Nowe metody określania struktury drugorzędowej RNA, ich funkcjonalność do badania aktywności biologicznej RNA.
2011/03/B/NZ1/00576
Słowa kluczowe
Deskryptory
- NZ1_4: Biologia strukturalna
- NZ1_6: Biologia syntetyczna
- NZ1_1: Biologia molekularna
Panel
NZ1 – Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia
Jednostka realizująca
Instytut Chemii Bioorganicznej PAN
woj. wielkopolskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 7
Konkurs
OPUS 2 – ogłoszony 2011-09-15
- Przyznana kwota
- 708 360 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2012-08-02
- Zakończenie projektu
- 2015-08-01
- Planowany czas trwania projektu
- 36 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Kaseta z ekranem do fosforimigera. Za kwotę 15 000 PLN
- Pompa olejowa wysokiej próżni. Za kwotę 9 000 PLN
- Termomikser z blokiem wymiennym. Za kwotę 14 000 PLN
- Wytrząsarka inkubowana. Za kwotę 60 000 PLN
- Zasilacz do elektroforezy wysokonapięciowej.. Za kwotę 9 000 PLN
- Zestaw komputerowy (komputer i monitor). Za kwotę 7 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (11)
-
Metal-promoted synthesis, characterization, crystal structure and RNA cleavage ability of 2,6-diacetylpyridine bis(2-aminobenzoylhydrazone) lanthanide complexes
- Autorzy:
- M. Kozlowski, R. Kierzek, M. Kubicki and W. Radecka-Paryzek
- Czasopismo:
- J. Inorgan. Biochem. (rok: 2013, tom: 126, strony: 38-45), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
-
Secondary Structure of a Conserved Domain in the Intron of Influenza A NS1 mRNA
- Autorzy:
- S.F. Priore, E. Kierzek, R. Kierzek, J.R. Baman; W.N. Moss; L.I. Dela-Moss, D.H. Turner
- Czasopismo:
- PLOS ONE (rok: 2013, tom: 8, strony: e70615), Wydawca: plos org
- Status:
- Opublikowana
-
Microarrays for identifying binding sites and probing structure of RNAs
- Autorzy:
- R. Kierzek, DH. Turner, E. Kierzek
- Czasopismo:
- Nucleic Acids Research (rok: 2015, tom: 43, strony: 46034), Wydawca: Oxford Univ. Press
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1093/nar/gku1303 – link do publikacji
-
The contribution of pseudouridine to stabilities and structure of RNAs.
- Autorzy:
- E. Kierzek, M.Malgowska, J. Lisowiec, D.H. Turner, Z. Gdaniec and R. Kierzek
- Czasopismo:
- Nucleic Acids Research (rok: 2014, tom: 42, strony: 3492-3501), Wydawca: Oxford University Press
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1093/nar/gkt1330 – link do publikacji
-
Structural determinants for alternative splicing regulation of the MAPT pre-mRNA
- Autorzy:
- J. Lisowiec, D. Magner, E. Kierzek, E. Lenartowicz, R. Kierzek
- Czasopismo:
- RNA Biology (rok: 2015, tom: 12, strony: 330-342), Wydawca: TAYLOR & FRANCIS INC
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1080/15476286.2015.1017214 – link do publikacji
-
Interplay of LNA and 2ʹ-O-Methyl RNA in the Structure and Thermodynamics of RNA Hybrid Systems: A Molecular Dynamics Study using the Revised AMBER Force Field and Comparison with Experimental Results
- Autorzy:
- I. Yildirim, E. Kierzek, R. Kierzek, G. Schatz
- Czasopismo:
- Journal Physical Chemistry B (rok: 2014, tom: 118, strony: 14177-14187), Wydawca: ACS Publications
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1021/jp506703g – link do publikacji
-
Ultrahigh-resolution crystal structures of Z-DNA in complex with Mn2+ and Zn2+ ions
- Autorzy:
- P. Drozdzal, M. Gilski, R. Kierzek, L. Lomozik and M. Jaskolski
- Czasopismo:
- Acta Crystallographica, section D (rok: 2013, tom: 69, strony: 1180-1190), Wydawca: IUCr
- Status:
- Opublikowana
-
Novel Conformation of an RNA structural switch
- Autorzy:
- S.D. Kennedy, R. Kierzek, D.H. Turner
- Czasopismo:
- Biochemistry (rok: 2012, tom: 51, strony: 9257-9259), Wydawca: ACS
- Status:
- Opublikowana
-
High-resolution crystal structure of Z-DNA in complex with Cr3+ cations
- Autorzy:
- P. Drozdzal, M. Gilski, R. Kierzek, L. Lomozik, M. Jaskolski
- Czasopismo:
- Journal of Biological Inorganic Chemistry (rok: 2015, tom: 20, strony: 595-602), Wydawca: Springer
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1007/s00775-015-1247-5 – link do publikacji
-
Distinctive structural motifs of RNA G-quadruplexes composed of AGG, CGG and UGG trinucleotide repeats.
- Autorzy:
- M. Malgowska, D. Gudanis, R. Kierzek, E. Wyszko, V. Gabelica, Z. Gdaniec
- Czasopismo:
- Nucleic Acids Research (rok: 2014, tom: 42, strony: 10196-10207), Wydawca: Oxford University Press
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1093/nar/gku710 – link do publikacji
-
Recognition of RNA duplexes by chemically modified triplex-forming oligonucleotides
- Autorzy:
- Y. Zhou, E. Kierzek, Z.P. Loo, M. Antonio, Y.H. Yau, Y.W. Chuah, S. Geifman-Shochat, R. Kierzek and G. Chen
- Czasopismo:
- Nucleic Acids Research (rok: 2013, tom: 41, strony: 6664-6673), Wydawca: Oxford University Press
- Status:
- Opublikowana