczyk K., Chekan M., Pietrowska M., Polańska J., Widlak P.
    Konferencja:
    Imaging Mass Spectrometry Conference 2017 - OurCon V (rok: 2017, ), Wydawca: MS Imaging
    Data:
    konferencja 25-28.09.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  12. Pan Cancer analysis of similarities and differences in hormonal cancers and environmental cancers using MALDI-MSI
    Autorzy:
    Frątczak K., Gawin M., Pietrowska M., Chekan M., Widłak P., Polanska J.
    Konferencja:
    14th European Molecular Imaging Meeting EMIM 2019 (rok: 2019, ), Wydawca: ESMI–European Society for Molecular Imaging
    Data:
    konferencja 2019-03-19/22
    Status:
    Opublikowana
  13. System klasyfikacji danych obrazowania molekularnego MALDI-MSI
    Autorzy:
    Paweł Pendziałek, Joanna Polańska
    Konferencja:
    Computational Oncology and Personalized Medicine COPM2021 Conference (rok: 2021, ), Wydawca: Politechnika Śląska
    Data:
    konferencja 21.04.2021r.
    Status:
    Opublikowana
  14. Adaptive baseline correction algorithm for MALDI spectra
    Autorzy:
    Bednarczyk K., Gawin M., Pietrowska M., Widłak P., Polańska J.
    Konferencja:
    Imaging Mass Spectrometry Conference 2017 - OurCon V (rok: 2017, ), Wydawca: MS Imaging
    Data:
    konferencja 25-28.09.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  15. Adaptive training set selection for classification in mass spectrometry imaging data.
    Autorzy:
    Bednarczyk K., Mrukwa G., Polańska J.
    Konferencja:
    The 1st Summer School of the Malopolska Centre of Biotechnology (rok: 2018, ), Wydawca: Malopolska Centre of Biotechnology
    Data:
    konferencja 22-25.05.2018r.
    Status:
    Opublikowana
  16. Genetic algorithm in training set selection for tumor segmentation problem
    Autorzy:
    Wilgierz W., Kuchta D., Mrukwa G., Chekan M., Widłak P., Pietrowska M., Polańska J.
    Konferencja:
    21th Gliwice Scientific Meetings GSN 2017 (rok: 2017, ), Wydawca: Association for the Support of Cancer Research
    Data:
    konferencja 17-18.11.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  17. Automated detection of lymphocytes in whole slide histopathological images using MIMSEG2 approach
    Autorzy:
    Binczyk F., Marczyk M., Polanska J.
    Konferencja:
    21th Gliwice Scientific Meetings GSN 2017 (rok: 2017, ), Wydawca: Association for the Support of Cancer Research
    Data:
    konferencja 17-18.11.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  18. Can Deep Learning be a tool for feature engineering? Yes, it can. Lung tumor CT imaging case study
    Autorzy:
    Binczyk F., Polanska J.
    Konferencja:
    12th Symposium of Polish Bioinformatics Society (rok: 2019, ), Wydawca: Polskie Towarzystwo Bioinformatyczne
    Data:
    konferencja 2019-09-19/21
    Status:
    Opublikowana
  19. Divisive iK-means algorithm as a tool for ROI selection in the search for MALDI-MSI based molecular signature of thyroid cancer
    Autorzy:
    Mrukwa G., Drazek G., Pietrowska M., Widlak P., Polanska J.
    Konferencja:
    Bio2016 Congress – Expanding beyond the limits" (rok: 2016, ), Wydawca: Acta Biochimica Polonica
    Data:
    konferencja 13-16.09.2016r.
    Status:
    Opublikowana
  20. Heterogeneity-based training set selection for classification in mass spectrometry imaging data
    Autorzy:
    Mrukwa G., Frątczak K., Pietrowska M., Gawin M., Widłak P., Polańska J.
    Konferencja:
    Imaging Mass Spectrometry Conference 2018 - OurConVI (rok: 2018, ), Wydawca: MS Imaging
    Data:
    konferencja 1-14.11.2018r.
    Status:
    Opublikowana
  21. Hybrid Clustering Method for Highly Dimensional Data
    Autorzy:
    Mrukwa G., Frątczak K., Polańska J.
    Konferencja:
    12th Symposium of Polish Bioinformatics Society (rok: 2019, ), Wydawca: Polskie Towarzystwo Bioinformatyczne
    Data:
    konferencja 2019-09-19/21
    Status:
    Opublikowana
  22. Machine Learning in the processing of proteomics data
    Autorzy:
    Polanska J.
