Projekty finansowane przez NCN
Rozwój i zastosowanie narzędzia bioinformatycznego do oceny jakości modeli struktur RNA
2014/12/T/NZ2/00501
Słowa kluczowe:
Deskryptory:
- NZ2_7: Bioinformatyka
Panel:
NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca:
Instytut Biochemii i Biofizyki PAN
woj. mazowieckie
Konkurs: ETIUDA 2 - ogłoszony 2013-12-16
Przyznana kwota: 98 540 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2014-10-01
Zakończenie projektu: 2015-09-30
Planowany czas trwania projektu: 12 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (1)
- Publikacje książkowe (2)
- SimRNAweb: a web server for RNA 3D structure modeling with optional restraintsAutorzy:M. Magnus, M. J. Boniecki, W. K. Dawson, and J. M. BujnickiCzasopismo:Nucleic Acids Research (rok: 2016, tom: 44, strony: W315–W319), Wydawca: Oxford University PressStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/nar/gkw279 - link do publikacji
- Modeling of Protein-RNA Complex Structures Using Computational Docking MethodsAutorzy:B. Madan, J. M. Kasprzak, I. Tuszyńska, M. Magnus, K. Szczepaniak, W. K. Dawson, and J. M. BujnickiKsiążka:Computational Design of Ligand Binding Proteins. Methods in Molecular Biology (rok: 2016, tom: 1414, strony: 353-372), Wydawca: Humana Press, New York, NYStatus:Opublikowana
- RNA 3D Structure Modeling by Combination of Template-Based Method ModeRNA, Template-Free Folding with SimRNA, and Refinement with QRNAS.Autorzy:P. Piatkowski, J. M. Kasprzak, D. Kumar, M. Magnus, G. Chojnowski, and J. M. BujnickiKsiążka:RNA Structure Determination. Methods in Molecular Biology (rok: 2016, tom: 1490, strony: 217–235), Wydawca: Humana Press, New York, NYStatus:Opublikowana