Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Nowe metody określania struktury drugorzędowej RNA, ich funkcjonalność do badania aktywności biologicznej RNA.

2011/03/B/NZ1/00576

Słowa kluczowe:

struktura drugo- i trzeciorzędowa RNA metody mapowanie RNA chemia RNA RNA wirusa grypy,

Deskryptory:

  • NZ1_4: Biologia strukturalna
  • NZ1_6: Biologia syntetyczna
  • NZ1_1: Biologia molekularna

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

INSTYTUT CHEMII BIOORGANICZNEJ PAN

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Ryszard Kierzek 

Liczba wykonawców projektu: 7

Konkurs: OPUS 2 - ogłoszony 2011-09-15

Przyznana kwota: 708 360 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2012-08-02

Zakończenie projektu: 2015-08-01

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Wytrząsarka inkubowana. Za kwotę 60 000 PLN
  2. Pompa olejowa wysokiej próżni. Za kwotę 9 000 PLN
  3. Kaseta z ekranem do fosforimigera. Za kwotę 15 000 PLN
  4. Zestaw komputerowy (komputer i monitor). Za kwotę 7 000 PLN
  5. Termomikser z blokiem wymiennym. Za kwotę 14 000 PLN
  6. Zasilacz do elektroforezy wysokonapięciowej.. Za kwotę 9 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (11)
  1. High-resolution crystal structure of Z-DNA in complex with Cr3+ cations
    Autorzy:
    P. Drozdzal, M. Gilski, R. Kierzek, L. Lomozik, M. Jaskolski
    Czasopismo:
    Journal of Biological Inorganic Chemistry (rok: 2015, tom: 20, strony: 595-602), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00775-015-1247-5 - link do publikacji
  2. Microarrays for identifying binding sites and probing structure of RNAs
    Autorzy:
    R. Kierzek, DH. Turner, E. Kierzek
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2015, tom: 43, strony: 45303), Wydawca: Oxford Univ. Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gku1303 - link do publikacji
  3. Novel Conformation of an RNA structural switch
    Autorzy:
    S.D. Kennedy, R. Kierzek, D.H. Turner
    Czasopismo:
    Biochemistry (rok: 2012, tom: 51, strony: 9257-9259), Wydawca: ACS
    Status:
    Opublikowana
  4. Recognition of RNA duplexes by chemically modified triplex-forming oligonucleotides
    Autorzy:
    Y. Zhou, E. Kierzek, Z.P. Loo, M. Antonio, Y.H. Yau, Y.W. Chuah, S. Geifman-Shochat, R. Kierzek and G. Chen
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2013, tom: 41, strony: 6664-6673), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
  5. Ultrahigh-resolution crystal structures of Z-DNA in complex with Mn2+ and Zn2+ ions
    Autorzy:
    P. Drozdzal, M. Gilski, R. Kierzek, L. Lomozik and M. Jaskolski
    Czasopismo:
    Acta Crystallographica, section D (rok: 2013, tom: 69, strony: 1180-1190), Wydawca: IUCr
    Status:
    Opublikowana
  6. Distinctive structural motifs of RNA G-quadruplexes composed of AGG, CGG and UGG trinucleotide repeats.
    Autorzy:
    M. Malgowska, D. Gudanis, R. Kierzek, E. Wyszko, V. Gabelica, Z. Gdaniec
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2014, tom: 42, strony: 10196-10207), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gku710 - link do publikacji
  7. Interplay of LNA and 2ʹ-O-Methyl RNA in the Structure and Thermodynamics of RNA Hybrid Systems: A Molecular Dynamics Study using the Revised AMBER Force Field and Comparison with Experimental Results
    Autorzy:
    I. Yildirim, E. Kierzek, R. Kierzek, G. Schatz
    Czasopismo:
    Journal Physical Chemistry B (rok: 2014, tom: 118, strony: 14177-14187), Wydawca: ACS Publications
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/jp506703g - link do publikacji
  8. Structural determinants for alternative splicing regulation of the MAPT pre-mRNA
    Autorzy:
    J. Lisowiec, D. Magner, E. Kierzek, E. Lenartowicz, R. Kierzek
    Czasopismo:
    RNA Biology (rok: 2015, tom: 12, strony: 330-342), Wydawca: TAYLOR & FRANCIS INC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1080/15476286.2015.1017214 - link do publikacji
  9. Secondary Structure of a Conserved Domain in the Intron of Influenza A NS1 mRNA
    Autorzy:
    S.F. Priore, E. Kierzek, R. Kierzek, J.R. Baman; W.N. Moss; L.I. Dela-Moss, D.H. Turner
    Czasopismo:
    PLOS ONE (rok: 2013, tom: 8, strony: e70615), Wydawca: plos org
    Status:
    Opublikowana
  10. The contribution of pseudouridine to stabilities and structure of RNAs.
    Autorzy:
    E. Kierzek, M.Malgowska, J. Lisowiec, D.H. Turner, Z. Gdaniec and R. Kierzek
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2014, tom: 42, strony: 3492-3501), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkt1330 - link do publikacji
  11. Metal-promoted synthesis, characterization, crystal structure and RNA cleavage ability of 2,6-diacetylpyridine bis(2-aminobenzoylhydrazone) lanthanide complexes
    Autorzy:
    M. Kozlowski, R. Kierzek, M. Kubicki and W. Radecka-Paryzek
    Czasopismo:
    J. Inorgan. Biochem. (rok: 2013, tom: 126, strony: 38-45), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana