Projekty finansowane przez NCN
Zastosowanie sekwencjonowania DNA czwartej generacji do identyfikacji potencjalnych czynników zjadliwości wysoce patogennego klonu Corynebacterium diphtheriae powodującego bakteriemie i zapalenie wsierdzia
2015/17/N/NZ6/03517
Słowa kluczowe:
sekwencjonowanie czwartej generacji Corynebacterium diphtheriae czynniki zjadliwości
Deskryptory:
- NZ6_4: Bakteriologia
Panel:
NZ6 - Immunologia i choroby zakaźne ludzi i zwierząt: odporność, choroby immunologiczne, immunoterapia, choroby zakaźne i inwazyjne
Jednostka realizująca:
Narodowy Instytut Zdrowia Publicznego - Państwowy Zakład Higieny (NIZP - PZH)
woj. mazowieckie
Konkurs: PRELUDIUM 9 - ogłoszony 2015-03-16
Przyznana kwota: 149 984 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2016-03-15
Zakończenie projektu: 2022-09-14
Planowany czas trwania projektu: 78 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- Program do genomowych analiz bioinformatycznych (CLC Genome Workbetch, Lasergene 12 lub podobny). Za kwotę 25 000 PLN
- Komputer o wysokiej mocy obliczeniowej (wymagania minimalne: procesor i7, 8GB RAM, dysk SSD), z monitorem 27'', UPS, MsOffice, program antywirusowy. Za kwotę 10 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (3)
- Zastosowanie sekwencjonowania pełnogenomowego do genotypowania bakteriiAutorzy:Daria Artyszuk, Tomasz WołkowiczCzasopismo:Postępy Mikrobiologii (rok: 2018, tom: 57, strony: 179-193), Wydawca: Polskie Towarzystwo MikrobiologówStatus:OpublikowanaDoi:brak - link do publikacji
- The utility and perspectives of NGS-based methods in BSL-3 and BSL-4 laboratory – sequencing and analysis strategiesAutorzy:Tomasz WołkowiczCzasopismo:Briefings in Functional Genomics (rok: 2017, tom: -, strony: 45297), Wydawca: Oxford AcademicStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/bfgp/elx033 - link do publikacji
- Genomic analysis of Corynebacterium diphtheriae strains iso-lated in 2007-2022 with report of identification of the first non-toxigenic tox gene-bearing strain in PolandAutorzy:Tomasz Wołkowicz, Katarzyna Zacharczuk, Aleksandra Anna ZasadaCzasopismo:International Journal of Molecular Science (rok: 2023, tom: nie dotyczy, strony: nie dotyczy), Wydawca: MDPIStatus:ZłożonaDoi:brak - link do publikacji