Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Badanie własności konformacyjnych i termodynamicznych ludzkiego rybosomalnego miejsca A i jego oddziaływań z antybiotykami aminoglikozydowymi z wykorzystaniem metod modelowania molekularnego.

2011/01/N/NZ1/01558

Słowa kluczowe:

antybiotyki aminoglikozydowe własności fizykochemiczne RNA modelowanie biomolekularne biofizyka teoretyczna

Deskryptory:

  • NZ1_1: Biologia molekularna
  • NZ1_3: Biofizyka
  • NZ2_8: Biologia obliczeniowa

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia, m.in.:

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Interdyscyplinarne Centrum Modelowania Matematycznego i Komputerowego

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

mgr Joanna Panecka 

Liczba wykonawców projektu: 2

Konkurs: PRELUDIUM 1 - ogłoszony 2011-03-15

Przyznana kwota: 57 750 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2011-12-06

Czas trwania projektu: 15 miesięcy

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. wielordzeniowa stacja robocza. Za kwotę 4 600 PLN
  2. komputer przenośny. Za kwotę 2 730 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (3)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (1)
  1. Role of S-turn2 in the Structure, Dynamics, and Function of Mitochondrial Ribosomal A-Site. A Bioinformatics and Molecular Dynamics Simulation Study IF: 3,302
    Autorzy:
    Joanna Panecka, Marek Havrila, Kamila Réblová, Jiri Šponer, Joanna Trylska
    Czasopismo:
    Journal of Physical Chemistry B (rok: 2014, tom: 118, strony: 6687-6701), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowane
    Doi:
    10.1021/jp5030685 - link do publikacji
  2. Interplay of the Bacterial Ribosomal A-Site, S12 Protein Mutations and Paromomycin Binding: A Molecular Dynamics Study IF: 3,234
    Autorzy:
    Joanna Panecka, Cameron Mura, Joanna Trylska
    Czasopismo:
    PLOS ONE (rok: 2014, tom: 9, strony: e111811), Wydawca: Public Library of Science
    Status:
    Opublikowane
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0111811 - link do publikacji
  3. Conformational dynamics of bacterial and human cytoplasmic models of the ribosomal A-site IF: 2,96
    Autorzy:
    Joanna Panecka, Jiří Šponer, Joanna Trylska
    Czasopismo:
    Biochimie (rok: 2015, tom: 112, strony: 96-110), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowane
    Doi:
    10.1016/j.biochi.2015.02.021 - link do publikacji
  1. Molecular Dynamics Techniques in the Studies of the Bacterial Ribosome
    Autorzy:
    Joanna Panecka, Joanna Trylska
    Konferencja:
    Theory and Applications of Computational Chemistry (TACC-2012) (rok: 2012, ), Wydawca: AIP Publishing LLC
    Data:
    konferencja 2-7.09.2012
    Status:
    Opublikowane