Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Poszukiwanie nowych struktur wiodących dla ligandów receptora serotoninowego 5-HT7 o zwiększonej stabilności metabolicznej

2015/18/M/NZ7/00377

Słowa kluczowe:

receptor serotoninowy 5-HT7 wirtualny skrining stabilność metaboliczna uczenie maszynowe

Deskryptory:

  • NZ7_14: Farmacja, farmakoterapia, farmakologia
  • NZ2_7: Bioinformatyka
  • ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne

Panel:

NZ7 - Zdrowie publiczne: epidemiologia, choroby cywilizacyjne i społeczne zagrożenia środowiskowe dla zdrowia ludzi i zwierząt, medyczna i weterynaryjna ochrona zdrowia publicznego, etyka, medycyna pracy, farmakoekonomika

Jednostka realizująca:

Instytut Farmakologii PAN

woj. małopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

Sabina Podlewska 

Liczba wykonawców projektu: 9

Konkurs: HARMONIA 7 - ogłoszony 2015-06-15

Przyznana kwota: 243 120 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2016-04-12

Zakończenie projektu: 2018-05-11

Planowany czas trwania projektu: 24 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (7)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (2)
  1. Creating the New from the Old – Combinatorial Libraries Generation with Machine Learning-Based Compound Structure Optimization IF: 3,66
    Autorzy:
    Podlewska, S.; Czarnecki, W. M.; Kafel, R.; Bojarski, A. J.
    Czasopismo:
    Journal of Chemical Information and Modeling (rok: 2017, tom: 57, strony: 133−147), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jcim.6b00426 - link do publikacji
  2. Three-dimensional descriptors for aminergic GPCRs: dependence on docking conformation and crystal structure IF: 2032
    Autorzy:
    Jastrzębski, S.; Sieradzki, I.; Leśniak, D.; Tabor, J.; Bojarski, A. J.; Podlewska, S.
    Czasopismo:
    Molecular Diversity (rok: 2019, tom: 23, strony: 603-613), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s11030-018-9894-4 - link do publikacji
  3. Aminergic GPCR-ligand interactions: A chemical and structural map of aminergic receptor mutation data IF: 6,259
    Autorzy:
    Vass, Marton; Podlewska, Sabina; De Esch, Iwan ; Bojarski, Andrzej; Leurs, R.; Kooistra, Albert; de Graaf, Chris
    Czasopismo:
    Journal of Medicinal Chemistry (rok: 2018, tom: 62, strony: 3784-3839), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jmedchem.8b00836 - link do publikacji
  4. Structural modifications of the serotonin 5-HT7 receptor agonist N-(4-cyanophenylmethyl)-4-(2-biphenyl)-1-piperazinehexanamide (LP-211) to improve in vitro microsomal stability: A case study IF: 3,9
    Autorzy:
    Lacivita, E.; Podlewska, S.; Speranza, L.; Niso, M.; Satała, G.; Perrone, R.; Perrone-Capano, C.; Bojarski, A. J.; Leopoldo, M.
    Czasopismo:
    European Journal of Medicinal Chemistry (rok: 2016, tom: 120, strony: 363-379), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.ejmech.2016.05.005 - link do publikacji
  5. Quo vadis G protein-coupled receptor ligands? A tool for analysis of the emergence of new groups of compounds over time IF: 2,49
    Autorzy:
    Leśniak, D.; Jastrzębski, S.; Podlewska, S.; Czarnecki, W. M.; Bojarski, A. J.
    Czasopismo:
    Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters (rok: 2017, tom: 27, strony: 626-631), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bmcl.2016.12.001 - link do publikacji
  6. MetStabOn – online platform for metabolic stability predictions. IF: 3,226
    Autorzy:
    Podlewska, S.; Kafel, R.
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2018, tom: 19, strony: 1040), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms19041040 - link do publikacji
  7. Structural insights into serotonin receptor ligands polypharmacology IF: 4,519
    Autorzy:
    Podlewska, S.; Kafel, R.; Lacivita, E.; Satała, G.; Kooistra, A. J.; Vass, M.; de Graaf, C.; Leopoldo, M.; Bojarski, A. J.; Mordalski, S.
    Czasopismo:
    European Journal of Medicinal Chemistry (rok: 2018, tom: 151, strony: 797-814), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.ejmech.2018.04.010 - link do publikacji
  1. The service of in silico methods in the development of metabolically stable ligands
    Autorzy:
    Podlewska, S.; Lacivita, E.; Kafel, R.; Leopoldo, M.; Bojarski, A. J.
    Konferencja:
    VIII Konwersatorium Chemii Medycznej (rok: 2016, ), Wydawca: Polskie Towarzystwo Chemii Medycznej
    Data:
    konferencja 15-17.09.2016
    Status:
    Opublikowana
  2. Towards new 5-HT7R ligands with improved metabolic stability – synthesis of LP-211 derivatives and their comprehensive evaluation in silico and in vitro
    Autorzy:
    Lacivita, E.; Podlewska, S.; Speranza, L.; Niso, M.; Satała, G.; Perrone, R.; Perrone-Capano, C. Bojarski, A. J.; Leopoldo, M.
    Konferencja:
    The 2nd Central European Biomedical Congress "From emerging biochemical strategies to personalized medicine" (rok: 2016, ), Wydawca: Instytut Farmakologii PAN
    Data:
    konferencja 15-18.06.2016
    Status:
    Opublikowana