Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki wnioskującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Gruboziarnista dynamika molekularna termometrów RNA w podwyższonej temperaturze

2011/03/N/NZ2/02482

Słowa kluczowe:

termometry RNA gruboziarniste pole siłowe algorytmy ewolucyjne dynamika molekularna

Deskryptory:

  • NZ2_10: Modelowanie i symulacje biologiczne
  • NZ1_3: Biofizyka
  • ST6_8: Systemy inteligentne

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna, m.in.:

Jednostka wnioskująca:

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki wnioskującej):

mgr Filip Karol Leonarski 

Liczba wykonawców projektu: 3

Konkurs: PRELUDIUM 2 - ogłoszony 2011-09-15

Przyznana kwota: 250 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2012-09-18

Czas trwania projektu: 24 miesięcy

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Licencja MS Office Pro 2010. Za kwotę 0 PLN
  2. Licencja Adobe Acrobat Pro PL. Za kwotę 0 PLN
  3. Licencja Adobe Illustrator CS6. Za kwotę 0 PLN
  4. Moduł USB do zbierania danych z czujnikiem wilgotności. Za kwotę 0 PLN
  5. Laptop Inspiron 5523. Za kwotę 5 600 PLN
  6. Licencja Symantec Endpoint Protection. Za kwotę 0 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (2)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. Evolutionary Algorithm in the Optimization of a Coarse-Grained Force Field IF: 5,389
    Autorzy:
    Filip Leonarski, Fabio Trovato, Valentina Tozzini, Andrzej Leś, Joanna Trylska
    Czasopismo:
    Journal of Chemical Theory and Computation (rok: 2013, tom: 9, strony: 4874-4889), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowane
    Doi:
    10.1021/ct4005036 - link do publikacji
  2. RedMDStream: Parameterization and Simulation Toolbox for Coarse-Grained Molecular Dynamics Models IF: 3,972
    Autorzy:
    Filip Leonarski, Joanna Trylska
    Czasopismo:
    Biophysical Journal (rok: 2015, tom: 108, strony: 1843-1847), Wydawca: Cell Press
    Status:
    Opublikowane
    Doi:
    10.1016/j.bpj.2015.03.023 - link do publikacji
  1. Modeling Nucleic Acids at the Residue-Level Resolution
    Autorzy:
    Filip Leonarski, Joanna Trylska
    Książka:
    Computational Methods to Study the Structure and Dynamics of Biomolecules and Biomolecular Processes From Bioinformatics to Molecular Quantum Mechanics (rok: 2013, tom: 1, strony: 109-149), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowane