Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Oksygenazy zależne od 2-oksoglutaranu w biosyntezie alkaloidów o aktywności farmakologicznej - struktury, mechanizmy reakcji i racjonalne przeprojektowywanie enzymów.

2014/14/E/NZ1/00053

Słowa kluczowe:

metaloenzymy krystalografia białek metody chemii kwantowej mechanizmy reakcji przeprojektowywanie enzymów

Deskryptory:

  • NZ1_4: Biologia strukturalna
  • ST4_15: Chemia teoretyczna i obliczeniowa

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Instytut Katalizy i Fizykochemii Powierzchni im. Jerzego Habera Polskiej Akademii Nauk

woj. małopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Tomasz Borowski 

Liczba wykonawców projektu: 7

Konkurs: SONATA BIS 4 - ogłoszony 2014-06-16

Przyznana kwota: 1 998 850 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2015-05-05

Zakończenie projektu: 2021-05-04

Planowany czas trwania projektu: 72 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Spektrofotometr do pomiarów mikrolitrowych próbek. Za kwotę 40 000 PLN
  2. Termocykler. Za kwotę 40 000 PLN
  3. Lodówka. Za kwotę 5 000 PLN
  4. Wytrząsarka z funkcją chłodzenia.
  5. Dewar do przechowywania próbek. Za kwotę 8 000 PLN
  6. Rotor do płytek. Za kwotę 5 000 PLN
  7. Wysokociśnieniowy dezintegrator komórek. Za kwotę 70 000 PLN
  8. Wytrząsarka z funkcją chłodzenia. Za kwotę 40 000 PLN
  9. Komputery stacjonarne typu desktop (4 szt.). Za kwotę 10 000 PLN
  10. Serwer dyskowy. Za kwotę 7 300 PLN
  11. Zamrażarka głębokiego mrożenia. Za kwotę 40 000 PLN
  12. Uchwyty na próbki kompatybilne z robotem do automatycznego montowania kryształów. (5 szt.). Za kwotę 15 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (8)
  1. Mechanism of O2 Activation by α‑Ketoglutarate Dependent Oxygenases Revisited. A Quantum Chemical Study
    Autorzy:
    Anna Wójcik, Mariusz Radoń, Tomasz Borowski
    Czasopismo:
    The Journal of Physical Chemistry A (rok: 2016, tom: 120, strony: 1261-1274), Wydawca: ACS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpca.5b12311 - link do publikacji
  2. On how the binding cavity of AsqJ dioxygenase controls the desaturation reaction regioselectivity: a QM/MM study.
    Autorzy:
    Zuzanna Wojdyla, Tomasz Borowski
    Czasopismo:
    Journal of Biological Inorganic Chemistry (rok: 2018, tom: 23, strony: 795-808), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00775-018-1575-3 - link do publikacji
  3. Properties of the Reactants and Their Interactions within and with the Enzyme Binding Cavity Determine Reaction Selectivities. The Case of Fe(II)/2-Oxoglutarate Dependent Enzymes
    Autorzy:
    Zuzanna Wojdyła, Tomasz Borowski
    Czasopismo:
    Chemistry - A European Journal (rok: 2022, ), Wydawca: Chemistry Europe
    Status:
    Przyjęta do publikacji
    Doi:
    10.1002/chem.202104106 - link do publikacji
  4. It takes two to tango - the case of thebaine 6-O-demethylase
    Autorzy:
    S. Kachhap, Z. Wojdyla P. Komorek, A. Kluza, K. Kurpiewska, B. Jachimska, T. Borowski
    Czasopismo:
    International Journal of Biological Macromolecules (rok: 2020, tom: 163, strony: 718-729), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.ijbiomac.2020.07.030 - link do publikacji
  5. Enzyme multifunctionality via control of substrate positioning within the catalytic cycle - a QM/MM study for clavaminic acid synthase
    Autorzy:
    Z. Wojdyla, T. Borowski
    Czasopismo:
    Chemistry – A European Journal (rok: 2021, tom: 27, strony: 2196-2211), Wydawca: Chemistry Europe
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/chem.202004426 - link do publikacji
  6. Regioselectivity of hyoscyamine 6β-hydroxylase- catalysed hydroxylation as revealed by high- resolution structural information and QM/MM calculations
    Autorzy:
    A. Kluza, Z. Wojdyla, B. Mrugala, K. Kurpiewska, P.J. Porebski, E. Niedzialkowska, W. Minor, M.S. Weiss, T. Borowski,
    Czasopismo:
    Dalton Transactions (rok: 2020, tom: 49, strony: 4454-4469), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/d0dt00302f - link do publikacji
  7. Comparative structural and mechanistic studies of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductases from Mycobacterium tuberculosis and Vibrio vulnificus
    Autorzy:
    S. Pote, S. Kachhap, N. J. Mank, L. Daneshian, V. Klapper, S. Pye, A. K. Arnette, L. S. Shimizu, T. Borowski, M. Chruszcz
    Czasopismo:
    BBA - General Subjects (rok: 2021, tom: 1865, strony: 129750), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bbagen.2020.129750 - link do publikacji
  8. Crystal structure of thebaine 6-O-demethylase from the morphine biosynthesis pathway
    Autorzy:
    Anna Kluza , Ewa Niedzialkowska, Katarzyna Kurpiewska, Zuzanna Wojdyla, Matthew Quesne, Ewa Kot, Przemyslaw J. Porebski, Tomasz Borowski
    Czasopismo:
    Journal of Structural Biology (rok: 2018, tom: 202, strony: 229-235), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.jsb.2018.01.007 - link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy