Projekty finansowane przez NCN
Efekty hydratacyjne w kinazach białkowych
2013/11/D/ST4/02821
Słowa kluczowe:
hydratacja białek związane cząsteczki wody kinazy białkowe symulacje dynamiki molekularnej efekty allosteryczne
Deskryptory:
- NZ1_3: Biofizyka
- ST4_4: Struktura i architektura molekularna
- ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
Panel:
ST4 - Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna
Jednostka realizująca:
Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego
woj. mazowieckie
Konkurs: SONATA 6 - ogłoszony 2013-09-16
Przyznana kwota: 251 080 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2014-08-14
Zakończenie projektu: 2018-08-13
Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Licencja na oprogramowanie CHARMM (bezterminowa).. Za kwotę 2 500 PLN
- Stacja robocza (3 szt.). Za kwotę 45 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (3)
- Conserved internal hydration motifs in protein kinasesAutorzy:Piotr SetnyCzasopismo:PROTEINS: Structure, Function, and Bioinformatics , Wydawca: WileyStatus:Przyjęta do publikacjiDoi:10.1002/prot.25977 - link do publikacji
- Explicit Solvent Hydration Benchmark for Proteins with Application to the PBSA MethodAutorzy:Piotr Setny, Anita DudekCzasopismo:Journal of Chemical Theory and Computation (rok: 2017, tom: 13, strony: 2762-2776), Wydawca: American Chemical SocietyStatus:OpublikowanaDoi:10.1021/acs.jctc.7b00247 - link do publikacji
- A water mediated conformational preselection mechanism in substrate binding cooperativity to Protein Kinase AAutorzy:Piotr Setny, Marta WiśniewskaCzasopismo:Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (rok: 2018, tom: 115, strony: 3852-3857), Wydawca: National Academy of Sciences (U.S.)Status:OpublikowanaDoi:10.1073/pnas.1720024115 - link do publikacji