Rozwój metodologii porównawczej, nowoczesnych metryk walidacji oraz nowoczesnych technik wizualizacji dla algorytmów biklasteryzacji
2013/11/N/ST6/03204
Słowa kluczowe
Deskryptory
- ST6_6: Algorytmika, algorytmy równoległe, rozproszone i sieciowe, algorytmiczna teoria gier
- ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
- ST6_12: Obliczenia naukowe, narzędzia modelowania i symulacji
Panel
ST6 – Informatyka i technologie informacyjne: technologie i systemy informacyjne, informatyka, obliczenia naukowe, systemy inteligentne
Jednostka realizująca
Akademia Górniczo-Hutnicza im. Stanisława Staszica w Krakowie, Wydział Elektrotechniki, Automatyki, Informatyki i Inżynierii Biomedycznej
woj. małopolskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 2
Konkurs
PRELUDIUM 6 – ogłoszony 2013-09-16
- Przyznana kwota
- 99 750 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2014-07-29
- Zakończenie projektu
- 2017-01-28
- Planowany czas trwania projektu
- 30 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Drukarka kolorowa. Za kwotę 710 PLN
- Koprocesor do obliczeń równoległych na potrzeby algorytmu typu ensemble i skalowania wielowymiarowego (lub metody pokrewnej). Za kwotę 5 400 PLN
- Zestaw komputerowy wspierający koprocesor. Za kwotę 12 790 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (3)
-
Effective biclustering on GPU - capabilities and constraints
- Autorzy:
- Patryk Orzechowski, Krzysztof Boryczko
- Czasopismo:
- Przegląd Elektrotechniczny (rok: 2015, tom: R. 91 NR 8/2015, strony: 131-134), Wydawca: SIGMA-NOT
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.15199/48.2015.08.31 – link do publikacji
-
Rough assessment of GPU capabilities for parallel PCC-based biclustering method applied to microarray datasets
- Autorzy:
- Patryk Orzechowski, Krzysztof Boryczko
- Czasopismo:
- Bio-Algorithms and Med-Systems (BAMS) (rok: 2015, tom: Vol. 11,Issue 4, strony: 243–248), Wydawca: De Gruyter
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1515/bams-2015-0033 – link do publikacji
-
PROPAGATION-BASED BICLUSTERING ALGORITHM FOR EXTRACTING INCLUSION-MAXIMAL MOTIFS
- Autorzy:
- Partyk Orzechowski, Krzysztof Boryczko
- Czasopismo:
- Computing and Informatics (rok: 2016, tom: 35, strony: 391-410), Wydawca: SLOVAK ACADEMY OF SCIENCES
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- link do publikacji
Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (3)
-
Hybrid biclustering algorithms for data mining
- Autorzy:
- Patryk Orzechowski, Krzysztof Boryczko
- Konferencja:
- Evolutionary Computation, Machine Learning and Data Mining in Computational Biology (EvoBIO 21016) (rok: 2016, strony: 156-168), Wydawca: Springer International Publishing Switzerland 2016
- Data:
- konferencja 29.03-1.04.2016
- Status:
- Opublikowana
-
QtBiVis: a software toolbox for visual analysis of biclustering experiment
- Autorzy:
- Artur Pańszczyk, Patryk Orzechowski
- Konferencja:
- Federated Conference on Computer Science and Information Systems (rok: 2016, strony: 1375-1378), Wydawca: ACSIS / IEEE
- Data:
- konferencja 11-14 września 2016
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- link do publikacji
-
Text mining with hybrid biclustering algorithms
- Autorzy:
- Patryk Orzechowski, Krzysztof Boryczko
- Konferencja:
- 15th International Conference on Artificial Intelligence and Soft Computing Web System (ICAISC 2016) (rok: 2016, strony: 102-113), Wydawca: Springer LNCS
- Data:
- konferencja 12-16.06.2016
- Status:
- Opublikowana
Publikacje książkowe (1)
-
Hybrid biclustering algorithms
- Autorzy:
- Patryk Orzechowski
- Książka:
- Hybrid biclustering algorithms (rok: 2016, tom: 1, strony: 177), Wydawca: Wydawnictwo AGH
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- link do publikacji