Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Wgląd w biochemię, strukturę, ewolucję i biologię bakteryjnych serpin na przykładzie miropiny z ludzkiego patogenu Tannerella forsythia.

2015/17/B/NZ1/00666

Słowa kluczowe:

parodontoza Tannerella forsythia serpiny bakteryjne miropina inhibition of serine and cysteine proteases

Deskryptory:

  • NZ1_2: Biochemia
  • NZ1_1: Biologia molekularna

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Jagielloński, Małopolskie Centrum Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego

woj. małopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Mirosław Książek 

Liczba wykonawców projektu: 3

Konkurs: OPUS 9 - ogłoszony 2015-03-16

Przyznana kwota: 1 255 700 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2016-02-01

Zakończenie projektu: 2019-12-03

Planowany czas trwania projektu: 46 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Komputer niestacjonarny typu laptop.
  2. Mieszadło magentyczne (3 szt.). Za kwotę 7 950 PLN
  3. Oprogramowanie do analizy sekwencji DNA Lasergene (DNAStar).
  4. Termoblok z wymiennymi blokami grzejnymi. Za kwotę 7 000 PLN
  5. Horyzontalny zestaw do elektroforezy żeli agarozowych. Za kwotę 2 400 PLN
  6. Zestaw do elektroforezy w żelach poliakrylamidowych (2 szt.). Za kwotę 18 500 PLN
  7. Zamrażarka -20oC. Za kwotę 5 000 PLN
  8. Lodówka. Za kwotę 6 000 PLN
  9. Mała cieplarka laboratoryjna. Za kwotę 5 750 PLN
  10. Poręczny homogenizator laboratoryjny. Za kwotę 10 500 PLN
  11. Spektrofotometryczny czytnik mikropłytek z laptopem sterującym.
  12. Termomikser z blokami na probówki 1.5, 2 ml i płytki. Za kwotę 19 000 PLN
  13. Prosty worteks laboratoryjny (2 szt.). Za kwotę 1 600 PLN
  14. Wirówka z zestawem rotorów. Za kwotę 60 000 PLN
  15. Zestaw do elektrotransferu "mokrego" (2 szt.). Za kwotę 14 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (6)
  1. Structure-based mechanism of cysteine-switch latency and of catalysis by pappalysin-family metallopeptidases
    Autorzy:
    Tibisay Guevara, Arturo Rodriguez-Banqueri, Miroslaw Ksiazek, Jan Potempa, F. Xavier Gomis-Rüth
    Czasopismo:
    IUCrJ (rok: 2020, tom: 7, strony: 18-29), Wydawca: International Union of Crystallography (IUCr)
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1107/S2052252519013848 - link do publikacji
  2. A structure-derived snap-trap mechanism of a multispecific serpin from the dysbiotic human oral microbiome
    Autorzy:
    Goulas T, Ksiazek M (równorzędny I autor), Garcia-Ferrer I, Sochaj-Gregorczyk AM, Waligorska I, Wasylewski M, Potempa J, Gomis-Rüth FX
    Czasopismo:
    Journal of Biological Chemistry (rok: 2017, tom: 292(26), strony: 10883-10898), Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular Biology
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1074/jbc.M117.786533 - link do publikacji
  3. Structural and functional probing of PorZ, an essential bacterial surface component of the type-IX secretion system of human oral-microbiomic Porphyromonas gingivalis.
    Autorzy:
    Lasica AM, Goulas T, Mizgalska D, Zhou X, de Diego I, Ksiazek M, Madej M, Guo Y, Guevara T, Nowak M, Potempa B, Goel A, Sztukowska M, Prabhakar AT, Bzowska M, Widziolek M, Thøgersen IB, Enghild JJ, Simonian M, Kulczyk AW, Nguyen KA, Potempa J, Gomis-Rüth FX.
    Czasopismo:
    Scientific reports (rok: 2016, tom: 6, strony: 37708), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/srep37708 - link do publikacji
  4. Structural determinants of inhibition of Porphyromonas gingivalis gingipain K by KYT-36, a potent, selective, and bioavailable peptidase inhibitor.
    Autorzy:
    Guevara T, Rodríguez-Banqueri A, Lasica AM, Ksiazek M, Potempa BA, Potempa J, Gomis-Rüth FX
    Czasopismo:
    Scientific reports (rok: 2019, tom: 9, strony: 4935), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-019-41354-3 - link do publikacji
  5. Plasmin inhibition by bacterial serpin: Implications in gum disease.
    Autorzy:
    Sochaj-Gregorczyk A, Ksiazek M (równorzędny I autor; autor korespondencyjny), Waligorska I, Straczek A, Benedyk M, Mizgalska D, Thøgersen IB, Enghild JJ, Potempa J
    Czasopismo:
    FASEB J (rok: 2020, tom: 34, strony: 619-630), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1096/fj.201901490RR - link do publikacji
  6. Mirolysin, a LysargiNase from Tannerella forsythia, proteolytically inactivates the human cathelicidin, LL-37.
    Autorzy:
    Lahari Koneru, Miroslaw Ksiazek (równorzędny I autor; autor korespondencyjny), Irena Waligorska, Anna Straczek, Magdalena Lukasik, Mariusz Madej, Ida B. Thøgersen, Jan J. Enghild and Jan Potempa
    Czasopismo:
    Biological Chemistry (rok: 2017, tom: 398(3), strony: 365-409), Wydawca: De Gruyter
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1515/hsz-2016-0267 - link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy