Projekty finansowane przez NCN
Przewidywanie punktu izoelektrycznego białek i peptydów na podstawie cech sekwencyjnych i strukturalnych
2018/29/B/NZ2/01403
Słowa kluczowe:
bioinformatyka proteomika uczenie maszynowe punkt izoelektryczny uczenie głebokie deep learning
Deskryptory:
- NZ2_7: Bioinformatyka
- NZ2_3: Proteomika
- ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
Panel:
NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca:
Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki
woj. mazowieckie
Konkurs: OPUS 15 - ogłoszony 2018-03-15
Przyznana kwota: 662 170 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2019-01-10
Zakończenie projektu: 2022-01-09
Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- Oprogramowanie: MS Office (3 szt.). Za kwotę 300 PLN
- Komputer stacjonarny dla kierownika grantu. Za kwotę 1 102 PLN
- Laptop. Za kwotę 5 000 PLN
- Serwer obliczeniowy. Za kwotę 50 000 PLN
- Komputer stacjonarny (student 1 & 2) (2 szt.). Za kwotę 8 000 PLN
- Oprogramowanie: Endnote X8. Za kwotę 950 PLN
- Oprogramowanie: Windows 10 (3 szt.). Za kwotę 300 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (2)
- Proteome-pI 2.0: proteome isoelectric point database updateAutorzy:Lukasz Pawel KozlowskiCzasopismo:Nucleic Acids Research (rok: 2022, tom: 50, strony: D1535–D1540), Wydawca: Oxford University PressStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/nar/gkab944 - link do publikacji
- IPC 2.0: prediction of isoelectric point and pKa dissociation constantsAutorzy:Lukasz Pawel KozlowskiCzasopismo:Nucleic Acids Research (rok: 2021, tom: 49, strony: W285–W292), Wydawca: Oxford University PressStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/nar/gkab295 - link do publikacji