Strukturalna i funkcjonalna charakterystyka izomeraz peptydyloprolinowych - uniwersalnie konserwowanych białkowych katalizatorów fałdowania
2011/03/B/NZ1/02825
Słowa kluczowe
Deskryptory
- NZ1_1: Biologia molekularna
- NZ1_2: Biochemia
- NZ2_1: Genetyka molekularna
Panel
NZ1 – Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia
Jednostka realizująca
Politechnika Gdańska, Wydział Chemiczny
woj. pomorskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 5
Konkurs
OPUS 2 – ogłoszony 2011-09-15
- Przyznana kwota
- 453 511 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2012-08-02
- Zakończenie projektu
- 2015-08-01
- Planowany czas trwania projektu
- 36 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Sprzęt do rozdziału 2D do żeli IEF. Za kwotę 31 380 PLN
- autoklaw przenośny. Za kwotę 10 086 PLN
- blok termiczny z wytrząsaniem i vortex. Za kwotę 15 000 PLN
- inkubator. Za kwotę 15 000 PLN
- inkubator mikrobiologiczny z chłodzeniem.
- pH-metr.
- transiluminator UV z dwoma długościami fal. Za kwotę 5 332 PLN
- waga analityczna o wysokiej czujności.
- wirówka. Za kwotę 20 000 PLN
- wytrząsarka. Za kwotę 20 000 PLN
- wytrząsarka z regulacją temperaturą.
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (4)
-
Assembly of lipopolisaccharide in Escherichia coli requires the essential LapB heat shock protein
- Autorzy:
- Klein G, Kobylak N, Lindner B, Stupak A, Raina S
- Czasopismo:
- Journal of Biological Chemistry (rok: 2014, tom: 289, strony: 14829-14853), Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular Biology
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1074/jbc.M113.539494 – link do publikacji
-
Multiple transcriptional factors regulate transcription of the rpoE gene in Escherichia coli under different growth conditions and when the lipopolysaccharide biosynthesis is defective
- Autorzy:
- Klein G, Stupak A, Biernacka D, Wojtkiewicz P, Lindner B, Raina S
- Czasopismo:
- Journal of Biological Chemistry (rok: 2016, tom: 291, strony: 22999-23019), Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular Biology
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1074/jbc.M116.748954 – link do publikacji
-
Molecular and structural basis of inner core lipopolysaccharide alterations in Escherichia coli: incorporation of glucuronic acid and phosphoethanolamine in the heptose region
- Autorzy:
- Klein G, Müller-Loennies S, Lindner B, Kobylak N, Brade H, Raina S
- Czasopismo:
- Journal of Biological Chemistry (rok: 2013, tom: 288, strony: 8111-8127), Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular Biology
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1074/jbc.M112.445981 – link do publikacji
-
Regulated control of the assembly and diversity of LPS by non-coding sRNAs
- Autorzy:
- Klein G, Raina S
- Czasopismo:
- BioMed Research International (rok: 2015, tom: 2015, strony: 153561), Wydawca: Hindawi
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1155/2015/153561 – link do publikacji
Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (8)
-
Assembly of LPS: Essential role of new proteins LprA, LprB and a new sRNA slrA
- Autorzy:
- Raina S, Klein G
- Konferencja:
- EMBO/EMBL Symposium New Approaches and Concepts in Microbiology (rok: 2013, strony: 256), Wydawca: EMBO/EMBL
- Data:
- konferencja October 14-16
- Status:
- Opublikowana
-
Assembly of the outer membrane in Escherichia coli requires a new essential heat shock protein LapB and modulation by a new sRNA slrA
- Autorzy:
- Raina S, Klein G
- Konferencja:
- 3rd Mol Micro Meeting (rok: 2014, strony: 103), Wydawca: Institute for Molecular Infection Biology
- Data:
- konferencja May 7-9
- Status:
- Opublikowana
-
Outer membrane assembly by new chaperones LprA and LprB
- Autorzy:
- Raina S, Linder B, Klein G
- Konferencja:
- ESF-EMBO Symposium Bacterial Networks (bacnet 13) (rok: 2013, strony: 164), Wydawca: ESF Reserach Conferences
- Data:
- konferencja March 16-21
- Status:
- Opublikowana
-
Catalysis of protein folding by cytoplasmic peptidyl-prolyl isomerases
- Autorzy:
- Kobylak N, Klein G, Fischer G, Raina S
- Konferencja:
- ESF-EMBO Symposium Bacterial Networks (bacnet 13) (rok: 2013, strony: 119), Wydawca: ESF Reserach Conferences
- Data:
- konferencja March 16-21
- Status:
- Opublikowana
-
Transcriptional regulation of RpoE sigma factor - sensing of endotoxin alterations
- Autorzy:
- Klein G, Raina S
- Konferencja:
- ESF-EMBO Symposium Bacterial Networks (bacnet 13) (rok: 2013, strony: 117), Wydawca: ESF Reserach Conferences
- Data:
- konferencja March 16-21
- Status:
- Opublikowana
-
Functional characterization of cytoplasmic peptidyl isomerases: substrate identification and their recognition
- Autorzy:
- Klein G, Gorzelak P, Stupak A, Fischer G, Raina S
- Konferencja:
- EMBO Conference: The Biology of Molecular Chaperones (rok: 2015, strony: 49), Wydawca: EMBO
- Data:
- konferencja May 8-13
- Status:
- Opublikowana
-
New insights in the regulatory RNA mediated assembly of the outer membrane in Escherichia coli
- Autorzy:
- Raina S, Klein G
- Konferencja:
- 3rd Conference on Regulating with RNA in Bacteria (rok: 2013, strony: 161), Wydawca: Institute for Molecular Infection Biology
- Data:
- konferencja June 4-8
- Status:
- Opublikowana
-
Functional characterisation of cytoplasmic peptide-prolyl cis/trans isomerases in Escherichia coli
- Autorzy:
- Raina S, Klein G
- Konferencja:
- International Symposium of Research Centre for Thermotolerant Microbial Resources in Yamaguchi (rok: 2015, strony: brak), Wydawca: University of Yamaguchi, Japan
- Data:
- konferencja March 6-9
- Status:
- Opublikowana