    Konferencja:
    13th Central and Eastern European Proteomic Conference (rok: 2019, ), Wydawca: Maria Sklodowska-Curie Institute - Oncology Center
    Data:
    konferencja 2019-09-23/25
    Status:
    Opublikowana
  23. The application of deep convolutional neural networksin the automated diagnosis of early alzheimer's diseaseon magnetic resonance images
    Autorzy:
    Suwalska A., Binczyk F.
    Konferencja:
    21th Gliwice Scientific Meetings GSN 2017 (rok: 2017, ), Wydawca: Association for the Support of Cancer Research
    Data:
    konferencja 17-18.11.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  24. Analiza korekcji linii bazowej w widmach z obrazowania molekularnego MSI
    Autorzy:
    Bednarczyk K., Polańska J.
    Konferencja:
    IV Śląskie Spotkania Naukowe (rok: 2017, ), Wydawca: Association for the Support of Cancer Research
    Data:
    konferencja 24-25.03.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  25. Application of fully convolutional deep neural networks as an efficient technique for automated segmentation of gliomas
    Autorzy:
    Kocot S., Binczyk F.
    Konferencja:
    21th Gliwice Scientific Meetings GSN 2017 (rok: 2017, ), Wydawca: Association for the Support of Cancer Research
    Data:
    konferencja 17-18.11.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  26. Assesement of the low-dose dependence of the acute response to irradiation of murine hippocampal tissue
    Autorzy:
    Piecyk R., Hladik D., Polańska J., Tapio S.
    Konferencja:
    22th Gliwice Scientific Meetings GSN 2018 (rok: 2018, ), Wydawca: Association for the Support of Cancer Research
    Data:
    konferencja 17-18.11.2018r.
    Status:
    Opublikowana
  27. Can the spatial distribution in MSI support the identification of the isotopic envelope? A.
    Autorzy:
    Glodek A., Gawin M., Chekan M., Pietrowska M., Łęski J., Polańska J.
    Konferencja:
    13th Central and Eastern European Proteomic Conference (rok: 2019, ), Wydawca: Maria Sklodowska-Curie Institute - Oncology Center
    Data:
    konferencja 2019-09-23/25
    Status:
    Opublikowana
  28. Comparative classification study for pan-cancer mass spectrometry imaging data
    Autorzy:
    Frątczak K., Gawin M., Chekan M., Pietrowska M., Widłak P., Polańska J.
    Konferencja:
    13th Central and Eastern European Proteomic Conference (rok: 2019, ), Wydawca: Maria Sklodowska-Curie Institute - Oncology Center
    Data:
    konferencja 2019-09-23/25
    Status:
    Opublikowana
  29. Gaussian Mixture modelling in MSI-based search for molecularly homogenous regions in cancer tissue
    Autorzy:
    Polanska J., Mrukwa G., Drazek G., Krawczyk A., Chekan M., Pietrowska M., Widlak P.
    Konferencja:
    Imaging Mass Spectrometry Conference 2016 - OurCon IV (rok: 2016, ), Wydawca: MS Imaging
    Data:
    konferencja 17-21.10.2016
    Status:
    Opublikowana
  30. Investigation of molecular heterogeneity of head and neck cancer in MALDI-MSI preparations
    Autorzy:
    Mrukwa G., Pietrowska M., Widlak P., Polanska J.
    Konferencja:
    12th European Molecular Imaging Meeting EMIM 2017 (rok: 2017, ), Wydawca: ESMI–European Society for Molecular Imaging
    Data:
    konferencja 05-07.04.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  31. Is there any similarity in gene expression profile in response to radiation therapy, independently of the cancer type?
    Autorzy:
    Cruz-Garcia L., Kamuda M., Badie C., Polanska J.
    Konferencja:
    23rd Nuclear Medical Defence Conference ConRad2019 (rok: 2019, ), Wydawca: University of Ulm
    Data:
    konferencja 2019-05-13/16
    Status:
    Opublikowana
  32. Proteomics validation analysis for ischemic heart disease in Mayak workers
    Autorzy:
    Papiez A., Azimzadeh O., Tapio S., Polanska J.
    Konferencja:
    13th Central and Eastern European Proteomic Conference (rok: 2019, ), Wydawca: Maria Sklodowska-Curie Institute - Oncology Center
    Data:
    konferencja 2019-09-23/25
    Status:
    Opublikowana
  33. Quantification of differences in brain tumor detection on multimodal MRI using deep neural network
    Autorzy:
    Leszczorz K., Dudzik W., Nalepa J., Polanska J.
