Projects funded by the NCN

Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

Methods of gene rearrangements (fusion transcripts) detection in papillary thyroid carcinoma, using transcriptome next generation sequencing.

2011/03/N/NZ2/03495

Keywords:

thyroid cancer sequencing transcriptome rearrangements

Descriptors:

  • NZ2_2: Genomics, transcriptomics, epigenomics
  • NZ2_7: Bioinformatics

Panel:

NZ2 - Genetics, genomics: molecular genetics, genomics, proteomics, bioinformatics, systems biology, genetic epidemiology

Host institution :

Centrum Onkologii - Instytut im. Marii Skłodowskiej-Curie, Oddział w Gliwicach

woj. mazowieckie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

Aleksandra Pfeifer 

Number of co-investigators in the project: 3

Call: PRELUDIUM 2 - announced on 2011-09-15

Amount awarded: 227 105 PLN

Project start date (Y-m-d): 2012-09-21

Project end date (Y-m-d): 2016-04-20

Project duration:: 43 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Equipment purchased [PL]

  1. komputer przenośny (5 000 PLN)

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (1)
  • Articles in post-conference publications (3)
  1. Somatic mutation profiling of follicular thyroid cancer by next generation sequencing.
    Authors:
    Swierniak M, Pfeifer A, Stokowy T, Rusinek D, Chekan M, Lange D, Krajewska J, Oczko-Wojciechowska M, Czarniecka A, Jarzab M, Jarzab B, Wojtas B.
    Academic press:
    Molecular and Cellular Endocrinology (rok: 2016, tom: 433, strony: 130–137), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.mce.2016.06.007 - link to the publication
  1. Algorithms for fusion transcripts detection in RNA-seq data - comparison and improvement (streszczenie prezentacji plakatowej)
    Authors:
    Pfeifer Aleksandra, Jarzab Barbara, Polanska Joanna
    Conference:
    13th European Conference on Computational Biology (ECCB) (rok: 2014, ), Wydawca: -
    Data:
    konferencja 7-10.09.2014
    Status:
    Published
    DOI:
    link to the publication
  2. Detection of genome rearrangements in papillary thyroid cancer
    Authors:
    Pfeifer A, Rusinek D, Zebracka-Gala J, Tyszkiewicz T, Polanska J, Jarzab B
    Conference:
    23rd Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology / 14th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB) (rok: 2015, ), Wydawca: -
    Data:
    konferencja 10-14 lipca 2015
    Status:
    Published
    DOI:
    link to the publication
  3. Detekcja rearanżacji genów w raku brodawkowatym tarczycy, przy użyciu masywnie równoległego sekwencjonowania transkryptomu (Detection of gene rearrangments in papillary thyroid carcinoma using RNA-seq).
    Authors:
    Aleksandra Pfeifer, Dagmara Rusinek, Jadwiga Żebracka-Gala, Tomasz Tyszkiewicz, Joanna Polańska, Barbara Jarząb.
    Conference:
    V Konferencja Rak Tarczycy i inne nowotwory złośliwe układu wydzielania wewnętrznego (rok: 2015, ), Wydawca: Via Medica
    Data:
    konferencja 14-17.11.2015
    Status:
    Published
    DOI:
    link to the publication

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy