Projekty finansowane przez NCN
Strukturalna i funkcjonalna charakterystyka izomeraz peptydyloprolinowych - uniwersalnie konserwowanych białkowych katalizatorów fałdowania
2011/03/B/NZ1/02825
Słowa kluczowe:
PPI-aza immunofiliny FKBP parwulina PpiD SlyD cyklofiliny syntetyczna letalność
Deskryptory:
- NZ1_1: Biologia molekularna
- NZ1_2: Biochemia
- NZ2_1: Genetyka molekularna
Panel:
NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia
Jednostka realizująca:
Politechnika Gdańska, Wydział Chemiczny
woj. pomorskie
Konkurs: OPUS 2 - ogłoszony 2011-09-15
Przyznana kwota: 453 511 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2012-08-01
Zakończenie projektu: 2015-08-01
Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- autoklaw przenośny. Za kwotę 10 086 PLN
- pH-metr.
- waga analityczna o wysokiej czujności.
- wytrząsarka. Za kwotę 20 000 PLN
- Sprzęt do rozdziału 2D do żeli IEF. Za kwotę 31 380 PLN
- blok termiczny z wytrząsaniem i vortex. Za kwotę 15 000 PLN
- inkubator mikrobiologiczny z chłodzeniem.
- inkubator. Za kwotę 15 000 PLN
- transiluminator UV z dwoma długościami fal. Za kwotę 5 332 PLN
- wirówka. Za kwotę 20 000 PLN
- wytrząsarka z regulacją temperaturą.
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (5)
- Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (8)
- Multiple transcriptional factors regulate transcription of the rpoE gene in Escherichia coli under different growth conditions and when the lipopolysaccharide biosynthesis is defectiveAutorzy:Klein G, Stupak A, Biernacka D, Wojtkiewicz P, Lindner B, Raina SCzasopismo:Journal of Biological Chemistry (rok: 2016, tom: 291, strony: 22999-23019), Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular BiologyStatus:OpublikowanaDoi:10.1074/jbc.M116.748954 - link do publikacji
- Molecular and structural basis of inner core lipopolysaccharide alterations in Escherichia coli: incorporation of glucuronic acid and phosphoethanolamine in the heptose regionAutorzy:Klein G, Müller-Loennies S, Lindner B, Kobylak N, Brade H, Raina SCzasopismo:Journal of Biological Chemistry (rok: 2013, tom: 288, strony: 8111-8127), Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular BiologyStatus:OpublikowanaDoi:10.1074/jbc.M112.445981 - link do publikacji
- Assembly of lipopolisaccharide in Escherichia coli requires the essential LapB heat shock proteinAutorzy:Klein G, Kobylak N, Lindner B, Stupak A, Raina SCzasopismo:Journal of Biological Chemistry (rok: 2014, tom: 289, strony: 14829-14853), Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular BiologyStatus:OpublikowanaDoi:10.1074/jbc.M113.539494 - link do publikacji
- Regulated control of the assembly and diversity of LPS by non-coding sRNAsAutorzy:Klein G, Raina SCzasopismo:BioMed Research International (rok: 2015, tom: 2015, strony: 153561), Wydawca: HindawiStatus:OpublikowanaDoi:10.1155/2015/153561 - link do publikacji
- Regulated structural alterations and the assembly of LPSAutorzy:Klein G, Gorzelak, P, Raina SCzasopismo:Molecular Microbiology , Wydawca: WileyStatus:ZłożonaDoi:brak - link do publikacji
- Assembly of LPS: Essential role of new proteins LprA, LprB and a new sRNA slrAAutorzy:Raina S, Klein GKonferencja:EMBO/EMBL Symposium New Approaches and Concepts in Microbiology (rok: 2013, ), Wydawca: EMBO/EMBLData:konferencja October 14-16Status:Opublikowana
- Functional characterisation of cytoplasmic peptide-prolyl cis/trans isomerases in Escherichia coliAutorzy:Raina S, Klein GKonferencja:International Symposium of Research Centre for Thermotolerant Microbial Resources in Yamaguchi (rok: 2015, ), Wydawca: University of Yamaguchi, JapanData:konferencja March 6-9Status:Opublikowana
- New insights in the regulatory RNA mediated assembly of the outer membrane in Escherichia coliAutorzy:Raina S, Klein GKonferencja:3rd Conference on Regulating with RNA in Bacteria (rok: 2013, ), Wydawca: Institute for Molecular Infection BiologyData:konferencja June 4-8Status:Opublikowana
- Catalysis of protein folding by cytoplasmic peptidyl-prolyl isomerasesAutorzy:Kobylak N, Klein G, Fischer G, Raina SKonferencja:ESF-EMBO Symposium Bacterial Networks (bacnet 13) (rok: 2013, ), Wydawca: ESF Reserach ConferencesData:konferencja March 16-21Status:Opublikowana
- Assembly of the outer membrane in Escherichia coli requires a new essential heat shock protein LapB and modulation by a new sRNA slrAAutorzy:Raina S, Klein GKonferencja:3rd Mol Micro Meeting (rok: 2014, ), Wydawca: Institute for Molecular Infection BiologyData:konferencja May 7-9Status:Opublikowana
- Functional characterization of cytoplasmic peptidyl isomerases: substrate identification and their recognitionAutorzy:Klein G, Gorzelak P, Stupak A, Fischer G, Raina SKonferencja:EMBO Conference: The Biology of Molecular Chaperones (rok: 2015, ), Wydawca: EMBOData:konferencja May 8-13Status:Opublikowana
- Transcriptional regulation of RpoE sigma factor - sensing of endotoxin alterationsAutorzy:Klein G, Raina SKonferencja:ESF-EMBO Symposium Bacterial Networks (bacnet 13) (rok: 2013, ), Wydawca: ESF Reserach ConferencesData:konferencja March 16-21Status:Opublikowana
- Outer membrane assembly by new chaperones LprA and LprBAutorzy:Raina S, Linder B, Klein GKonferencja:ESF-EMBO Symposium Bacterial Networks (bacnet 13) (rok: 2013, ), Wydawca: ESF Reserach ConferencesData:konferencja March 16-21Status:Opublikowana