Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Metody wykrywania rearanżacji genów (transkryptów fuzyjnych) w raku brodawkowatym tarczycy, przy użyciu masywnie równoległego sekwencjonowania transkryptomu.

2011/03/N/NZ2/03495

Słowa kluczowe:

rak tarczycy sekwencjonowanie transkryptom rearanżacje

Deskryptory:

  • NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
  • NZ2_7: Bioinformatyka

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna, m.in.:

Jednostka realizująca:

Centrum Onkologii - Instytut im. Marii Skłodowskiej-Curie, Oddział w Gliwicach

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

Aleksandra Pfeifer 

Liczba wykonawców projektu: 3

Konkurs: PRELUDIUM 2 - ogłoszony 2011-09-15

Przyznana kwota: 227 105 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2012-09-21

Czas trwania projektu: 36 miesięcy

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. komputer przenośny. Za kwotę 5 000 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (1)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (3)
  1. Somatic mutation profiling of follicular thyroid cancer by next generation sequencing. IF: 3,859
    Autorzy:
    Swierniak M, Pfeifer A, Stokowy T, Rusinek D, Chekan M, Lange D, Krajewska J, Oczko-Wojciechowska M, Czarniecka A, Jarzab M, Jarzab B, Wojtas B.
    Czasopismo:
    Molecular and Cellular Endocrinology (rok: 2016, tom: 433, strony: 130–137), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowane
    Doi:
    10.1016/j.mce.2016.06.007 - link do publikacji
  1. Detekcja rearanżacji genów w raku brodawkowatym tarczycy, przy użyciu masywnie równoległego sekwencjonowania transkryptomu (Detection of gene rearrangments in papillary thyroid carcinoma using RNA-seq).
    Autorzy:
    Aleksandra Pfeifer, Dagmara Rusinek, Jadwiga Żebracka-Gala, Tomasz Tyszkiewicz, Joanna Polańska, Barbara Jarząb.
    Konferencja:
    V Konferencja Rak Tarczycy i inne nowotwory złośliwe układu wydzielania wewnętrznego (rok: 2015, ), Wydawca: Via Medica
    Data:
    konferencja 14-17.11.2015
    Status:
    Opublikowane
  2. Algorithms for fusion transcripts detection in RNA-seq data - comparison and improvement (streszczenie prezentacji plakatowej)
    Autorzy:
    Pfeifer Aleksandra, Jarzab Barbara, Polanska Joanna
    Konferencja:
    13th European Conference on Computational Biology (ECCB) (rok: 2014, ), Wydawca: -
    Data:
    konferencja 7-10.09.2014
    Status:
    Opublikowane
  3. Detection of genome rearrangements in papillary thyroid cancer
    Autorzy:
    Pfeifer A, Rusinek D, Zebracka-Gala J, Tyszkiewicz T, Polanska J, Jarzab B
    Konferencja:
    23rd Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology / 14th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB) (rok: 2015, ), Wydawca: -
    Data:
    konferencja 10-14 lipca 2015
    Status:
    Opublikowane