Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Mechanizm wiązania liganda oraz zmiany konformacyjne w cząsteczce receptora beta2-adrenergicznego

2013/09/D/NZ2/02992

Słowa kluczowe:

GPCR receptor beta2-adrenergiczny oddziaływanie lek-receptor proces aktywacji receptora zmiany konformacyjne modelowanie molekularne

Deskryptory:

  • NZ2_10: Modelowanie i symulacje biologiczne
  • ST4_15: Chemia teoretyczna i obliczeniowa
  • NZ1_1: Biologia molekularna

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Medyczny w Lublinie, Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Analityki Medycznej

woj. lubelskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Anita Płazińska 

Liczba wykonawców projektu: 5

Konkurs: SONATA 5 - ogłoszony 2013-03-15

Przyznana kwota: 404 750 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2014-02-20

Zakończenie projektu: 2017-02-19

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Serwer (HPC). Za kwotę 17 486 PLN
  2. Laptop z oprogramowaniem. Za kwotę 5 000 PLN
  3. Wirówka laboratoryjna.
  4. Suszarka labolatoryjna.
  5. Chłodziarka laboratoryjna.
  6. Komputer stacjonarny z oprogramowaniem. Za kwotę 5 000 PLN
  7. Łaźnia ultradźwiękowa (myjka otnb/4/2015).

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (4)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (1)
  1. Fast, Metadynamics-Based Method for Prediction of the Stereochemistry-Dependent Relative Free Energies of Ligand–Receptor Interactions. IF: 3,835
    Autorzy:
    Plazinska A., Plazinski W., Jozwiak K.
    Czasopismo:
    Journal of Computational Chemistry (rok: 2014, tom: 35, strony: 876–882), Wydawca: Wiley Online Library
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/jcc.23563. - link do publikacji
  2. Ligand-induced action of the W2866.48 rotamer toggle switch in β2-adrenergic receptor IF: 3,906
    Autorzy:
    Anita Plazinska, Wojciech Plazinski, Rafal Luchowski, Artur Wnorowski, Wojciech Grudzinski, Wieslaw I. Gruszecki
    Czasopismo:
    Physical Chemistry Chemical Physics (rok: 2017, tom: 20, strony: 581-594), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/jcc.23563 - link do publikacji
  3. Stereoselective binding of agonists to the β2-adrenergic receptor: insights into molecular details and thermodynamics from molecular dynamics simulations. IF: 2,829
    Autorzy:
    Plazinska A, Plazinski W.
    Czasopismo:
    Mol Biosyst. (rok: 2017, tom: brak, strony: brak), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c6mb00814c - link do publikacji
  4. Agonist binding by the β2-adrenergic receptor: an effect of receptor conformation on ligand association-dissociation characteristics. IF: 2,219
    Autorzy:
    Plazinska A, Plazinski W, Jozwiak K.
    Czasopismo:
    European Biophysics Journal (rok: 2015, tom: 44, strony: 149-163), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00249-015-1010-4 - link do publikacji
  1. Binding affinities of Gi and Gs proteins to the beta2-adrenergic receptor: insights from the coarse-grained molecular dynamics simulations
    Autorzy:
    A. Plazinska, W. Plazinski, M. Kolinski
    Konferencja:
    The International Conference on Computational Modeling & Simulation (ICCMS-2017) (rok: 2017, ), Wydawca: Faculty of Science, University of Colombo
    Data:
    konferencja 17-19.05.2017
    Status:
    Opublikowana