    Konferencja:
    European Congress of Radiology 2020 (rok: 2020, ), Wydawca: uropean Society of Radiology (ESR)
    Data:
    konferencja 15-19.07.2020
    Status:
    Opublikowana
  34. SPECTRE – a web service for efficient tumor molecular heterogeneity assessment in MALDI - MSI data
    Autorzy:
    Mrukwa G., Kuchta D., Pustelnik S., Wolny M., Babiak D., Gallus M., Wilgierz W., Gamrat M., Lisak R., Polańska J.
    Konferencja:
    21th Gliwice Scientific Meetings GSN 2017 (rok: 2017, ), Wydawca: Association for the Support of Cancer Research
    Data:
    konferencja 17-18.11.2017r.
    Status:
    Opublikowana
  35. Spectre - an open source tool for comprehensive Mass Spectrometry Imaging data analysis
    Autorzy:
    Mrukwa G., Kuchta D., Babiak D., Pustelnik S., Gallus M., Gamrat M., Lisak R., Wolny M., Wilgierz W., Polańska J.
    Konferencja:
    13th European Molecular Imaging Meeting EMIM 2018 (rok: 2018, ), Wydawca: ESMI–European Society for Molecular Imaging
    Data:
    konferencja 20-23.03.2018r.
    Status:
    Opublikowana
  1. Reproducibility of Finding Enriched Gene Sets in Biological Data Analysis.
    Autorzy:
    Zyla J., Marczyk M., Polanska J.
    Książka:
    Advances in Intelligent Systems and Computing. ISBN:978-3-319-60815-0 (rok: 2017, tom: 616, strony: 146-154), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
  2. Spatial Feature Selection For Finding Biomarkers Using Imaging Mass Spectrometry Data
    Autorzy:
    Marczyk M., Smejkal T.
    Książka:
    Proceedings of the Twenty Third National Conference on APPLICATIONS OF MATHEMATICS IN BIOLOGY AND MEDICINE. ISBN: 978-83-932893-3-2 (rok: 2017, tom: 23, strony: 123-129), Wydawca: Politechnika Śląska
    Status:
    Opublikowana
  3. Improving Peak Detection by Gaussian Mixture Modeling of Mass Spectral Signal
    Autorzy:
    Marczyk M., Polanski A., Polanska J.
    Książka:
    2017 3rd International Conference on Frontiers of Signal Processing ICFSP 2017. ISBN: 978-1-5386-1037-4 (rok: 2017, tom: nd, strony: 39-43), Wydawca: Institute of Electrical and Electronics Engineers
    Status:
    Opublikowana
  4. Mathematical modelling and effect size analysis in support of searching for the proteomic signature of radiotherapy toxicity
    Autorzy:
    Leszczorz K., Azimzadeh O., Tapio S., Atkinson M., Polańska J.
    Książka:
    2019 IEEE 19th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE). ISBN: 978-1-7281-4617-1 (rok: 2019, tom: nd, strony: 244-249), Wydawca: Institute of Electrical and Electronics Engineers
    Status:
    Opublikowana
  5. Can an Integrative SNP Approach Substitute Standard Identification in Comprehensive Case/Control Analyses?
    Autorzy:
    Papiez A., Skrzypski M., Szymanowska-Narloch A., assem E., Maciejewska A., Pawlowski R., Dziadziuszko R., Jassem J., Rzyman W., Polanska J.
    Książka:
    Advances in Intelligent Systems and Computing. ISBN:978-3-319-98701-9 (rok: 2018, tom: 803, strony: 123-130), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
  6. Breast Cancer Heterogeneity Investigation: Multiple k-Means Clustering Approach
    Autorzy:
    Tobiasz J., Hatzis C., Polanska J.
    Książka:
    2019 IEEE 19th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE). ISBN: 978-1-7281-4617-1 (rok: 2019, tom: nd, strony: 410-414), Wydawca: Institute of Electrical and Electronics Engineers
    Status:
    Opublikowana
  7. Robustness of Pathway Enrichment Analysis to Transcriptome-Wide Gene Expression Platform
    Autorzy:
    Joanna Zyla J., Leszczorz K., Polanska J.
    Książka:
    Advances in Intelligent Systems and Computing. ISBN: 978-3-030-54568-0 (rok: 2020, tom: 1240, strony: 176-185), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana