Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Oksygenazy zależne od 2-oksoglutaranu w biosyntezie alkaloidów o aktywności farmakologicznej - struktury, mechanizmy reakcji i racjonalne przeprojektowywanie enzymów.

2014/14/E/NZ1/00053

Słowa kluczowe:

metaloenzymy krystalografia białek metody chemii kwantowej mechanizmy reakcji przeprojektowywanie enzymów

Deskryptory:

  • NZ1_4: Biologia strukturalna
  • ST4_15: Chemia teoretyczna i obliczeniowa

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Instytut Katalizy i Fizykochemii Powierzchni im. Jerzego Habera Polskiej Akademii Nauk

woj. małopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Tomasz Borowski 

Liczba wykonawców projektu: 7

Konkurs: SONATA BIS 4 - ogłoszony 2014-06-16

Przyznana kwota: 1 998 850 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2015-05-05

Zakończenie projektu: 2021-05-04

Planowany czas trwania projektu: 72 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Rotor do płytek. Za kwotę 5 000 PLN
  2. Termocykler. Za kwotę 40 000 PLN
  3. Dewar do przechowywania próbek. Za kwotę 8 000 PLN
  4. Zamrażarka głębokiego mrożenia. Za kwotę 40 000 PLN
  5. Wysokociśnieniowy dezintegrator komórek. Za kwotę 70 000 PLN
  6. Wytrząsarka z funkcją chłodzenia. Za kwotę 40 000 PLN
  7. Komputery stacjonarne typu desktop (4 szt.). Za kwotę 10 000 PLN
  8. Spektrofotometr do pomiarów mikrolitrowych próbek. Za kwotę 40 000 PLN
  9. Wytrząsarka z funkcją chłodzenia.
  10. Lodówka. Za kwotę 5 000 PLN
  11. Serwer dyskowy. Za kwotę 7 300 PLN
  12. Uchwyty na próbki kompatybilne z robotem do automatycznego montowania kryształów. (5 szt.). Za kwotę 15 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (8)
  1. Regioselectivity of hyoscyamine 6β-hydroxylase- catalysed hydroxylation as revealed by high- resolution structural information and QM/MM calculations
    Autorzy:
    A. Kluza, Z. Wojdyla, B. Mrugala, K. Kurpiewska, P.J. Porebski, E. Niedzialkowska, W. Minor, M.S. Weiss, T. Borowski,
    Czasopismo:
    Dalton Transactions (rok: 2020, tom: 49, strony: 4454-4469), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/d0dt00302f - link do publikacji
  2. Mechanism of O2 Activation by α‑Ketoglutarate Dependent Oxygenases Revisited. A Quantum Chemical Study
    Autorzy:
    Anna Wójcik, Mariusz Radoń, Tomasz Borowski
    Czasopismo:
    The Journal of Physical Chemistry A (rok: 2016, tom: 120, strony: 1261-1274), Wydawca: ACS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpca.5b12311 - link do publikacji
  3. Comparative structural and mechanistic studies of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductases from Mycobacterium tuberculosis and Vibrio vulnificus
    Autorzy:
    S. Pote, S. Kachhap, N. J. Mank, L. Daneshian, V. Klapper, S. Pye, A. K. Arnette, L. S. Shimizu, T. Borowski, M. Chruszcz
    Czasopismo:
    BBA - General Subjects (rok: 2021, tom: 1865, strony: 129750), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bbagen.2020.129750 - link do publikacji
  4. Crystal structure of thebaine 6-O-demethylase from the morphine biosynthesis pathway
    Autorzy:
    Anna Kluza , Ewa Niedzialkowska, Katarzyna Kurpiewska, Zuzanna Wojdyla, Matthew Quesne, Ewa Kot, Przemyslaw J. Porebski, Tomasz Borowski
    Czasopismo:
    Journal of Structural Biology (rok: 2018, tom: 202, strony: 229-235), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.jsb.2018.01.007 - link do publikacji
  5. Enzyme multifunctionality via control of substrate positioning within the catalytic cycle - a QM/MM study for clavaminic acid synthase
    Autorzy:
    Z. Wojdyla, T. Borowski
    Czasopismo:
    Chemistry – A European Journal (rok: 2021, tom: 27, strony: 2196-2211), Wydawca: Chemistry Europe
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/chem.202004426 - link do publikacji
  6. It takes two to tango - the case of thebaine 6-O-demethylase
    Autorzy:
    S. Kachhap, Z. Wojdyla P. Komorek, A. Kluza, K. Kurpiewska, B. Jachimska, T. Borowski
    Czasopismo:
    International Journal of Biological Macromolecules (rok: 2020, tom: 163, strony: 718-729), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.ijbiomac.2020.07.030 - link do publikacji
  7. On how the binding cavity of AsqJ dioxygenase controls the desaturation reaction regioselectivity: a QM/MM study.
    Autorzy:
    Zuzanna Wojdyla, Tomasz Borowski
    Czasopismo:
    Journal of Biological Inorganic Chemistry (rok: 2018, tom: 23, strony: 795-808), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00775-018-1575-3 - link do publikacji
  8. Properties of the Reactants and Their Interactions within and with the Enzyme Binding Cavity Determine Reaction Selectivities. The Case of Fe(II)/2-Oxoglutarate Dependent Enzymes
    Autorzy:
    Zuzanna Wojdyła, Tomasz Borowski
    Czasopismo:
    Chemistry - A European Journal (rok: 2022, ), Wydawca: Chemistry Europe
    Status:
    Przyjęta do publikacji
    Doi:
    10.1002/chem.202104106 - link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy