Wyjaśnienie mechanizmu i znaczenia zmian przestrzennej organizacji chromatyny zachodzących w skutek pobudzenia komórki nerwowej.
2015/18/E/NZ3/00730
Słowa kluczowe
Deskryptory
- NZ3_5: Neurobiologia molekularna
Panel
NZ3 – Biologia na poziomie komórki: biologia komórkowa, biologia rozwoju i starzenia, neurobiologia
Jednostka realizująca
Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN
woj. mazowieckie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 4
Konkurs
SONATA BIS 5 – ogłoszony 2015-06-15
- Przyznana kwota
- 1 949 350 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2016-04-11
- Zakończenie projektu
- 2022-04-10
- Planowany czas trwania projektu
- 72 miesiące (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Opis projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga — opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- Blok Grzejny z wytrząsaniem (2 szt.). Za kwotę 10 000 PLN
- Iinkubator do hodowli komórkowych z kontrolowanym dostępem CO2/O2. Za kwotę 60 000 PLN
- Komputery przenośne z oprogramowaniem dla członków zespołu. (3 szt.). Za kwotę 12 000 PLN
- Monitor 27 cali o wysokiej rodzielczości.
- Stacja robocza z oprogramowaniem, monitorem i przyrządowaniem. Za kwotę 16 000 PLN
- Termomikser z wytrząsarką do płytek (2 szt.). Za kwotę 10 000 PLN
- UV Spektrofotometr Nanodrop 2000c z komputerem przenośnym do obsługi. Za kwotę 40 000 PLN
- Wirówka laboratoryjna (2 szt.). Za kwotę 10 000 PLN
- Wytrząsarka kołyskowa. Za kwotę 6 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (6)
-
Nowoczesne techniki mikroskopowe w badaniach nad trójwymiarową strukturą chromatyny
- Autorzy:
- Paweł Trzaskoma, Adriana Magalska
- Czasopismo:
- KOSMOS (rok: 2019, tom: 68/1, strony: 19-33), Wydawca: POLSKIE TOWARZYSTWO PRZYRODNIKÓW IM. KOPERNIKA,
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.36921/kos.2019_2508 – link do publikacji
-
PartSeg: a tool for quantitative feature extraction from 3D microscopy images for dummies
- Autorzy:
- Bokota, G., Sroka, J., Basu, S., Das, N., Trzaskoma, P., Yushkevich, Y., Grabowska, A., Magalska, A., and Plewczynski, D.
- Czasopismo:
- BMC Bioinformatics (rok: 2021, tom: 22, strony: -), Wydawca: Springer Nature
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1186/s12859-021-03984-1 – link do publikacji
-
Activation-induced chromatin reorganization in neurons depends on HDAC1 activity
- Autorzy:
- Agnieszka Grabowska, Hanna Sas-Nowosielska, Dagmara Holm-Kaczmarek, Elzbieta Januszewicz, Yana Yushkevich, Iwona Czaban, Pawel Trzaskoma, Katarzyna Krawczyk, Bartosz Wojtas, Bartlomiej Gielniewski, Ana Martin-Gonzalez, Robert Kuba Filipkowski, Krzysztof Hubert Olszynski, Tytus Bernas, Andrzej Antoni Szczepankiewicz, Malgorzata Alicja Sliwinska, Tambudzai Kanhema, Clive R. Bramham, Grzegorz Bokota, Dariusz Plewczynski, Grzegorz Marek Wilczynski, Adriana Magalska
- Czasopismo:
- Cell Reports (rok: 2022, tom: 38, strony: 110352), Wydawca: CellPress
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.celrep.2022.110352. – link do publikacji
-
Long noncoding RNAs - crucial players organizing the landscape of neuronal nucleus
- Autorzy:
- Hanna Sas-Nowosielska1, Adriana Magalska
- Czasopismo:
- International Journal of Molecular Sciences (rok: 2021, tom: 22, strony: 3478), Wydawca: MDPI Open Access Journals
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3390/ijms22073478 – link do publikacji
-
The interplay of seizures-induced axonal sprouting and transcription-dependent Bdnf repositioning in the model of temporal lobe epilepsy
- Autorzy:
- Skupien-Jaroszek A., Walczak A., Czaban I., Pels K.K., Szczepankiewicz A.A., Krawczyk K., Ruszczycki B., Wilczynski G.M., Dzwonek J., Magalska A.
- Czasopismo:
- PLoS ONE (rok: 2021, tom: 16, strony: 46040), Wydawca: PLOS
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1371/journal.pone.0239111 – link do publikacji
-
Ultrastructural Visualization of 3D Chromatin Folding Using Serial Block-Face Scanning Electron Microscopy and In Situ Hybridization (3D-EMISH)
- Autorzy:
- Paweł Trzaskoma, Błażej Ruszczycki, Byoungkoo Lee, Katarzyna K. Pels, Katarzyna Krawczyk, Grzegorz Bokota, Andrzej A. Szczepankiewicz, Jesse Aaron, Agnieszka Walczak, Małgorzata A. Śliwińska, Adriana Magalska, Michal Kadlof, Artur Wolny, Zofia Parteka, Sebastian Arabasz, Magdalena Kiss-Arabasz, Dariusz Plewczynski, Yijun Ruan, Grzegorz M. Wilczyński
- Czasopismo:
- Nature Communication (rok: 2020, tom: 11, strony: 2120), Wydawca: Nature
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1038/s41467-020-15987-2 – link do publikacji