Influence of RNA structural elements on Ty1 retrotransposition
Autorzy:
Katarzyna J. Purzycka, David J. Garfinkel, Jef D. Boeke and Stuart F.J. Le Grice
Czasopismo:
Mob. Genet. Elements (rok: 2013, tom: 3(2), strony: e25060), Wydawca: Landes Bioscience, czasopismo na rynku od maja 2011 r.
RNAComposer and RNA 3D structure prediction for nanotechnology IF: 3,645
Autorzy:
Marcin Biesiada, Katarzyna Pachulska-Wieczorek, Ryszard W. Adamiak, Katarzyna J. Purzycka
Czasopismo:
Methods (rok: 2016, tom: x, strony: x), Wydawca: ELSEVIER
Ty1 retrovirus-like element Gag contains overlapping restriction factor and nucleic acid chaperone functions IF: 9,112
Autorzy:
Yuri Nishida, Katarzyna Pachulska-Wieczorek, Leszek Błaszczyk, Agniva Saha, Julita Gumna, David J. Garfinkel, and Katarzyna J. Purzycka
Czasopismo:
Nucleic Acids Res. (rok: 2015, tom: 43, strony: 7414-7431), Wydawca: OXFORD PRESS
Building the library of RNA 3D nucleotide conformations using the clustering approach IF: 1,284
Autorzy:
Tomasz Zok, Maciej Antczak, Martin Riedel, David Nebel, Thomas Villmann, Piotr Lukasiak, Jacek Blazewicz, Marta Szachniuk
Czasopismo:
Int. J. Appl. Math. Comput. Sci. (rok: 2015, tom: Vol. 25, No. 3, strony: 689–700), Wydawca: DE GRUYTER
New in silico approach to assessing RNA secondary structures with non-canonical base pairs IF: 2,576
Autorzy:
Agnieszka Rybarczyk, Natalia Szostak, Maciej Antczak, Tomasz Zok, Mariusz Popenda, Ryszard Adamiak, Jacek Blazewicz and Marta Szachniuk
Czasopismo:
BMC Bioinformatics (rok: 2015, tom: 16, strony: 267), Wydawca: BioMedCentral
RNAssess––a web server for quality assessment of RNA 3D structures IF: 9,112
Autorzy:
Piotr Lukasiak, Maciej Antczak, Tomasz Ratajczak, Marta Szachniuk, Mariusz Popenda, Ryszard W. Adamiak and Jacek Blazewicz
Czasopismo:
Nucleic Acids Res. (rok: 2015, tom: 43, strony: W502–W506), Wydawca: OXFORD PRESS
The matrix domain contributes to the nucleic acid chaperone activity of HIV‑2 Gag IF: 4,19
Autorzy:
Katarzyna Pachulska‑Wieczorek, Leszek Błaszczyk, Marcin Biesiada, Ryszard W. Adamiak and Katarzyna J. Purzycka
Czasopismo:
Retrovirology (rok: 2016, tom: 13, strony: 18), Wydawca: BioMedCentral
RNA-Puzzles Round II: assessment of RNA structure prediction programs applied to three large RNA structures IF: 4,605
Autorzy:
Miao, Zhichao; Adamiak, Ryszard W.; Blanchet, Marc-Frederick; et al.
Czasopismo:
RNA (rok: 2015, tom: 21(6), strony: 1066-1084), Wydawca: RNA Society
New functionality of RNAComposer: application to shape the axis of miR160 precursor structure IF: 1,463
Autorzy:
Maciej Antczak, Mariusz Popenda, Tomasz Żok, Joanna Sarzyńska, Tomasz Ratajczak, Ryszard W. Adamiak, Marta Szachniuk
Czasopismo:
Acta Biochimica Polonica (rok: 2016, tom: 63, zeszyt RNA, strony: xxx), Wydawca: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Similarities and differences in the nucleic acid chaperone activity of HIV-2 and HIV-1 nucleocapsid proteins in vitro IF: 4,77
Autorzy:
Katarzyna Pachulska-Wieczorek, Agnieszka K. Stefaniak, Katarzyna J. Purzycka
Czasopismo:
Retrovirology (rok: 2014, tom: e-11:54, strony: 54), Wydawca: BioMedCentral
A self‑encoded capsid derivative restricts Ty1 retrotransposition in Saccharomyces IF: 2,682
Autorzy:
David J. Garfinkel, Jessica M. Tucker, Agniva Saha, Yuri Nishida, Katarzyna Pachulska‑Wieczorek, Leszek Błaszczyk, Katarzyna J. Purzycka
Czasopismo:
Current Genet. (rok: 2015, tom: x, strony: xxx), Wydawca: Springer
RNApdbee--a webserver to derive secondary structures from pdb files of knotted and unknotted RNAs IF: 8,8
Autorzy:
Maciej Antczak, Tomasz Zok, Mariusz Popenda, Piotr Lukasiak, Ryszard W. Adamiak, Jacek Blazewicz and Marta Szachniuk
Czasopismo:
Nucleic Acids Res. (rok: 2014, tom: WebServerIssue, strony: W368-372), Wydawca: Oxford Press
RNA-Puzzles Round III: 3D RNA structure prediction of five riboswitches and one ribozyme IF: 4,605
Autorzy:
Miao, Zhichao; Adamiak, Ryszard W.; Antczak, Maciej; et al.
Czasopismo:
RNA (rok: 2017, tom: 23 (5), strony: 655-672), Wydawca: RNA Society
Personalization of structural PDB files IF: 1,59
Autorzy:
Tomasz Woźniak and Ryszard W. Adamiak
Czasopismo:
Acta Biochim. Pol. (rok: 2013, tom: 60(4), strony: 591-593), Wydawca: Polskie Towarzystwo Biochemiczne i Komitet Biochemii i Biofizyki PAN
RNAlyzer - novel approach for quality analysis of RNA structural models IF: 8,27
Autorzy:
Piotr Lukasiak, Maciej Antczak, Tomasz Ratajczak, Janusz M. Bujnicki, Marta Szachniuk, Mariusz Popenda, Ryszard W. Adamiak, Jacek Blazewicz
Czasopismo:
Nucl. Acids Res. (rok: 2013, tom: 41(12), strony: 5978-5990), Wydawca: Oxford Press