Projekty finansowane przez NCN
Modelowanie struktur 3D i dynamiki kompleksów RNA z jonami metalu, ze szczególnym uwzględnieniem tworzenia się niekanonicznych par zasad. Rozbudowa modelu gruboziarnistego SimRNA w kierunku wysokiej rozdzielczości.
2015/17/D/NZ1/01560
Słowa kluczowe:
bioinformatyka RNA analiza strukturalna G-kwadrupleksy
Deskryptory:
- NZ1_4: Biologia strukturalna
- ST4_4: Struktura i architektura molekularna
- ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
Panel:
NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia
Jednostka realizująca:
Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk
woj. mazowieckie
Konkurs: SONATA 9 - ogłoszony 2015-03-16
Przyznana kwota: 465 400 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2016-02-18
Zakończenie projektu: 2019-08-17
Planowany czas trwania projektu: 42 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- Macierz dyskowa. Za kwotę 30 000 PLN
- Monitor. Za kwotę 1 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (2)
- Tracking Topological and Electronic Effects on the Folding and Stability of Guanine-Deficient RNA G-Quadruplexes, Engineered with a New Computational Tool for de novo Quadruplex FoldingAutorzy:Yavuz Burak Göç, Jakub Poziemski, Weronika Smolińska, Dominik Suwała, Grzegorz Wieczorek, Dorota Niedzialek *Czasopismo:International Journal of Molecular Sciences (rok: 2022, ), Wydawca: MDPIStatus:ZłożonaDoi:brak - link do publikacji
- Structural bases of peptidoglycan recognition by lysostaphin SH3b domainAutorzy:Paweł Mitkowski, Elżbieta Jagielska, Elżbieta Nowak, Janusz M. Bujnicki, Filip Stefaniak, Dorota Niedziałek, Matthias Bochtler & Izabela SabałaCzasopismo:Scientific Reports (rok: 2019, tom: 9, strony: 5965), Wydawca: Nature Publishing GroupStatus:OpublikowanaDoi:brak - link do publikacji