Projects funded by the NCN


Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

The role of cell junctions and basal laminae in sexual differentiation of gonads in Xenopus laevis and mouse

2013/11/D/NZ3/00184

Keywords:

testes ovaries cell junctions basal laminae

Descriptors:

  • NZ3_13: Developmental biology in animals

Panel:

NZ3 - Cellular and developmental biology: cell biology, developmental biology, ageing biology, neurobiology

Host institution :

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Biologii i Nauk o Ziemi

woj. małopolskie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

dr Rafał Piprek 

Number of co-investigators in the project: 3

Call: SONATA 6 - announced on 2013-09-16

Amount awarded: 646 406 PLN

Project start date (Y-m-d): 2014-07-11

Project end date (Y-m-d): 2017-07-10

Project duration:: 36 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Equipment purchased [PL]

  1. Thermomixer C Eppendorf.
  2. Waga analityczna Axis AGN200C.
  3. Zestaw pipet automatycznych.
  4. Kamera mikroskopowa CCD 5MP Opta-Tech z oprogramowaniem OptaView IS do dokumentacji i analizy obrazów mikroskopwych (13 600 PLN)
  5. Multicooker.
  6. Termometr elektroniczny do cieczy ETS-D5 (1 400 PLN)
  7. Waga analityczna Ohaus Discovery DV215CDM (14 500 PLN)
  8. Wymienne termobloki do Thermomixera Comfort Eppendorf (3 szt.) (9 000 PLN)
  9. 2 butle CO2.
  10. Aparat do elektroforezy poziomej GCSGU-2626T-02 (3 500 PLN)
  11. Mieszadło magnetyczne z płytą grzejną C-MAG HS 7 (2 200 PLN)
  12. Thermoblok do hybrydyzacji in situ (hybrydyzator) firmy Eppendorf (3 500 PLN)
  13. Zestaw do fluorescencji do mikroskopu Nikon E-600.
  14. Dysk twardy.
  15. Komora laminarna.
  16. Mieszadło Vortex1 (Witko) (1 300 PLN)
  17. Mieszadło magnetyczne z płytą grzejną C-MAG HS7 i z termometrem elektronicznym do cieczy ETS-D5.
  18. Termostatowany blat grzejny typu TBG-993.
  19. Thermomixer Comfort Eppendorf (10 000 PLN)
  20. Wytrząsarka.
  21. Inkubator CO2.
  22. Mikroskop fluorescencyjny Opta-Tech MN800FL (39 700 PLN)
  23. Wirówka mikrolitrowa Eppendorf 5424 z rotorem do kolumien (8 700 PLN)
  24. Wymienny termoblok do Thermomixera C Eppendorf.

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (6)
  • Articles in post-conference publications (3)
  • Book publications / chapters in book publications (1)
  1. Cell adhesion molecules expression pattern indicates that somatic cells arbitrate gonadal sex of differentiating bipotential fetal mouse gonad
    Authors:
    Rafal P. Piprek, Michal Kolasa, Dagmara Podkowa, Malgorzata Kloc, Jacek Z. Kubiak
    Academic press:
    Mechanisms of Development (rok: 2017, tom: 147, strony: 17-27), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.mod.2017.07.001 - link to the publication
  2. Transcriptome analysis identifies genes involved in sex determination and development of Xenopus laevis gonads
    Authors:
    Rafał P. Piprek, Milena Damulewicz, Małgorzata Kloc, Jacek Z. Kubiak
    Academic press:
    Differentiation (rok: 2019, tom: 100, strony: 46-56), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.diff.2018.02.004 - link to the publication
  3. Transcriptome profiling reveals male- and female-specific gene expression pattern and novel gene candidates for the control of sex determination and gonad development in Xenopus laevis
    Authors:
    Rafał P. Piprek, Milena Damulewicz, Jean-Pierre Tassan, Małgorzata Kloc, Jacek Z. Kubiak
    Academic press:
    Development Genes and Evolution (rok: 2019, tom: 229, strony: 53-72), Wydawca: Springer
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1007/s00427-019-00630-y. - link to the publication
  4. Development of Xenopus laevis bipotential gonads into testis or ovary is driven by sex-specific cell-cell interactions, proliferation rate, cell migration and deposition of extracellular matrix
    Authors:
    Rafał P. Piprek, Malgorzata Kloc, Jean-Pierre Tassan, Jacek Z. Kubiak
    Academic press:
    Developmental Biology (rok: 2017, tom: 432, strony: 298-310), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
  5. Transcriptional profiling validates involvement of extracellular matrix and proteinases genes in mouse gonad development
    Authors:
    Rafal P. Piprek, Michal Kolasa, Dagmara Podkowa, Malgorzata Kloc, Jacek Z. Kubiak
    Academic press:
    Machanisms of Development (rok: 2018, tom: 149, strony: 45554), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.mod.2017.11.001 - link to the publication
  6. Matrix metalloproteinase-dependent regulation of extracellular matrix shapes the structure of sexually differentiating mouse gonads
    Authors:
    Rafał P. Piprek, Małgorzata Kloc, Jacek Z. Kubiak
    Academic press:
    Differentiation (rok: 2019, tom: 106, strony: 23-34), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.diff.2019.01.006 - link to the publication
  1. Global analysis of cell adhesion genes in sexually differentiating gonads of mouse.
    Authors:
    Piprek RP, Podkowa D, Kubiak JZ
    Conference:
    XXXII Konferencja Embriologiczna (rok: 2016, ), Wydawca: Acta Biologica Cracoviensia
    Data:
    konferencja maj 2016
    Status:
    Published
  2. Cell Proliferation and Migration During Gonad Development in Aanuran Amphibians
    Authors:
    Rafal P. Piprek, Anna Pecio, Jacek Z. Kubiak and Jacek M. Szymura
    Conference:
    Seventh International Symposium on Vertebrate Sex Determination (rok: 2015, ), Wydawca: Hawaiian Society of Zoology
    Data:
    konferencja 13-17 kwietnia
    Status:
    Published
  3. Adhezja komórkowa w rozwoju gonad – wykorzystanie sortowania komórek myszy transgenicznych w badanich transkryptomu
    Authors:
    Piprek RP, Kloc M, Kubiak JZ
    Conference:
    III Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Biologii Medycznej (rok: 2017, ), Wydawca: Polskie Towarzystwo Biologii Medycznej
    Data:
    konferencja lipiec 2017
    Status:
    Published
  1. Early Development of the Gonads – Origin and Differentiation of the Somatic Cells of the Genital Ridges
    Authors:
    Piprek RP, Kloc M, Kubiak JZ
    Book:
    Molecular Mechanisms of Cell Differentiation in Developing Gonads (rok: 2016, tom: 58, strony: 14427), Wydawca: Springer
    Status:
    Published