Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Mechanizm reakcji transferu metylu katalizowany przez metylotransferazy zawierające pochodne witaminy B12

2015/17/B/ST4/03733

Słowa kluczowe:

transfer metylu metylokobalamina wiązanie Co-C obliczenia kwantowo-mechaniczne obliczenia kombinowane QM/MM kataliza enzymatyczna

Deskryptory:

  • ST4_15: Chemia teoretyczna i obliczeniowa
  • ST4_13: Chemia fizyczna układów biologicznych

Panel:

ST4 - Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna

Jednostka realizująca:

Gdański Uniwersytet Medyczny, Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej

woj. pomorskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Pawel Kozlowski 

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs: OPUS 9 - ogłoszony 2015-03-16

Przyznana kwota: 412 600 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2016-02-26

Zakończenie projektu: 2019-02-25

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Przenośny komputer.
  2. Stacjonarny komputer (2 szt.). Za kwotę 10 000 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (13)
  1. Elucidating the mechanism of alkylation reaction involving cob(I)alamin by alkyl halide: SN2 or radical mechanism? IF: 6,759
    Autorzy:
    A. P. Ghosh, P. Lodowski, A. Chmielewska, M. Jaworska, P. M. Kozlowski
    Czasopismo:
    Journal of Catalysis (rok: 2019, tom: 376, strony: 32-43), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    0.1016/j.jcat.2019.06.036 - link do publikacji
  2. Mechanism of Light Induced Radical Pair Formation in Coenzyme B12-Dependent Ethanolamine Ammonia-Lyase IF: 11,384
    Autorzy:
    A. Al Mamun, M. J. Toda, P. Lodowski, M. Jaworska, P. M. Kozlowski
    Czasopismo:
    ACS Catalysis (rok: 2018, tom: 8, strony: 7164-7178), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acscatal.8b00120 - link do publikacji
  3. Mechanistic Implications of Co-C Bond Cleavage in B12-Dependent Methylmalonyl CoA Mutase IF: 3,146
    Autorzy:
    N. Kumar, D. Bucher, P. M. Kozlowski
    Czasopismo:
    Journal of Physical Chemistry B (rok: 2019, tom: 123, strony: 2210-2216), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpcb.8b10820 - link do publikacji
  4. Mercury Methylation by Cobalt Corrinoids: Relativistic Effects Dictate the Reaction Mechanism IF: 11,709
    Autorzy:
    T. B. Demissie, B. D. Garabato, K. Ruud, and P. M. Kozlowski
    Czasopismo:
    Angewandte Chemie International Edition (rok: 2016, tom: 55, strony: 11503-11506), Wydawca: Wiley-VCH Verlag GmbH & Co.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/anie.201606001 - link do publikacji
  5. Photodissociation of ethylphenylcobalamin antivitamin B12 IF: 4,123
    Autorzy:
    Piotr Lodowski Karolina Ciura Megan J. Toda Maria Jaworska Pawel M. Kozlowski
    Czasopismo:
    Physical Chemistry Chemical Physics (rok: 2017, tom: 19, strony: 30310-30315), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C7CP06589B - link do publikacji
  6. Photolytic Cleavage of Co-C Bond in Coenzyme B12-Dependent Glutamate Mutase IF: 3,146
    Autorzy:
    A. Al Mamun, M. J. Toda, P. Lodowski, M. Jaworska, P. M. Kozlowski
    Czasopismo:
    Journal of Physical Chemistry B (rok: 2019, tom: 123, strony: 2585-2598), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpcb.8b07547 - link do publikacji
  7. Can Photolysis of the Co-C Bond in Coenzyme B12-dependent Enzymes be Used to Mimic the Native Reaction? IF: 3,165
    Autorzy:
    A. Al Mamun, M. J. Toda, P. M. Kozlowski
    Czasopismo:
    Journal of Photochemistry and Photobiology B (rok: 2019, tom: 191, strony: 175-184), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.jphotobiol.2018.12.018 - link do publikacji
  8. Electronic and structural properties of Cob(I)alamin: Ramifications for B12-dependent processes IF: 12,994
    Autorzy:
    M. Kumar and P. M. Kozlowski
    Czasopismo:
    Coordination Chemistry Reviews (rok: 2017, tom: 333, strony: 71-81), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.ccr.2016.11.010 - link do publikacji
  9. Mechanism of the Photo-induced Activation of Co-C Bond in Methylcobalamin-Dependent Methionine Synthase IF: 3,165
    Autorzy:
    A. P. Ghosh, A. Al Mamun, P. Lodowski, M. Jaworska, P. M. Kozlowski
    Czasopismo:
    Journal of Photochemistry and Photobiology B (rok: 2018, tom: 189, strony: 306-317), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.jphotobiol.2018.09.015 - link do publikacji
  10. Methyl transfer reactions catalyzed by cobalamin-dependent enzymes: Insight from molecular docking IF: 1,885
    Autorzy:
    S. Malinowski, A. P. Ghosh, S. Edwards, J. Jaroszyńska-Wolińska, P. M. Kozlowski
    Czasopismo:
    Journal of Molecular Graphics and Modeling (rok: 2021, tom: 104, strony: 107831), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.jmgm.2020.107831 - link do publikacji
  11. Ultrafast X-Ray Absorption Near Edge Structure Reveals Ballistic Excited State Structural Dynamics IF: 2,826
    Autorzy:
    4.N. A. Miller, A. Deb, R. Alonso-Mori, J. M. Glownia, L. M. Kiefer, A. Konar, L. B. Michocki, M. Sikorski, D. L. Sofferman, S. Song, M. J. Toda, T. E. Wiley, D. Zhu, P. M. Kozlowski, K. J. Kubarych, J. E. Penner-Hahn, R. J. Sension
    Czasopismo:
    Journal of Physical Chemistry A (rok: 2018, tom: 122, strony: 4963-4971), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpca.8b04223 - link do publikacji
  12. Off to the races: Comparison of excited state dynamics in vitamin B12 derivatives hydroxobobalmin and aquocobalamin IF: 2,836
    Autorzy:
    T. E. Wiley, N A. Miller, W. R. Miller, D. Sofferman, P. Lodowski, M. J. Toda, M. Jaworska, P. M. Kozlowski, R. J. Sension
    Czasopismo:
    Journal of Physical Chemistry A (rok: 2018, tom: 122, strony: 6693-6703), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpca.8b06103 - link do publikacji
  13. Photolytic Properties of Antivitamins B12 IF: 4,7
    Autorzy:
    P. Lodowski, M. J. Toda, K. Ciura, M. Jaworska, P. M. Kozlowski,
    Czasopismo:
    Inorganic Chemistry (rok: 2018, tom: 57, strony: 7164-7178), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.inorgchem.8b00956 - link do publikacji