Change language

Wyszukiwarka projektów

Oksygenazy zależne od 2-oksoglutaranu w biosyntezie alkaloidów o aktywności farmakologicznej - struktury, mechanizmy reakcji i racjonalne przeprojektowywanie enzymów.

2014/14/E/NZ1/00053

Słowa kluczowe

Deskryptory

  • NZ1_4: Biologia strukturalna
  • ST4_15: Chemia teoretyczna i obliczeniowa

Panel

NZ1 – Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca

Instytut Katalizy i Fizykochemii Powierzchni im. Jerzego Habera PAN

woj. małopolskie

Inne projekty tej jednostki »

Kierownik projektu (z jednostki realizującej)

prof. Tomasz Maciej Borowski

Liczba wykonawców projektu: 7

Konkurs

SONATA BIS 4 – ogłoszony 2014-06-16

Przyznana kwota
1 998 850 PLN
Rozpoczęcie projektu
2015-05-05
Zakończenie projektu
2021-05-04
Planowany czas trwania projektu
72 miesiące (z wniosku)
Status projektu
Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Dewar do przechowywania próbek. Za kwotę 8 000 PLN
  2. Komputery stacjonarne typu desktop (4 szt.). Za kwotę 10 000 PLN
  3. Lodówka. Za kwotę 5 000 PLN
  4. Rotor do płytek. Za kwotę 5 000 PLN
  5. Serwer dyskowy. Za kwotę 7 300 PLN
  6. Spektrofotometr do pomiarów mikrolitrowych próbek. Za kwotę 40 000 PLN
  7. Termocykler. Za kwotę 40 000 PLN
  8. Uchwyty na próbki kompatybilne z robotem do automatycznego montowania kryształów. (5 szt.). Za kwotę 15 000 PLN
  9. Wysokociśnieniowy dezintegrator komórek. Za kwotę 70 000 PLN
  10. Wytrząsarka z funkcją chłodzenia.
  11. Wytrząsarka z funkcją chłodzenia. Za kwotę 40 000 PLN
  12. Zamrażarka głębokiego mrożenia. Za kwotę 40 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

Publikacje w czasopismach (8)

  1. Crystal structure of thebaine 6-O-demethylase from the morphine biosynthesis pathway

    Autorzy:
    Anna Kluza , Ewa Niedzialkowska, Katarzyna Kurpiewska, Zuzanna Wojdyla, Matthew Quesne, Ewa Kot, Przemyslaw J. Porebski, Tomasz Borowski
    Czasopismo:
    Journal of Structural Biology (rok: 2018, tom: 202, strony: 229-235), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1016/j.jsb.2018.01.007 – link do publikacji

  2. Mechanism of O2 Activation by α‑Ketoglutarate Dependent Oxygenases Revisited. A Quantum Chemical Study

    Autorzy:
    Anna Wójcik, Mariusz Radoń, Tomasz Borowski
    Czasopismo:
    The Journal of Physical Chemistry A (rok: 2016, tom: 120, strony: 1261-1274), Wydawca: ACS
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1021/acs.jpca.5b12311 – link do publikacji

  3. It takes two to tango - the case of thebaine 6-O-demethylase

    Autorzy:
    S. Kachhap, Z. Wojdyla P. Komorek, A. Kluza, K. Kurpiewska, B. Jachimska, T. Borowski
    Czasopismo:
    International Journal of Biological Macromolecules (rok: 2020, tom: 163, strony: 718-729), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1016/j.ijbiomac.2020.07.030 – link do publikacji

  4. Enzyme multifunctionality via control of substrate positioning within the catalytic cycle - a QM/MM study for clavaminic acid synthase

    Autorzy:
    Z. Wojdyla, T. Borowski
    Czasopismo:
    Chemistry – A European Journal (rok: 2021, tom: 27, strony: 2196-2211), Wydawca: Chemistry Europe
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1002/chem.202004426 – link do publikacji

  5. Comparative structural and mechanistic studies of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductases from Mycobacterium tuberculosis and Vibrio vulnificus

    Autorzy:
    S. Pote, S. Kachhap, N. J. Mank, L. Daneshian, V. Klapper, S. Pye, A. K. Arnette, L. S. Shimizu, T. Borowski, M. Chruszcz
    Czasopismo:
    BBA - General Subjects (rok: 2021, tom: 1865, strony: 129750), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1016/j.bbagen.2020.129750 – link do publikacji

  6. On how the binding cavity of AsqJ dioxygenase controls the desaturation reaction regioselectivity: a QM/MM study.

    Autorzy:
    Zuzanna Wojdyla, Tomasz Borowski
    Czasopismo:
    Journal of Biological Inorganic Chemistry (rok: 2018, tom: 23, strony: 795-808), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1007/s00775-018-1575-3 – link do publikacji

  7. Regioselectivity of hyoscyamine 6β-hydroxylase- catalysed hydroxylation as revealed by high- resolution structural information and QM/MM calculations

    Autorzy:
    A. Kluza, Z. Wojdyla, B. Mrugala, K. Kurpiewska, P.J. Porebski, E. Niedzialkowska, W. Minor, M.S. Weiss, T. Borowski,
    Czasopismo:
    Dalton Transactions (rok: 2020, tom: 49, strony: 4454-4469), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1039/d0dt00302f – link do publikacji

  8. Properties of the Reactants and Their Interactions within and with the Enzyme Binding Cavity Determine Reaction Selectivities. The Case of Fe(II)/2-Oxoglutarate Dependent Enzymes

    Autorzy:
    Zuzanna Wojdyła, Tomasz Borowski
    Status:
    Przyjęta do publikacji

« Nowe wyszukiwanie

Projekt graficzny i wykonanie: Jakub Piotrowski